seq1 = pF1KB9682.tfa, 447 bp
seq2 = pF1KB9682/gi568815578f_31505388.tfa (gi568815578f:31505388_31705834), 200447 bp

>pF1KB9682 447
>gi568815578f:31505388_31705834 (Chr20)

1-447  (100001-100447)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAAGTCGCCAGTGGCAGCACCGCCACCGCCGCCGCGGGCCCCAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAAGTCGCCAGTGGCAGCACCGCCACCGCCGCCGCGGGCCCCAGCTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGCGCTGAAGGCCGGCAAGACAGCGAGCGGTGCGGGCGAGGTGGTGCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGCGCTGAAGGCCGGCAAGACAGCGAGCGGTGCGGGCGAGGTGGTGCGCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GTCTGTCTGAGCAGAGCGTGGCCATCTCGCGCTGCGCCGGGGGCGCCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GTCTGTCTGAGCAGAGCGTGGCCATCTCGCGCTGCGCCGGGGGCGCCGGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCGCGCCTGCCTGCCCTGCTGGACGAGCAGCAGGTAAACGTGCTGCTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCGCGCCTGCCTGCCCTGCTGGACGAGCAGCAGGTAAACGTGCTGCTCTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGACATGAACGGCTGTTACTCACGCCTCAAGGAGCTGGTGCCCACCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGACATGAACGGCTGTTACTCACGCCTCAAGGAGCTGGTGCCCACCCTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCCAGAACCGCAAGGTGAGCAAGGTGGAGATTCTCCAGCACGTCATCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CCCAGAACCGCAAGGTGAGCAAGGTGGAGATTCTCCAGCACGTCATCGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TACATCAGGGACCTTCAGTTGGAGCTGAACTCGGAATCCGAAGTTGGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
 100301 TACATCAGGGACCTTCAGTTGGAGCTGAACTCGGAATCCGAAGTTGGAAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCCCGGGGGCCGAGGGCTGCCGGTCCGGGCTCCGCTCAGCACCCTCAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CCCCGGGGGCCGAGGGCTGCCGGTCCGGGCTCCGCTCAGCACCCTCAACG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    401 GCGAGATCAGCGCCCTGACGGCCGAGGTGAGATCCAGATCCGACCAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GCGAGATCAGCGCCCTGACGGCCGAGGTGAGATCCAGATCCGACCAC