seq1 = pF1KB9681.tfa, 420 bp
seq2 = pF1KB9681/gi568815575r_13614410.tfa (gi568815575r:13614410_13819963), 205554 bp

>pF1KB9681 420
>gi568815575r:13614410_13819963 (ChrX)

(complement)

1-93  (100001-100093)   97% ->
94-240  (103286-103432)   97% ->
241-324  (103877-103960)   98% ->
325-420  (105459-105554)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCTGGAAGCTTCTACTTTGTAATTGTTGGTCACCATGATAATCCAGT
        |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
 100001 ATGTCTGGGAGCTTCTACTTTGTAATTGTTGGCCACCATGATAATCCAGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTTTGAAATGGAGTTTTTGCCAGCTGGGAAGGCAGAATCCAAA       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 100051 TTTTGAAATGGAGTTTTTGCCAGCTGGGAAGGCAGAATCCAAAGTA...T

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     94   GACGACCATCGTCATCTGAACCAGTTCATAGCTCATGCTGCTCTCGAC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103284 AGGACGACCATCGTCATCTGAACCAGTTCATAGCTCATGCTGCTCTCGAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTCGTAGATGAGAACATGTGGCTGTCGAACAACATGTACTTGAAAACTGT
        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
 103334 CTCGTAGATGAGAACATGTGGCTATCGAACAACATGTACTTGAAAACTGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGACAAGTTCAACGAGTGGTTTGTGTCAGCATTTGTCACCGCGGGGCAT 
        ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||>
 103384 GGACAAGTTCAACGAGTGGTTTGTGTCGGCATTTGTCACTGCGGGGCATA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    241         ATGAGGTTTATTATGCTTCATGACATAAGACAAGAAGATGGA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103434 TC...CATATGAGGTTTATTATGCTTCATGACATAAGACAAGAAGATGGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ATAAAGAACTTCTTTACTGATGTTTATGATTTATATATAAAA        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| >>>...>>
 103919 ATAAAGAACTTCTTTACTGATGTTTATGATTTATATATAAAGGTA...TA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    325  TTTTCAATGAATCCATTTTATGAACCCAATTCTCCTATTCGATCAAGTG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105458 GTTTTCAATGAATCCATTTTATGAACCCAATTCTCCTATTCGATCAAGTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    374 CATTTGACAGAAAAGTTCAGTTTCTTGGGAAGAAACACCTTTTAAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105508 CATTTGACAGAAAAGTTCAGTTTCTTGGGAAGAAACACCTTTTAAGC