seq1 = pF1KB9673.tfa, 792 bp
seq2 = pF1KB9673/gi568815593r_69264991.tfa (gi568815593r:69264991_69465737), 200747 bp

>pF1KB9673 792
>gi568815593r:69264991_69465737 (Chr5)

(complement)

1-792  (100001-100792)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGTCTGGCAAGACGGCTTCTCCCAAGAGCATGCCGAAAGATGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGTCTGGCAAGACGGCTTCTCCCAAGAGCATGCCGAAAGATGCACA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GATGATGGCACAAATCCTGAAGGATATGGGGATTACAGAATATGAGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GATGATGGCACAAATCCTGAAGGATATGGGGATTACAGAATATGAGCCAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GAGTTATAAATCAGATGTTGGAGTTTGCCTTCCGATATGTGACCACAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GAGTTATAAATCAGATGTTGGAGTTTGCCTTCCGATATGTGACCACAATT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTAGATGATGCAAAAATTTATTCAAGCCATGCTAAGAAAGCTACTGTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTAGATGATGCAAAAATTTATTCAAGCCATGCTAAGAAAGCTACTGTTGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGCAGATGATGTGCGATTGGCAATCCAGTGCCGCGCTGATCAGTCTTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGCAGATGATGTGCGATTGGCAATCCAGTGCCGCGCTGATCAGTCTTTTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCTCTCCTCCCCCAAGAGATTTTTTATTAGATATTGCAAGGCAAAGAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CCTCTCCTCCCCCAAGAGATTTTTTATTAGATATTGCAAGGCAAAGAAAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CAAACCCCTTTGCCATTGATCAAGCCATATTCAGGTCCTAGGTTGCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CAAACCCCTTTGCCATTGATCAAGCCATATTCAGGTCCTAGGTTGCCACC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGATAGATACTGCTTAACAGCTCCAAACTATAGGCTGAAATCTTTACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TGATAGATACTGCTTAACAGCTCCAAACTATAGGCTGAAATCTTTACAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AAAAGGCATCAACTTCTGCGGGAAGAATAACAGTCCCGCGGTTAAGTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AAAAGGCATCAACTTCTGCGGGAAGAATAACAGTCCCGCGGTTAAGTGTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GGTTCAGTTACTAGCAGACCAAGTACTCCCACACTAGGCACACCAACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GGTTCAGTTACTAGCAGACCAAGTACTCCCACACTAGGCACACCAACCCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 ACAGACCATGTCTGTTTCAACTAAAGTAGGGACTCCCATGTCCCTCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 ACAGACCATGTCTGTTTCAACTAAAGTAGGGACTCCCATGTCCCTCACAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GTCAAAGGTTTACAGTACAGATGCCTACTTCTCAGTCTCCAGCTGTAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GTCAAAGGTTTACAGTACAGATGCCTACTTCTCAGTCTCCAGCTGTAAAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GCTTCAATTCCTGCAACCTCAGCAGTTCAGAATGTTCTGATTAATCCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GCTTCAATTCCTGCAACCTCAGCAGTTCAGAATGTTCTGATTAATCCATC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 ATTAATCGGGTCCAAAAACATTCTTATTACCACTAATATGATGTCATCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 ATTAATCGGGTCCAAAAACATTCTTATTACCACTAATATGATGTCATCAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AAAATACTGCCAATGAATCATCAAATGCATTGAAAAGAAAACGTGAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AAAATACTGCCAATGAATCATCAAATGCATTGAAAAGAAAACGTGAAGAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GATGATGATGACGATGATGATGATGATGACTATGATAATCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GATGATGATGACGATGATGATGATGATGACTATGATAATCTG