seq1 = pF1KB9672.tfa, 1272 bp
seq2 = pF1KB9672/gi568815589r_122810801.tfa (gi568815589r:122810801_123012072), 201272 bp

>pF1KB9672 1272
>gi568815589r:122810801_123012072 (Chr9)

(complement)

1-1272  (100001-101272)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGCTGAGTCTGATGTTCTGCATTTCCAGTTTGAACAGCAAGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTGCTGAGTCTGATGTTCTGCATTTCCAGTTTGAACAGCAAGGAGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGTGGTCTTGCAGAAAATGAATCTTTTGAGACAGCAGAATTTATTTTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGTGGTCTTGCAGAAAATGAATCTTTTGAGACAGCAGAATTTATTTTGTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATGTATCAATTTACATTAATGACACTGAGTTCCAGGGGCACAAGGTGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ATGTATCAATTTACATTAATGACACTGAGTTCCAGGGGCACAAGGTGATT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTGGCTGCTTGCTCCACTTTTATGAGAGATCAGTTTTTACTCACACAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTGGCTGCTTGCTCCACTTTTATGAGAGATCAGTTTTTACTCACACAGTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AAAACATGTCAGAATCACCATCTTACAGAGTGCAGAAGTTGGCAGAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AAAACATGTCAGAATCACCATCTTACAGAGTGCAGAAGTTGGCAGAAAAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGTTACTGTCTTGCTATACTGGAGCACTTGAAGTTAAAAGGAAAGAGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGTTACTGTCTTGCTATACTGGAGCACTTGAAGTTAAAAGGAAAGAGCTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTGAAATACTTGACTGCTGCCAGTTACCTTCAGATGGTTCACATTGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTGAAATACTTGACTGCTGCCAGTTACCTTCAGATGGTTCACATTGTGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AAAGTGCACAGAAGCTTTGTCAAAGTATCTGGAAATTGATCTTTCTATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AAAGTGCACAGAAGCTTTGTCAAAGTATCTGGAAATTGATCTTTCTATGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AAAACAACAACCAACACACTGACCTGTGTCAGTCTTCTGATCCTGATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AAAACAACAACCAACACACTGACCTGTGTCAGTCTTCTGATCCTGATGTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AAGAATGAAGATGAAAATTCTGATAAAGACTGTGAGATAATTGAAATTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AAGAATGAAGATGAAAATTCTGATAAAGACTGTGAGATAATTGAAATTTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 AGAAGATAGTCCTGTAAACATAGATTTCCATGTTAAAGAAGAGGAAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 AGAAGATAGTCCTGTAAACATAGATTTCCATGTTAAAGAAGAGGAAAGCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ATGCTTTGCAGTCTACAGTAGAGAGTCTGACATCAGAGAGAAAGGAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ATGCTTTGCAGTCTACAGTAGAGAGTCTGACATCAGAGAGAAAGGAAATG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 AAGTCACCAGAGCTGTCTACAGTAGACATAGGTTTTAAAGACAATGAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 AAGTCACCAGAGCTGTCTACAGTAGACATAGGTTTTAAAGACAATGAAAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TTGTATCCTTCATGTAGAATCCATCAGTACAGCTGGTGTCGAAAATGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TTGTATCCTTCATGTAGAATCCATCAGTACAGCTGGTGTCGAAAATGGGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AGTTTTCACAGCCTTGTACCTCTTCAAAAGCAAGCATGTATTTCTCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AGTTTTCACAGCCTTGTACCTCTTCAAAAGCAAGCATGTATTTCTCTGAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 ACACAGCATTCATTGATCAATTCTACAGTTGAGAGCAGAGTGGCTGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 ACACAGCATTCATTGATCAATTCTACAGTTGAGAGCAGAGTGGCTGAAGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TCCTGGGAATCAAGATCAGGGCTTATTTTGTGAGAATACTGAAGGAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TCCTGGGAATCAAGATCAGGGCTTATTTTGTGAGAATACTGAAGGAAGTT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 ATGGTACAGTGAGTGAGATTCAGAATCTGGAGGAAGGTTATTCACTGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 ATGGTACAGTGAGTGAGATTCAGAATCTGGAGGAAGGTTATTCACTGAGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CACCAGTGCCCCAGGTGTCCTCGAGGCTTTCTTCATGTTGAAAACTATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CACCAGTGCCCCAGGTGTCCTCGAGGCTTTCTTCATGTTGAAAACTATCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GCGCCACCTTAAAATGCATAAACTATTCTTATGCTTACAGTGCGGAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GCGCCACCTTAAAATGCATAAACTATTCTTATGCTTACAGTGCGGAAAAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 CATTTACACAGAAGAAAAATCTCAACCGACACATCCGAGGACACATGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 CATTTACACAGAAGAAAAATCTCAACCGACACATCCGAGGACACATGGGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 ATACGGCCCTTTCAGTGTACTGTGTGCTTGAAGACATTTACTGCCAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 ATACGGCCCTTTCAGTGTACTGTGTGCTTGAAGACATTTACTGCCAAAAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 CACACTTCAGGACCACTTGAACATACACAGTGGGGATCGGCCATACAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 CACACTTCAGGACCACTTGAACATACACAGTGGGGATCGGCCATACAAAT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 GCCACTGTTGTGATATGGATTTCAAGCACAAGTCTGCTCTCAAAAAGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 GCCACTGTTGTGATATGGATTTCAAGCACAAGTCTGCTCTCAAAAAGCAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 TTAACCTCTGTCCATGGCAGAAGCAGTGGTGAAAAACTATCTAGGCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 TTAACCTCTGTCCATGGCAGAAGCAGTGGTGAAAAACTATCTAGGCCTGA

   1250     .    :    .    :
   1251 TCTCAAAAGGCAAAGTCTACTA
        ||||||||||||||||||||||
 101251 TCTCAAAAGGCAAAGTCTACTA