seq1 = pF1KB9670.tfa, 819 bp
seq2 = pF1KB9670/gi568815595r_114136256.tfa (gi568815595r:114136256_114337074), 200819 bp

>pF1KB9670 819
>gi568815595r:114136256_114337074 (Chr3)

(complement)

1-819  (100001-100819)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGCCCTAAACGCGATGGGTTGGGGACAGGTGATGGTCTGCACTCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGCCCTAAACGCGATGGGTTGGGGACAGGTGATGGTCTGCACTCACA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGTTTTACAGGAGCAGGTCTCCACAGGAGACAATCTCCATGAATGTGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGTTTTACAGGAGCAGGTCTCCACAGGAGACAATCTCCATGAATGTGACT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGCAGGGACCAAGTAAAGACACTTTGGTTCGTGAGGGGAAGACCTACAAA
        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCCAGGGACCAAGTAAAGACACTTTGGTTCGTGAGGGGAAGACCTACAAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TGCAAGGAATGTGGGAGCGTGTTTAACAAAAACAGCCTCCTTGTTCGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TGCAAGGAATGTGGGAGCGTGTTTAACAAAAACAGCCTCCTTGTTCGACA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TCAGCAGATTCACACTGGGGTGAAGCCTTATGAATGCCAGGAGTGTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TCAGCAGATTCACACTGGGGTGAAGCCTTATGAATGCCAGGAGTGTGGAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AAGCCTTTCCTGAAAAGGTCGACTTCGTTCGACCCATGAGGATTCACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AAGCCTTTCCTGAAAAGGTCGACTTCGTTCGACCCATGAGGATTCACACA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGGGAGAAGCCCTGTAAGTGCGTGGAGTGCGGGAAGGTCTTCAACCGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGGGAGAAGCCCTGTAAGTGCGTGGAGTGCGGGAAGGTCTTCAACCGCAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GTCGCACCTCCTGTGCTACCGCCAGATTCACACTGGAGAGAAGCCCTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GTCGCACCTCCTGTGCTACCGCCAGATTCACACTGGAGAGAAGCCCTATG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGTGCAGCGAGTGTGGAAAGACCTTCAGCTATCACTCTGTCTTCATCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGTGCAGCGAGTGTGGAAAGACCTTCAGCTATCACTCTGTCTTCATCCAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CATCGTGTGACCCACACTGGAGAAAAACTCTTTGGGTGCAAAGAATGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CATCGTGTGACCCACACTGGAGAAAAACTCTTTGGGTGCAAAGAATGTGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 AAAAACCTTTTACTACAACTCTTCCTTAACCCGGCACATGAAGATTCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 AAAAACCTTTTACTACAACTCTTCCTTAACCCGGCACATGAAGATTCACA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CTGGAGAGAAGCCCTGCAAGTGCAGTGAGTGCGGGAAGACCTTCACCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CTGGAGAGAAGCCCTGCAAGTGCAGTGAGTGCGGGAAGACCTTCACCTAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CACTCTGTTTTCTTCCGACATAGTATGACCCACACTGCAGGAAAGCCCTA
        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CGCTCTGTTTTCTTCCGACATAGTATGACCCACACTGCAGGAAAGCCCTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CGAGTGTAAAGAATGTGGGAAAGGTTTTTACTACAGCTATTCCCTCACTC
        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CGAGTGCAAAGAATGTGGGAAAGGTTTTTACTACAGCTATTCCCTCACTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GACATACAAGGAGTCACACTGGAGAGAAACCTTATGAGTGCCTTGAACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GACATACAAGGAGTCACACTGGAGAGAAACCTTATGAGTGCCTTGAACAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 AGAAAGGCCTTTGGCTACCACTCTGCTTTTGCCCAACAGAGTAAGATCCA
        ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 AGAAAGGACTTTGGCTACCACTCTGCTTTTGCCCAACAGAGTAAGATCCA

    800     .    :    .
    801 CTCTGGAGGAAAAAACCTT
        |||||||||||||||||||
 100801 CTCTGGAGGAAAAAACCTT