seq1 = pF1KB9669.tfa, 1467 bp
seq2 = pF1KB9669/gi568815579f_56521288.tfa (gi568815579f:56521288_56722754), 201467 bp

>pF1KB9669 1467
>gi568815579f:56521288_56722754 (Chr19)

1-1467  (100001-101467)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAAGAGTTGGATCCAAAGAATGACATTTCGGAAGACAAGCTCTCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAAGAGTTGGATCCAAAGAATGACATTTCGGAAGACAAGCTCTCCGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGTTGGGGAGGCCACGGGGGGACCCACGAGGAATGGTGCCAGGGGTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGTTGGGGAGGCCACGGGGGGACCCACGAGGAATGGTGCCAGGGGTCCTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCTCAGAAGGAGTGTGGGAACCAGGCAGCTGGCCAGAGAGGCCGCGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCTCAGAAGGAGTGTGGGAACCAGGCAGCTGGCCAGAGAGGCCGCGGGGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GATGCAGGTGCAGAGTGGGAGCCATTGGGAATTCCCCAGGGGAACAAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GATGCAGGTGCAGAGTGGGAGCCATTGGGAATTCCCCAGGGGAACAAACT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTTAGGGGGCTCAGTACCCGCATGTCATGAACTGAAGGCATTTGCCAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTTAGGGGGCTCAGTACCCGCATGTCATGAACTGAAGGCATTTGCCAACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AAGGCTGTGTCCTGGTCCCACCACGGCTGGACGACCCCACAGAAAAGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AAGGCTGTGTCCTGGTCCCACCACGGCTGGACGACCCCACAGAAAAGGGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GCCTGTCCACCCGTAAGGCGTGGCAAGAACTTCTCCAGCACTTCAGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GCCTGTCCACCCGTAAGGCGTGGCAAGAACTTCTCCAGCACTTCAGACCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CAGTAAGCCCCCCATGCCCTGCGAGGAGAAGAAAACCTACGACTGCAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CAGTAAGCCCCCCATGCCCTGCGAGGAGAAGAAAACCTACGACTGCAGCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGTGTGGCAAGGCCTTTAGCCGAAGCTCGTCCCTGATAAAGCACCAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGTGTGGCAAGGCCTTTAGCCGAAGCTCGTCCCTGATAAAGCACCAAAGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ATCCACACGGGAGAAAAGCCGTTTGAGTGTGACACCTGTGGGAAGCACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ATCCACACGGGAGAAAAGCCGTTTGAGTGTGACACCTGTGGGAAGCACTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CATCGAGCGCTCGTCCCTCACCATCCACCAGCGGGTGCACACGGGCGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CATCGAGCGCTCGTCCCTCACCATCCACCAGCGGGTGCACACGGGCGAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AGCCCTATGCCTGCGGGGACTGCGGCAAGGCCTTCAGCCAGCGCATGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AGCCCTATGCCTGCGGGGACTGCGGCAAGGCCTTCAGCCAGCGCATGAAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CTCACTGTGCACCAGCGCACGCACACGGGCGAGAAGCCGTATGTGTGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CTCACTGTGCACCAGCGCACGCACACGGGCGAGAAGCCGTATGTGTGCGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CGTGTGTGGCAAGGCCTTCCGGAAGACTTCCTCTCTCACCCAGCACGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CGTGTGTGGCAAGGCCTTCCGGAAGACTTCCTCTCTCACCCAGCACGAGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GGATCCACACGGGGGAGAAGCCCTACGCGTGCGGGGACTGCGGCAAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GGATCCACACGGGGGAGAAGCCCTACGCGTGCGGGGACTGCGGCAAGGCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TTCAGCCAGAACATGCACCTCATCGTGCACCAGCGCACGCACACCGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TTCAGCCAGAACATGCACCTCATCGTGCACCAGCGCACGCACACCGGGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GAAGCCGTACGTGTGCCCCGAGTGCGGGCGAGCCTTCAGCCAGAACATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GAAGCCGTACGTGTGCCCCGAGTGCGGGCGAGCCTTCAGCCAGAACATGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 ACCTGACCGAGCACCAGCGCACGCACACCGGGGAGAAGCCGTACGCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 ACCTGACCGAGCACCAGCGCACGCACACCGGGGAGAAGCCGTACGCCTGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 AAGGAGTGCGGCAAGGCCTTCAACAAGAGCTCCTCGCTCACCCTGCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AAGGAGTGCGGCAAGGCCTTCAACAAGAGCTCCTCGCTCACCCTGCACCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GAGGAACCACACCGGCGAGAAGCCCTACGTGTGCGGCGAGTGCGGCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GAGGAACCACACCGGCGAGAAGCCCTACGTGTGCGGCGAGTGCGGCAAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 CCTTCAGCCAGAGCTCCTACCTCATCCAGCACCAGCGCTTCCACATCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 CCTTCAGCCAGAGCTCCTACCTCATCCAGCACCAGCGCTTCCACATCGGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GTGAAGCCGTTCGAGTGCAGCGAGTGCGGCAAGGCCTTCAGCAAGAACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GTGAAGCCGTTCGAGTGCAGCGAGTGCGGCAAGGCCTTCAGCAAGAACTC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 CTCGCTCACGCAGCACCAGCGCATCCACACCGGCGAGAAGCCCTACGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 CTCGCTCACGCAGCACCAGCGCATCCACACCGGCGAGAAGCCCTACGAGT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 GCTACATCTGCAAGAAGCACTTCACGGGGCGCTCGTCCCTCATCGTGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 GCTACATCTGCAAGAAGCACTTCACGGGGCGCTCGTCCCTCATCGTGCAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 CAGATCGTGCACACCGGGGAGAAGCCCTACGTGTGCGGCGAGTGCGGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 CAGATCGTGCACACCGGGGAGAAGCCCTACGTGTGCGGCGAGTGCGGCAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 GGCCTTCAGCCAGAGCGCCTACCTCATCGAGCACCAGCGGATCCACACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 GGCCTTCAGCCAGAGCGCCTACCTCATCGAGCACCAGCGGATCCACACCG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 GCGAGAAGCCGTACAGGTGCGGCCAGTGCGGGAAGTCCTTCATCAAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 GCGAGAAGCCGTACAGGTGCGGCCAGTGCGGGAAGTCCTTCATCAAGAAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 TCCTCCCTCACTGTGCACCAGCGGATCCACACGGGCGAGAAGCCCTACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 TCCTCCCTCACTGTGCACCAGCGGATCCACACGGGCGAGAAGCCCTACCG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 ATGCGGCGAGTGCGGGAAGACCTTCAGCCGCAACACGAACCTGACGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 ATGCGGCGAGTGCGGGAAGACCTTCAGCCGCAACACGAACCTGACGCGCC

   1450     .    :    .
   1451 ACCTGCGGATTCACACC
        |||||||||||||||||
 101451 ACCTGCGGATTCACACC