seq1 = pF1KB9666.tfa, 1443 bp
seq2 = pF1KB9666/gi568815579f_7419504.tfa (gi568815579f:7419504_7620946), 201443 bp

>pF1KB9666 1443
>gi568815579f:7419504_7620946 (Chr19)

1-1443  (100001-101443)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCTTCGAGTTTCGACCTCGATCCAGATGTGATTGGCCCCGTACCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCTTCGAGTTTCGACCTCGATCCAGATGTGATTGGCCCCGTACCCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GATTCTCGATCCTAACAGCGACACCCTCAGCCCCGGCGATCCAAAAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GATTCTCGATCCTAACAGCGACACCCTCAGCCCCGGCGATCCAAAAGTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACCCCATCTCCTCTGGCCTCACTGCCACCCCCCAGGTCTTGGCCACCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACCCCATCTCCTCTGGCCTCACTGCCACCCCCCAGGTCTTGGCCACCAGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCCGCGGTGCTCCCCGCCCCCGCCAGCCCGCCCCGGCCCTTCTCCTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCCGCGGTGCTCCCCGCCCCCGCCAGCCCGCCCCGGCCCTTCTCCTGCCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGATTGCGGGCGAGCCTTCCGCCGCAGCTCCGGGCTGAGCCAGCATCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGATTGCGGGCGAGCCTTCCGCCGCAGCTCCGGGCTGAGCCAGCATCGCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCACGCACAGCGGCGAGAAGCCGTACCGCTGCCCCGACTGCGGGAAGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCACGCACAGCGGCGAGAAGCCGTACCGCTGCCCCGACTGCGGGAAGTCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTCAGCCACGGTGCCACCCTGGCTCAGCACCGTGGCATCCACACTGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTCAGCCACGGTGCCACCCTGGCTCAGCACCGTGGCATCCACACTGGGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCGGCCGTACCAGTGCGCGGCCTGCGGCAAGGCCTTCGGCTGGCGCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GCGGCCGTACCAGTGCGCGGCCTGCGGCAAGGCCTTCGGCTGGCGCTCCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CGCTGCTGAAACATCGCAGCAGCCACAGCGGGGAGAAGCCGCACCACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CGCTGCTGAAACATCGCAGCAGCCACAGCGGGGAGAAGCCGCACCACTGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CCGGTGTGTGGCAAGGCCTTCGGGCACGGCTCGCTCCTGGCACAGCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CCGGTGTGTGGCAAGGCCTTCGGGCACGGCTCGCTCCTGGCACAGCACCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GCGCACGCACGGCGGCCCGCGGCCCCACAAGTGCCCGGTGTGCGCCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GCGCACGCACGGCGGCCCGCGGCCCCACAAGTGCCCGGTGTGCGCCAAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GCTTCGGCCAGGGCTCTGCGCTGCTCAAACACCTGCGCACGCACACGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GCTTCGGCCAGGGCTCTGCGCTGCTCAAACACCTGCGCACGCACACGGGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GAGCGGCCCTACCCGTGTCCGCAGTGCGGCAAGGCCTTCGGGCAGAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GAGCGGCCCTACCCGTGTCCGCAGTGCGGCAAGGCCTTCGGGCAGAGCTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GGCGCTGCTGCAGCACCAGCGCACACACACGGCCGAGCGCCCCTACCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GGCGCTGCTGCAGCACCAGCGCACACACACGGCCGAGCGCCCCTACCGCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GCCCCCACTGCGGCAAAGCCTTCGGGCAGAGCTCCAACTTGCAACACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GCCCCCACTGCGGCAAAGCCTTCGGGCAGAGCTCCAACTTGCAACACCAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CTGCGCATCCACACGGGCGAGCGGCCCTACGCCTGCCCGCACTGCTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CTGCGCATCCACACGGGCGAGCGGCCCTACGCCTGCCCGCACTGCTCCAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GGCCTTCGGCCAGAGCTCAGCGCTGCTCCAGCACCTGCACGTGCATTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GGCCTTCGGCCAGAGCTCAGCGCTGCTCCAGCACCTGCACGTGCATTCGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 GCGAGCGTCCCTATCGCTGTCAGCTCTGCGGGAAGGCCTTCGGCCAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 GCGAGCGTCCCTATCGCTGTCAGCTCTGCGGGAAGGCCTTCGGCCAGGCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 TCCAGCCTCACCAAGCACAAACGGGTGCATGAGGGTGCAGCCGCTGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TCCAGCCTCACCAAGCACAAACGGGTGCATGAGGGTGCAGCCGCTGCTGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 AGCTGCCGCGGCCGCTGCAGCTGCAGCAGCGGCCGCCGGCCTGGGCCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 AGCTGCCGCGGCCGCTGCAGCTGCAGCAGCGGCCGCCGGCCTGGGCCTCG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 GGCCTGGCCTAAGCCCTGCATCCATGATGAGGCCGGGGCAGGTCTCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 GGCCTGGCCTAAGCCCTGCATCCATGATGAGGCCGGGGCAGGTCTCCCTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 CTGGGTCCTGATGCTGTTTCTGTGCTCGGCTCTGGCTTGGGCCTCAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 CTGGGTCCTGATGCTGTTTCTGTGCTCGGCTCTGGCTTGGGCCTCAGCCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 TGGCACCAGCTCTGGCCGCAACCCTGACCCTGGCTCTGGGCCGGGCACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 TGGCACCAGCTCTGGCCGCAACCCTGACCCTGGCTCTGGGCCGGGCACTC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 TGCCGGATCCCAGCTCCAAACCCCTCCCCGGCTCCAGATCCACCCCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 TGCCGGATCCCAGCTCCAAACCCCTCCCCGGCTCCAGATCCACCCCCAGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 CCTACTCCTGTGGAATCTTCTGACCCAAAGGCTGGGCACGACGCTGGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 CCTACTCCTGTGGAATCTTCTGACCCAAAGGCTGGGCACGACGCTGGTCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 CGACCTTGTGCCCAGCCCAGACCTTGATCCTGTGCCCAGCCCAGACCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 CGACCTTGTGCCCAGCCCAGACCTTGATCCTGTGCCCAGCCCAGACCCTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 ATCCTGTGCCCAGCCCTGATCCCAACCCTGTGTCCTGCCCTGACCCCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 ATCCTGTGCCCAGCCCTGATCCCAACCCTGTGTCCTGCCCTGACCCCTGT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 TCTCCCACTCGTGGCACTGTCAGCCCAGCCCTCCCTACCGGCGAGAGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 TCTCCCACTCGTGGCACTGTCAGCCCAGCCCTCCCTACCGGCGAGAGTCC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 AGAGTGGGTACAGGAGCAAGGGGCACTGCTGGGGCCTGATGGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 AGAGTGGGTACAGGAGCAAGGGGCACTGCTGGGGCCTGATGGC