seq1 = pF1KB9664.tfa, 1374 bp
seq2 = pF1KB9664/gi568815588r_43456706.tfa (gi568815588r:43456706_43658079), 201374 bp

>pF1KB9664 1374
>gi568815588r:43456706_43658079 (Chr10)

(complement)

1-1374  (100001-101374)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCAGTACAATTACTGGAAGTCAGGATTGTATTGTGAATCATCGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCAGTACAATTACTGGAAGTCAGGATTGTATTGTGAATCATCGAGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAAGTGGATGGGGAGCCTGAACTAGATATTTCCCCTTGTCAACAGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGAAGTGGATGGGGAGCCTGAACTAGATATTTCCCCTTGTCAACAGTGGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GAGAAGCATCTTCTCCTATTTCCAGAAACAGGGACAGTGTGATGACTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GAGAAGCATCTTCTCCTATTTCCAGAAACAGGGACAGTGTGATGACTCTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CAAAGTGGTTGTTTCGAAAACATTGAAAGTGAAACATATTTGCCTTTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CAAAGTGGTTGTTTCGAAAACATTGAAAGTGAAACATATTTGCCTTTGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AGTCTCAAGCCAAATAGACACACAAGACTCTTCAGTGAAGTTCTGTAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AGTCTCAAGCCAAATAGACACACAAGACTCTTCAGTGAAGTTCTGTAAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ATGAGCCTCAGGATCATCAGGAAAGCAGACGTCTCTTTGTAATGGAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ATGAGCCTCAGGATCATCAGGAAAGCAGACGTCTCTTTGTAATGGAAGAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AGCACTGAGAGAAAAGTGATAAAGGGGGAAAGTTGTTCAGAGAACCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AGCACTGAGAGAAAAGTGATAAAGGGGGAAAGTTGTTCAGAGAACCTTCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AGTTAAACTGGTGTCTGATGGACAAGAACTGGCCTCGCCATTGTTAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AGTTAAACTGGTGTCTGATGGACAAGAACTGGCCTCGCCATTGTTAAATG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GTGAGGCAACTTGCCAGAATGGCCAGTTAAAAGAATCTTTGGATCCCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GTGAGGCAACTTGCCAGAATGGCCAGTTAAAAGAATCTTTGGATCCCATT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GACTGTAACTGCAAAGACATTCATGGATGGAAATCACAGGTGGTCAGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GACTGTAACTGCAAAGACATTCATGGATGGAAATCACAGGTGGTCAGTTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TAGTCAGCAGAGAGGTCATACAGAGGAGAAACCCTGTGACCATAATAACT
        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TAGTCAGCAGAGAGCTCATACAGAGGAGAAACCCTGTGACCATAATAACT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GTGGGAAAATACTTAACACCAGCCCAGATGGTCATCCATATGAGAAAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GTGGGAAAATACTTAACACCAGCCCAGATGGTCATCCATATGAGAAAATC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CACACTGCAGAGAAACAATACGAAGGTAGTCAGTGTGGTAAGAACTTCAG
        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
 100601 CACACTGCAGAGAAACAATACGAATGTAGTCAGTGTGGTAAGAACTTCAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TCAAAGCTCAGAGCTACTACTTCATCAGAGAGACCACACAGAAGAAAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TCAAAGCTCAGAGCTACTACTTCATCAGAGAGACCACACAGAAGAAAAAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CCTACAAATGTGAGCAATGTGGGAAGGGCTTCACAAGGAGCTCGAGTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CCTACAAATGTGAGCAATGTGGGAAGGGCTTCACAAGGAGCTCGAGTCTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CTTATCCATCAGGCAGTCCACACAGATGAGAAGCCTTATAAGTGTGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CTTATCCATCAGGCAGTCCACACAGATGAGAAGCCTTATAAGTGTGACAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GTGTGGGAAGGGCTTCACCAGGAGCTCAAGTCTGCTCATCCATCATGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GTGTGGGAAGGGCTTCACCAGGAGCTCAAGTCTGCTCATCCATCATGCCG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TCCATACAGGCGAAAAACCTTATAAATGTGACAAGTGTGGGAAGGGCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TCCATACAGGCGAAAAACCTTATAAATGTGACAAGTGTGGGAAGGGCTTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 AGTCAGAGCTCCAAACTGCACATCCACCAGCGAGTCCACACTGGAGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AGTCAGAGCTCCAAACTGCACATCCACCAGCGAGTCCACACTGGAGAGAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GCCCTATGAGTGTGAGGAGTGTGGTATGAGCTTCAGTCAGCGCTCAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GCCCTATGAGTGTGAGGAGTGTGGTATGAGCTTCAGTCAGCGCTCAAACC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 TGCACATCCACCAGCGAGTACACACAGGAGAGAGGCCCTACAAGTGTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TGCACATCCACCAGCGAGTACACACAGGAGAGAGGCCCTACAAGTGTGGT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GAGTGTGGGAAGGGCTTCAGTCAGAGCTCGAACCTTCACATTCACCGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GAGTGTGGGAAGGGCTTCAGTCAGAGCTCGAACCTTCACATTCACCGGTG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 CATCCACACAGGAGAGAAGCCTTACCAATGCTATGAGTGTGGGAAGGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 CATCCACACAGGAGAGAAGCCTTACCAATGCTATGAGTGTGGGAAGGGTT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 TCAGCCAGAGCTCGGATCTTCGCATCCATCTCAGAGTCCACACTGGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 TCAGCCAGAGCTCGGATCTTCGCATCCATCTCAGAGTCCACACTGGAGAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 AAGCCCTATCACTGTGGCAAGTGTGGGAAGGGATTTAGCCAGAGTTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 AAGCCCTATCACTGTGGCAAGTGTGGGAAGGGATTTAGCCAGAGTTCCAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 ACTCCTCATCCACCAGAGAGTACATACTGGAGAGAAGCCCTATGAGTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 ACTCCTCATCCACCAGAGAGTACATACTGGAGAGAAGCCCTATGAGTGCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 GCAAGTGTGGGAAGGGCTTCAGCCAGAGCTCCAACCTTCACATCCACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 GCAAGTGTGGGAAGGGCTTCAGCCAGAGCTCCAACCTTCACATCCACCAG

   1350     .    :    .    :
   1351 CGGGTTCACAAGAAAGATCCTCGC
        ||||||||||||||||||||||||
 101351 CGGGTTCACAAGAAAGATCCTCGC