seq1 = pF1KB9662.tfa, 1011 bp
seq2 = pF1KB9662/gi568815585r_98076226.tfa (gi568815585r:98076226_98277236), 201011 bp

>pF1KB9662 1011
>gi568815585r:98076226_98277236 (Chr13)

(complement)

1-1011  (100001-101011)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGCGCCACCTTCTCCAGGAAGGACGGCCGACCAAGCAGACCAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAGCGCCACCTTCTCCAGGAAGGACGGCCGACCAAGCAGACCAGGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ATGCACCTTCCTCTTCAAAAAGCCTGGACGGAAAGGGGCTGCAGGCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ATGCACCTTCCTCTTCAAAAAGCCTGGACGGAAAGGGGCTGCAGGCCTCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GAAAGCGCCCGGCCTGCGACCCCGAGCACGGAGAGAGCAGCAGCAGCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GAAAGCGCCCGGCCTGCGACCCCGAGCACGGAGAGAGCAGCAGCAGCGGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GACGAGGGCGACACAGTGGCTCAGCCCCCGCGGGTGGCACCGAGGCCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GACGAGGGCGACACAGTGGCTCAGCCCCCGCGGGTGGCACCGAGGCCCCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGGCCTCCACAGCTGGCAGAAGGCGGCTCACGGCGACAGGAGGGGCGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGGCCTCCACAGCTGGCAGAAGGCGGCTCACGGCGACAGGAGGGGCGAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGGCGGCGCCTGAGAGCCTCGACGTGGTGTACAGGTCCACCCGCTCGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGGCGGCGCCTGAGAGCCTCGACGTGGTGTACAGGTCCACCCGCTCGGCG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AAGCCTGTGGGGCCGGAGGACATGGGGGCCACCGCTGACTTCGAGCAGGA
        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AAGCCTGTGGGGCCAGAGGACATGGGGGCCACCGCTGACTTCGAGCAGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CACCGAGAAGGAGCACCATACGCCGACCATCCTCAAGTGCAGCCAGCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CACCGAGAAGGAGCACCATACGCCGACCATCCTCAAGTGCAGCCAGCGGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCCAGGAGGCACTGCGGGGTCGGGAGCACGACCACATCTACCGGGGAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TCCAGGAGGCACTGCGGGGTCGGGAGCACGACCACATCTACCGGGGAATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CACAGCTACCTGAGGTACCTGAAGCCCAAGGACACGTCCATGGGCAACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CACAGCTACCTGAGGTACCTGAAGCCCAAGGACACGTCCATGGGCAACTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTCCTCGGGGATGGCGAGGAAGGGCCCCATACGTGCGCCAGGGCATCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTCCTCGGGGATGGCGAGGAAGGGCCCCATACGTGCGCCAGGGCATCTGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GCGCCACTGTGCGCTGGGATTACCAGCCTGACATCTGCAAGGACTACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GCGCCACTGTGCGCTGGGATTACCAGCCTGACATCTGCAAGGACTACAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GAGACTGGCTTCTGTGGCTTCGGGGACAGCTGCAAATTCCTCCACGACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GAGACTGGCTTCTGTGGCTTCGGGGACAGCTGCAAATTCCTCCACGACCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TTCCGATTACAAGCTCGGGTGGGAGATTGAACGGGAGCTTGAAGAGGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TTCCGATTACAAGCTCGGGTGGGAGATTGAACGGGAGCTTGAAGAGGGTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GCTACTGTATCTGCGAGGACGAAAACCATGAAGTGGGAAGCGAGGAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GCTACTGTATCTGCGAGGACGAAAACCATGAAGTGGGAAGCGAGGAAGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GAAATACCATTCAGGTGTTTCATATGTCGCCAGGCCTTCCAAAACCCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GAAATACCATTCAGGTGTTTCATATGTCGCCAGGCCTTCCAAAACCCAGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CGTCACCAAGTGCAGGCATTATTTCTGCGAGAGCTGCGCGCTGGAGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CGTCACCAAGTGCAGGCATTATTTCTGCGAGAGCTGCGCGCTGGAGCACT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TCCGGGCCACCCCGCGCTGCTACATCTGTGACCAGCCAACCGGCGGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TCCGGGCCACCCCGCGCTGCTACATCTGTGACCAGCCAACCGGCGGCATC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 TTTAACCCCGCCAAAGAACTGATGGCGAAACTGCAAAAGCTTCAGGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TTTAACCCCGCCAAAGAACTGATGGCGAAACTGCAAAAGCTTCAGGCTGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 AGAAGGTGGGGGCAAGTCCCATTTCACAGAAGACCCCCATGAGTGTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 AGAAGGTGGGGGCAAGTCCCATTTCACAGAAGACCCCCATGAGTGTCCAA

   1000     .    :
   1001 TTCCCATGGCT
        |||||||||||
 101001 TTCCCATGGCT