seq1 = pF1KB9661.tfa, 1029 bp
seq2 = pF1KB9661/gi568815575r_119770585.tfa (gi568815575r:119770585_119971613), 201029 bp

>pF1KB9661 1029
>gi568815575r:119770585_119971613 (ChrX)

(complement)

1-1029  (100001-101029)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGAGCAGCTTTCTCCAGGAAAGGCGGTGGATCAGGTGTGCACCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAGAGCAGCTTTCTCCAGGAAAGGCGGTGGATCAGGTGTGCACCTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTTTTCAAAAAGCCTGGGCGGAAAGGGGCTGCTGGACGCAGAAAGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTTTTCAAAAAGCCTGGGCGGAAAGGGGCTGCTGGACGCAGAAAGCGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGGCCTGCGACCCAGAGCCCGGAGAAAGCGGCAGCAGTAGCGACGAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGGCCTGCGACCCAGAGCCCGGAGAAAGCGGCAGCAGTAGCGACGAAGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TGCACTGTGGTTCGACCGGAAAAGAAGCGGGTGACCCACAATCCAATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TGCACTGTGGTTCGACCGGAAAAGAAGCGGGTGACCCACAATCCAATGAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 ACAGAAGACCCGTGACAGTGGTAAACAGAAGGCGGCTTACGGCGACTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 ACAGAAGACCCGTGACAGTGGTAAACAGAAGGCGGCTTACGGCGACTTGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCAGCGAAGAGGAAGAGGAAAATGAGCCCGAGAGTCTCGGCGTGGTTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCAGCGAAGAGGAAGAGGAAAATGAGCCCGAGAGTCTCGGCGTGGTTTAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AAATCCACCCGTTCGGCGAAACCCGTGGGACCAGAGGATATGGGAGCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AAATCCACCCGTTCGGCGAAACCCGTGGGACCAGAGGATATGGGAGCGAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AGCTGTCTATGAGCTGGACACAGAGAAAGAGCGCGATGCACAAGCCATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AGCTGTCTATGAGCTGGACACAGAGAAAGAGCGCGATGCACAAGCCATCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TTGAGCGCAGCCAGAAGATCCAGGAGGAGCTGAGGGGCAAGGAGGATGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TTGAGCGCAGCCAGAAGATCCAGGAGGAGCTGAGGGGCAAGGAGGATGAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AAGATCTATCGGGGAATCAACAATTATCAGAAATACATGAAGCCCAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AAGATCTATCGGGGAATCAACAATTATCAGAAATACATGAAGCCCAAGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TACGTCTATGGGCAATGCCTCTTCCGGGATGGTGAGGAAGGGCCCCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TACGTCTATGGGCAATGCCTCTTCCGGGATGGTGAGGAAGGGCCCCATCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GAGCGCCCGAGCATCTACGTGCCACCGTGCGCTGGGATTACCAGCCCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GAGCGCCCGAGCATCTACGTGCCACCGTGCGCTGGGATTACCAGCCCGAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ATCTGTAAGGACTACAAAGAGACTGGCTTCTGCGGCTTCGGAGACAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ATCTGTAAGGACTACAAAGAGACTGGCTTCTGCGGCTTCGGAGACAGCTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CAAATTCCTCCATGACCGTTCAGATTACAAGCATGGGTGGCAGATCGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CAAATTCCTCCATGACCGTTCAGATTACAAGCATGGGTGGCAGATCGAAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GTGAGCTTGATGAGGGTCGCTATGGTGTCTATGAGGATGAAAACTATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GTGAGCTTGATGAGGGTCGCTATGGTGTCTATGAGGATGAAAACTATGAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GTGGGAAGCGATGATGAGGAAATACCATTCAAGTGTTTCATCTGTCGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GTGGGAAGCGATGATGAGGAAATACCATTCAAGTGTTTCATCTGTCGCCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GAGCTTCCAAAACCCAGTTGTCACCAAGTGCAGGCATTATTTCTGCGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GAGCTTCCAAAACCCAGTTGTCACCAAGTGCAGGCATTATTTCTGCGAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 GCTGTGCACTGCAGCATTTCCGCACCACCCCGCGCTGCTATGTCTGTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 GCTGTGCACTGCAGCATTTCCGCACCACCCCGCGCTGCTATGTCTGTGAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CAGCAGACCAATGGCGTCTTCAATCCAGCGAAAGAATTGATTGCTAAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CAGCAGACCAATGGCGTCTTCAATCCAGCGAAAGAATTGATTGCTAAACT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 AGAGAAGCATCGAGCTACAGGAGAGGGTGGTGCTTCCGACTTGCCAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 AGAGAAGCATCGAGCTACAGGAGAGGGTGGTGCTTCCGACTTGCCAGAAG

   1000     .    :    .    :    .
   1001 ACCCCGATGAGGATGCAATTCCCATTACT
        |||||||||||||||||||||||||||||
 101001 ACCCCGATGAGGATGCAATTCCCATTACT