seq1 = pF1KB9660.tfa, 936 bp
seq2 = pF1KB9660/gi568815597r_247056578.tfa (gi568815597r:247056578_247249719), 193142 bp

>pF1KB9660 936
>gi568815597r:247056578_247249719 (Chr1)

(complement)

1-936  (92216-93151)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCAAATTTTAATCTGAACAAAAAAATTCCTGCTAGAGTAAAACCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  92216 ATGCCAAATTTTAATCTGAACAAAAAAATTCCTGCTAGAGTAAAACCACA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGAATGCATTGTGTGTGAAAAATTCTTCATACGTCATTCATCCCTTCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  92266 TGAATGCATTGTGTGTGAAAAATTCTTCATACGTCATTCATCCCTTCATA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGCACATCATATCTCATTCTGGAAACAACCCATATGGGTGTGAGGAATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  92316 GGCACATCATATCTCATTCTGGAAACAACCCATATGGGTGTGAGGAATGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGAAAGAAGCCATGTACATGTAAACAATGTCAGAAAACTTCCCTTTCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  92366 GGAAAGAAGCCATGTACATGTAAACAATGTCAGAAAACTTCCCTTTCTGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CACAAGGGTTCACAGAGACACAGTAATGCACACTGGAAATGGACATTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  92416 CACAAGGGTTCACAGAGACACAGTAATGCACACTGGAAATGGACATTATG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GTTGTACAATATGTGAGAAAGTTTTTAATATTCCCAGTTCATTTCAGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  92466 GTTGTACAATATGTGAGAAAGTTTTTAATATTCCCAGTTCATTTCAGATA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CATCAGAGAAATCACACTGGAGAGAAACCCTATGAATGTATGGAATGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  92516 CATCAGAGAAATCACACTGGAGAGAAACCCTATGAATGTATGGAATGTGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GAAAGCCTTAGGTTTTTCCCGTTCTCTTAATAGACATAAAAGGATTCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  92566 GAAAGCCTTAGGTTTTTCCCGTTCTCTTAATAGACATAAAAGGATTCACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CTGGAGAAAAACGCTATGAATGTAAGCAATGTGGGAAAGCCTTCAGTCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  92616 CTGGAGAAAAACGCTATGAATGTAAGCAATGTGGGAAAGCCTTCAGTCGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TCCAGTCACCTTCGTGACCATGAAAGAACTCATACTGGAGAGAAACCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  92666 TCCAGTCACCTTCGTGACCATGAAAGAACTCATACTGGAGAGAAACCCTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TGAATGTAAGCACTGTGGGAAAGCCTTCCGTTACTCCAATTGCCTTCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  92716 TGAATGTAAGCACTGTGGGAAAGCCTTCCGTTACTCCAATTGCCTTCATT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ACCATGAAAGAACTCACACTGGAGAGAAACCTTATGTGTGCATGGAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  92766 ACCATGAAAGAACTCACACTGGAGAGAAACCTTATGTGTGCATGGAATGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GGCAAAGCTTTCAGTTGTCTCAGTTCCTTGCAAGGACATATAAAGGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  92816 GGCAAAGCTTTCAGTTGTCTCAGTTCCTTGCAAGGACATATAAAGGCTCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TGCTGGTGAAGAACCCTATCCATGTAAGCAATGTGGGAAAGCCTTCAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  92866 TGCTGGTGAAGAACCCTATCCATGTAAGCAATGTGGGAAAGCCTTCAGAT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ACGCCAGTTCCCTTCAGAAACACGAGAAAACTCATATTGCACAGAAACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  92916 ACGCCAGTTCCCTTCAGAAACACGAGAAAACTCATATTGCACAGAAACCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TATGTATGTAACAATTGTGGTAAAGGCTTCAGATGTTCCAGTTCCCTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  92966 TATGTATGTAACAATTGTGGTAAAGGCTTCAGATGTTCCAGTTCCCTTCG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TGACCATGAAAGGACTCATACTGGAGAGAAACCCTATGAATGTCAGAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  93016 TGACCATGAAAGGACTCATACTGGAGAGAAACCCTATGAATGTCAGAAAT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 GTGGCAAAGCCTTTAGTCGTGCTAGTACCCTTTGGAAGCATAAAAAAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  93066 GTGGCAAAGCCTTTAGTCGTGCTAGTACCCTTTGGAAGCATAAAAAAACT

    900     .    :    .    :    .    :    .
    901 CATACTGGAGAAAAGCCCTATAAATGTAAAAAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  93116 CATACTGGAGAAAAGCCCTATAAATGTAAAAAAATG