seq1 = pF1KB9659.tfa, 1464 bp
seq2 = pF1KB9659/gi568815579f_36776831.tfa (gi568815579f:36776831_36978294), 201464 bp

>pF1KB9659 1464
>gi568815579f:36776831_36978294 (Chr19)

1-1464  (100001-101464)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAAAACCTTACAAAACACAGCATTGAGTGTTCAAGTTTCAGAGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAAAACCTTACAAAACACAGCATTGAGTGTTCAAGTTTCAGAGGTGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTGGGAATGTAAAAACCAGTTTGAGAGAAAACAGGGATCTCAGGAAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTGGGAATGTAAAAACCAGTTTGAGAGAAAACAGGGATCTCAGGAAGGAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATTTCAGTGAAATGATATTTACTCCTGAAGACATGCCCACTTTCAGTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ATTTCAGTGAAATGATATTTACTCCTGAAGACATGCCCACTTTCAGTATC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CAGCATCAGAGAATTCATACTGATGAGAAACTCCTTGAATGTAAGGAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CAGCATCAGAGAATTCATACTGATGAGAAACTCCTTGAATGTAAGGAATG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGGGAAGGATTTTAGTTTTGTATCAGTCCTTGTTCGACATCAGCGAATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGGGAAGGATTTTAGTTTTGTATCAGTCCTTGTTCGACATCAGCGAATTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ATACTGGTGAGAAACCTTATGAATGCAAAGAATGTGGCAAGGCCTTTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ATACTGGTGAGAAACCTTATGAATGCAAAGAATGTGGCAAGGCCTTTGGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AGTGGTGCAAACCTTGCTTACCATCAAAGAATTCATACTGGTGAGAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AGTGGTGCAAACCTTGCTTACCATCAAAGAATTCATACTGGTGAGAAGCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TTTTGAATGTAAAGAATGTGGGAAGGCCTTTGGTAGTGGCTCAAACCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TTTTGAATGTAAAGAATGTGGGAAGGCCTTTGGTAGTGGCTCAAACCTTA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CTCACCATCAGAGAATTCATACTGGTGAGAAACCCTATGAGTGTAAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CTCACCATCAGAGAATTCATACTGGTGAGAAACCCTATGAGTGTAAGGAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TGTGGGAAAGCCTTTAGTTTTGGATCAGGCCTTATTCGACATCAGATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TGTGGGAAAGCCTTTAGTTTTGGATCAGGCCTTATTCGACATCAGATCAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TCACAGTGGTGAGAAGCCTTATGAGTGTAAGGAATGTGGGAAGTCCTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TCACAGTGGTGAGAAGCCTTATGAGTGTAAGGAATGTGGGAAGTCCTTTA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GTTTTGAATCAGCCCTTATTCGGCATCACAGAATTCACACAGGTGAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GTTTTGAATCAGCCCTTATTCGGCATCACAGAATTCACACAGGTGAGAAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CCTTATGAATGTATAGATTGTGGTAAAGCCTTTGGCAGTGGTTCAAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CCTTATGAATGTATAGATTGTGGTAAAGCCTTTGGCAGTGGTTCAAACCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TACCCAACATCGGCGGATTCATACTGGTGAGAAACCTTATGAATGCAAAG
        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TACTCAACATCGGCGGATTCATACTGGTGAGAAACCTTATGAATGCAAAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CATGTGGAATGGCCTTTAGCAGTGGTTCGGCTCTTACTCGGCATCAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CATGTGGAATGGCCTTTAGCAGTGGTTCGGCTCTTACTCGGCATCAGAGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 ATTCATACCGGTGAGAAACCATATATATGTAATGAATGTGGTAAGGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 ATTCATACCGGTGAGAAACCATATATATGTAATGAATGTGGTAAGGCCTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TAGTTTTGGATCAGCCCTTACTCGACATCAAAGAATTCATACTGGTGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TAGTTTTGGATCAGCCCTTACTCGACATCAAAGAATTCATACTGGTGAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 AACCTTATGTATGTAAGGAATGTGGGAAGGCCTTTAATAGTGGCTCAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
 100851 AACCTTATGTATGTAAGGAATGTGGGAAGGCTTTTAATAGTGGCTCAGAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CTCACTCAGCATCAGAGAATTCACACTGGTGAGAAACCCTATGAGTGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CTCACTCAGCATCAGAGAATTCACACTGGTGAGAAACCCTATGAGTGTAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GGAGTGTGAGAAAGCCTTTAGAAGTGGTTCAAAACTTATTCAGCATCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GGAGTGTGAGAAAGCCTTTAGAAGTGGTTCAAAACTTATTCAGCATCAAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 GAATGCATACTGGAGAGAAACCTTATGAATGTAAGGAATGTGGGAAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 GAATGCATACTGGAGAGAAACCTTATGAATGTAAGGAATGTGGGAAGACC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 TTTAGTAGTGGTTCAGACCTTACTCAACATCACAGAATTCATACTGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 TTTAGTAGTGGTTCAGACCTTACTCAACATCACAGAATTCATACTGGTGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 GAAACCCTATGAATGTAAGGAATGTGGGAAGGCCTTTGGTAGTGGCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 GAAACCCTATGAATGTAAGGAATGTGGGAAGGCCTTTGGTAGTGGCTCAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 AACTTATCCAACACCAGCTAATCCATACTGGTGAAAGACCCTATGAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 AACTTATCCAACACCAGCTAATCCATACTGGTGAAAGACCCTATGAATGT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 AAAGAATGTGGAAAGTCCTTTAGTAGTGGTTCAGCTCTTAATCGGCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 AAAGAATGTGGAAAGTCCTTTAGTAGTGGTTCAGCTCTTAATCGGCACCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 GAGAATACACACTGGTGAGAAACCCTATGAATGTAAGGAGTGTGGGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 GAGAATACACACTGGTGAGAAACCCTATGAATGTAAGGAGTGTGGGAAGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 CTTTTTATAGTGGCTCAAGCCTTACTCAGCATCAGAGAATTCATACAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 CTTTTTATAGTGGCTCAAGCCTTACTCAGCATCAGAGAATTCATACAGGT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 GAGAAACTTTATGAATGTAAGAACTGTGGGAAGGCTTATGGGAGGGATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 GAGAAACTTTATGAATGTAAGAACTGTGGGAAGGCTTATGGGAGGGATTC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 AGAGTTTCAGCAACATAAGAAAAGTCATAATGGTAAGAAACTCTGCGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 AGAGTTTCAGCAACATAAGAAAAGTCATAATGGTAAGAAACTCTGCGAAT

   1450     .    :
   1451 TGGAAACTATAAAT
        ||||||||||||||
 101451 TGGAAACTATAAAT