seq1 = pF1KB9657.tfa, 606 bp
seq2 = pF1KB9657/gi568815591r_19016716.tfa (gi568815591r:19016716_19217321), 200606 bp

>pF1KB9657 606
>gi568815591r:19016716_19217321 (Chr7)

(complement)

1-606  (100001-100606)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATGCAGGACGTGTCCAGCTCGCCAGTCTCGCCGGCCGACGACAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATGCAGGACGTGTCCAGCTCGCCAGTCTCGCCGGCCGACGACAGCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAGCAACAGCGAGGAAGAGCCAGACCGGCAGCAGCCGCCGAGCGGCAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAGCAACAGCGAGGAAGAGCCAGACCGGCAGCAGCCGCCGAGCGGCAAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCGGGGGACGCAAGCGGCGCAGCAGCAGGCGCAGCGCGGGCGGCGGCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCGGGGGACGCAAGCGGCGCAGCAGCAGGCGCAGCGCGGGCGGCGGCGCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGGCCCGGCGGAGCCGCGGGTGGGGGCGTCGGAGGCGGCGACGAGCCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGGCCCGGCGGAGCCGCGGGTGGGGGCGTCGGAGGCGGCGACGAGCCGGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAGCCCGGCCCAGGGCAAGCGCGGCAAGAAGTCTGCGGGCTGTGGCGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAGCCCGGCCCAGGGCAAGCGCGGCAAGAAGTCTGCGGGCTGTGGCGGCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCGGCGGCGCGGGCGGCGGCGGCGGCAGCAGCAGCGGCGGCGGGAGTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCGGCGGCGCGGGCGGCGGCGGCGGCAGCAGCAGCGGCGGCGGGAGTCCG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CAGTCTTACGAGGAGCTGCAGACGCAGCGGGTCATGGCCAACGTGCGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CAGTCTTACGAGGAGCTGCAGACGCAGCGGGTCATGGCCAACGTGCGGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCGCCAGCGCACCCAGTCGCTGAACGAGGCGTTCGCCGCGCTGCGGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GCGCCAGCGCACCCAGTCGCTGAACGAGGCGTTCGCCGCGCTGCGGAAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCATCCCCACGCTGCCCTCGGACAAGCTGAGCAAGATTCAGACCCTCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TCATCCCCACGCTGCCCTCGGACAAGCTGAGCAAGATTCAGACCCTCAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CTGGCGGCCAGGTACATCGACTTCCTCTACCAGGTCCTCCAGAGCGACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CTGGCGGCCAGGTACATCGACTTCCTCTACCAGGTCCTCCAGAGCGACGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GCTGGACTCCAAGATGGCAAGCTGCAGCTATGTGGCTCACGAGCGGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GCTGGACTCCAAGATGGCAAGCTGCAGCTATGTGGCTCACGAGCGGCTCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GCTACGCCTTCTCGGTCTGGAGGATGGAGGGGGCCTGGTCCATGTCCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GCTACGCCTTCTCGGTCTGGAGGATGGAGGGGGCCTGGTCCATGTCCGCG

    600     .
    601 TCCCAC
        ||||||
 100601 TCCCAC