seq1 = pF1KB9645.tfa, 3096 bp
seq2 = pF1KB9645/gi568815580f_75185543.tfa (gi568815580f:75185543_75388638), 203096 bp

>pF1KB9645 3096
>gi568815580f:75185543_75388638 (Chr18)

1-3096  (100001-103096)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTGCAATGAAGAGACGGAGATCAAAGAGGCGCAGAGCTACCAGAACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTGCAATGAAGAGACGGAGATCAAAGAGGCGCAGAGCTACCAGAACTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCCAGTCAGCTCTGCGACTAACCAGGACGCCGGCTACGGGTCGCCCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCCAGTCAGCTCTGCGACTAACCAGGACGCCGGCTACGGGTCGCCCTTCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GTGAGAGCAGCGACCAGCTAGCCCATTTCAAAGGCTCTTCCTCTCGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GTGAGAGCAGCGACCAGCTAGCCCATTTCAAAGGCTCTTCCTCTCGAGAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAGAAGGAGGATCCGCAGTGTCCCGACAGCGTCTCGTACCCCCAGGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GAGAAGGAGGATCCGCAGTGTCCCGACAGCGTCTCGTACCCCCAGGACAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCTGGCACAGATCAAAGCTGTGTATGCAAACTTGTTCTCCGAGTCCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCTGGCACAGATCAAAGCTGTGTATGCAAACTTGTTCTCCGAGTCCTGCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GGTCCAGCTTAGCTCTGGATTTAAAGAAGTCGGGTTCCACCACCAGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GGTCCAGCTTAGCTCTGGATTTAAAGAAGTCGGGTTCCACCACCAGCACC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AACGATGCCAGCCAGAAGGAGAGCTCCGCCCCCACCCCCACACCCCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AACGATGCCAGCCAGAAGGAGAGCTCCGCCCCCACCCCCACACCCCCCAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTGCCCCGTCAGCACCACTGGCCCCACCACGAGCACGCCCAGCACCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTGCCCCGTCAGCACCACTGGCCCCACCACGAGCACGCCCAGCACCAGCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GCAGCTCCAGCACCAGCCACAGCAGTACCACCAGTACCAGCAGCAGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GCAGCTCCAGCACCAGCCACAGCAGTACCACCAGTACCAGCAGCAGCTCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GGGTACGACTGGCACCAGGCTGCACTGGCCAAGACGCTGCAGCAGACGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GGGTACGACTGGCACCAGGCTGCACTGGCCAAGACGCTGCAGCAGACGTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTCGTATGGGCTGCTTCCTGAGCCCAGCCTGTTCAGCACCGTGCAGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTCGTATGGGCTGCTTCCTGAGCCCAGCCTGTTCAGCACCGTGCAGCTCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ACCGCCAGAACAACAAGCTCTACGGCTCCGTCTTCACGGGCGCCAGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ACCGCCAGAACAACAAGCTCTACGGCTCCGTCTTCACGGGCGCCAGCAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TTCCGGTGCAAAGACTGCAGTGCCGCGTACGACACGCTGGTGGAACTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TTCCGGTGCAAAGACTGCAGTGCCGCGTACGACACGCTGGTGGAACTGAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GGTGCACATGAACGAGACAGGCCACTACCGTGACGACAACAGGGACAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GGTGCACATGAACGAGACAGGCCACTACCGTGACGACAACAGGGACAAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ACTCCGAGAAGACCAAGAGGTGGTCCAAGCCCAGGAAGCGCTCCCTGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 ACTCCGAGAAGACCAAGAGGTGGTCCAAGCCCAGGAAGCGCTCCCTGATG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GAGATGGAGGGGAAGGAGGATGCCCAGAAGGTGCTGAAGTGCATGTACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GAGATGGAGGGGAAGGAGGATGCCCAGAAGGTGCTGAAGTGCATGTACTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TGGACACTCCTTTGAGTCCTTGCAGGACCTCAGCGTCCACATGATCAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TGGACACTCCTTTGAGTCCTTGCAGGACCTCAGCGTCCACATGATCAAAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CCAAGCATTACCAGAAAGTGCCTCTGAAGGAGCCAGTGCCAGCCATCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CCAAGCATTACCAGAAAGTGCCTCTGAAGGAGCCAGTGCCAGCCATCACC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 AAACTGGTCCCCTCCACCAAAAAGCGGGCGCTTCAGGACCTGGCGCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AAACTGGTCCCCTCCACCAAAAAGCGGGCGCTTCAGGACCTGGCGCCCCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CTGCTCCCCTGAGCCAGCAGGAATGGCCGCAGAGGTGGCCCTGAGTGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CTGCTCCCCTGAGCCAGCAGGAATGGCCGCAGAGGTGGCCCTGAGTGAGT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 CAGCCAAGGATCAGAAAGCAGCGAACCCGTACGTCACGCCCAATAACCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 CAGCCAAGGATCAGAAAGCAGCGAACCCGTACGTCACGCCCAATAACCGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 TATGGCTACCAGAATGGCGCCAGCTACACCTGGCAGTTTGAGGCCCGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 TATGGCTACCAGAATGGCGCCAGCTACACCTGGCAGTTTGAGGCCCGCAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 GGCGCAGATCCTCAAGTGCATGGAGTGTGGCAGCTCCCACGACACGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 GGCGCAGATCCTCAAGTGCATGGAGTGTGGCAGCTCCCACGACACGCTGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 AGCAGCTCACCGCCCACATGATGGTCACCGGGCACTTCCTGAAAGTGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 AGCAGCTCACCGCCCACATGATGGTCACCGGGCACTTCCTGAAAGTGACC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 ACCTCGGCTTCTAAGAAGGGCAAGCAGTTGGTGCTGGACCCTGTGGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 ACCTCGGCTTCTAAGAAGGGCAAGCAGTTGGTGCTGGACCCTGTGGTGGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 AGAGAAGATCCAGTCCATCCCACTACCGCCCACCACCCACACGCGGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 AGAGAAGATCCAGTCCATCCCACTACCGCCCACCACCCACACGCGGCTGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 CGGCCTCCAGCATCAAAAAGCAGCCCGACTCTCCCGCGGGGTCCACGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 CGGCCTCCAGCATCAAAAAGCAGCCCGACTCTCCCGCGGGGTCCACGACT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 TCTGAAGAAAAGAAAGAGCCAGAGAAGGAGAAGCCGCCTGTGGCTGGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 TCTGAAGAAAAGAAAGAGCCAGAGAAGGAGAAGCCGCCTGTGGCTGGCGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 CGCGGAGAAGATCAAGGAGGAGAGTGAGGACAGCTTGGAGAAATTTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 CGCGGAGAAGATCAAGGAGGAGAGTGAGGACAGCTTGGAGAAATTTGAGC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 CCAGCACCCTGTACCCGTACCTGCGTGAGGAGGACCTGGACGACAGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 CCAGCACCCTGTACCCGTACCTGCGTGAGGAGGACCTGGACGACAGCCCC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 AAGGGAGGGCTGGACATTCTCAAGTCCCTGGAGAATACCGTCTCCACGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 AAGGGAGGGCTGGACATTCTCAAGTCCCTGGAGAATACCGTCTCCACGGC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 CATTAGCAAAGCTCAGAATGGTGCGCCCTCATGGGGTGGCTACCCCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 CATTAGCAAAGCTCAGAATGGTGCGCCCTCATGGGGTGGCTACCCCAGCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 TCCATGCAGCCTACCAGCTCCCGGGCACCGTGAAGCCACTGCCGGCGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101601 TCCATGCAGCCTACCAGCTCCCGGGCACCGTGAAGCCACTGCCGGCGGCC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 GTGCAGAGCGTGCAGGTGCAGCCGTCCTATGCTGGCGGCGTGAAGTCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101651 GTGCAGAGCGTGCAGGTGCAGCCGTCCTATGCTGGCGGCGTGAAGTCGCT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1701 GTCTTCCGCCGAGCACAACGCCCTCCTGCACTCCCCAGGGAGCCTCACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101701 GTCTTCCGCCGAGCACAACGCCCTCCTGCACTCCCCAGGGAGCCTCACGC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1751 CCCCACCGCACAAGAGCAACGTGTCTGCCATGGAGGAGCTGGTGGAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101751 CCCCACCGCACAAGAGCAACGTGTCTGCCATGGAGGAGCTGGTGGAGAAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1801 GTCACGGGCAAGGTCAACATCAAGAAGGAGGAGAGACCCCCTGAGAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101801 GTCACGGGCAAGGTCAACATCAAGAAGGAGGAGAGACCCCCTGAGAAGGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1851 GAAGAGCTCCCTGGCCAAGGCTGCGTCCCCCATAGCAAAAGAGAATAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101851 GAAGAGCTCCCTGGCCAAGGCTGCGTCCCCCATAGCAAAAGAGAATAAAG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1901 ATTTCCCGAAAACGGAGGAAGTCAGCGGCAAACCACAGAAGAAGGGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101901 ATTTCCCGAAAACGGAGGAAGTCAGCGGCAAACCACAGAAGAAGGGCCCT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1951 GAGGCCGAGACTGGGAAGGCCAAAAAGGAGGGACCGCTGGACGTTCACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101951 GAGGCCGAGACTGGGAAGGCCAAAAAGGAGGGACCGCTGGACGTTCACAC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2001 CCCAAATGGCACAGAGCCTCTCAAAGCAAAGGTCACCAACGGCTGTAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102001 CCCAAATGGCACAGAGCCTCTCAAAGCAAAGGTCACCAACGGCTGTAACA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2051 ACCTGGGGATCATCATGGACCACTCACCGGAGCCTTCCTTCATCAACCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102051 ACCTGGGGATCATCATGGACCACTCACCGGAGCCTTCCTTCATCAACCCG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2101 CTGAGCGCTTTGCAGTCCATCATGAACACCCACCTGGGCAAGGTGTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102101 CTGAGCGCTTTGCAGTCCATCATGAACACCCACCTGGGCAAGGTGTCCAA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2151 GCCCGTGAGTCCCTCGCTGGACCCGCTGGCGATGCTGTACAAGATCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102151 GCCCGTGAGTCCCTCGCTGGACCCGCTGGCGATGCTGTACAAGATCAGCA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2201 ACAGCATGCTGGACAAGCCGGTGTACCCCGCCACCCCTGTGAAGCAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102201 ACAGCATGCTGGACAAGCCGGTGTACCCCGCCACCCCTGTGAAGCAGGCC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2251 GATGCCATCGACCGCTACTATTATGAAAACAGCGACCAGCCCATTGACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102251 GATGCCATCGACCGCTACTATTATGAAAACAGCGACCAGCCCATTGACTT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2301 AACCAAGTCCAAGAACAAGCCGCTGGTGTCCAGCGTGGCTGATTCGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102301 AACCAAGTCCAAGAACAAGCCGCTGGTGTCCAGCGTGGCTGATTCGGTGG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2351 CATCACCTCTGCGGGAGAGCGCACTCATGGACATCTCCGACATGGTGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102351 CATCACCTCTGCGGGAGAGCGCACTCATGGACATCTCCGACATGGTGAAA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2401 AACCTCACAGGCCGCCTGACGCCCAAGTCCTCCACGCCCTCCACAGTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102401 AACCTCACAGGCCGCCTGACGCCCAAGTCCTCCACGCCCTCCACAGTTTC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2451 AGAGAAGTCCGATGCTGATGGCAGCAGCTTTGAGGAGGCGTTGGACGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102451 AGAGAAGTCCGATGCTGATGGCAGCAGCTTTGAGGAGGCGTTGGACGAGC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2501 TGTCACCGGTCCACAAGAGGAAGGGCCGGCAGTCCAACTGGAACCCGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102501 TGTCACCGGTCCACAAGAGGAAGGGCCGGCAGTCCAACTGGAACCCGCAG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2551 CACCTTCTCATCCTGCAGGCCCAGTTCGCCTCGAGCTTGCGGGAGACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102551 CACCTTCTCATCCTGCAGGCCCAGTTCGCCTCGAGCTTGCGGGAGACCAC

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2601 AGAGGGCAAGTACATCATGTCGGACTTGGGCCCGCAGGAGAGGGTGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102601 AGAGGGCAAGTACATCATGTCGGACTTGGGCCCGCAGGAGAGGGTGCACA

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2651 TCTCGAAGTTTACTGGGCTCTCCATGACCACCATCAGCCACTGGCTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102651 TCTCGAAGTTTACTGGGCTCTCCATGACCACCATCAGCCACTGGCTGGCC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2701 AATGTGAAGTACCAGTTGAGGAGGACAGGGGGAACGAAATTCCTAAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102701 AATGTGAAGTACCAGTTGAGGAGGACAGGGGGAACGAAATTCCTAAAGAA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2751 CCTGGACACAGGGCATCCTGTTTTCTTTTGCAACGATTGTGCCTCTCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102751 CCTGGACACAGGGCATCCTGTTTTCTTTTGCAACGATTGTGCCTCTCAGT

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2801 TCAGAACTGCTTCTACATACATAAGTCATTTGGAGACACACTTGGGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102801 TCAGAACTGCTTCTACATACATAAGTCATTTGGAGACACACTTGGGCTTC

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2851 AGCCTGAAGGATCTCTCCAAGCTGCCACTCAATCAGATTCAAGAACAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102851 AGCCTGAAGGATCTCTCCAAGCTGCCACTCAATCAGATTCAAGAACAGCA

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2901 GAATGTTTCGAAAGTCCTCACCAACAAAACTCTGGGCCCACTGGGGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102901 GAATGTTTCGAAAGTCCTCACCAACAAAACTCTGGGCCCACTGGGGGCCA

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2951 CCGAGGAAGACTTGGGCTCCACATTCCAATGTAAGCTCTGCAACCGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102951 CCGAGGAAGACTTGGGCTCCACATTCCAATGTAAGCTCTGCAACCGGACT

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3001 TTTGCGAGCAAGCACGCAGTCAAACTGCACCTTAGTAAGACCCACGGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103001 TTTGCGAGCAAGCACGCAGTCAAACTGCACCTTAGTAAGACCCACGGCAA

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   3051 GTCTCCCGAGGACCACCTGATCTATGTGACTGAGTTGGAGAAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103051 GTCTCCCGAGGACCACCTGATCTATGTGACTGAGTTGGAGAAACAG