seq1 = pF1KB9642.tfa, 1779 bp
seq2 = pF1KB9642/gi568815597r_151700926.tfa (gi568815597r:151700926_151902704), 201779 bp

>pF1KB9642 1779
>gi568815597r:151700926_151902704 (Chr1)

(complement)

1-1779  (100001-101779)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATGCAGCCACAGCTCCAAAGCAAGCCTGGCCCCCATGGCCCCCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATGCAGCCACAGCTCCAAAGCAAGCCTGGCCCCCATGGCCCCCGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTTTTCCTCCTCCTCCTACCTGGAGGGAGCGGTGGCAGCTGCCCTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTTTTCCTCCTCCTCCTACCTGGAGGGAGCGGTGGCAGCTGCCCTGCTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGTGTGACTGCACCTCCCAGCCCCAGGCTGTGCTCTGTGGCCACAGGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGTGTGACTGCACCTCCCAGCCCCAGGCTGTGCTCTGTGGCCACAGGCAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGGAGGCTGTACCTGGAGGACTCCCACTGGACACTGAGCTCCTGGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTGGAGGCTGTACCTGGAGGACTCCCACTGGACACTGAGCTCCTGGACCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GAGTGGGAACCGCCTGTGGGGGCTCCAGCAGGGAATGCTCTCCCGCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GAGTGGGAACCGCCTGTGGGGGCTCCAGCAGGGAATGCTCTCCCGCCTGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCCTGCTCCAGGAATTGGACCTCAGCTACAACCAGCTCTCAACCCTTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCCTGCTCCAGGAATTGGACCTCAGCTACAACCAGCTCTCAACCCTTGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CCTGGGGCCTTCCATGGCCTACAAAGCCTACTCACCCTGAGGCTGCAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CCTGGGGCCTTCCATGGCCTACAAAGCCTACTCACCCTGAGGCTGCAGGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CAATCGGCTCAGAATCATGGGGCCTGGGGTCTTCTCAGGCCTCTCTGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CAATCGGCTCAGAATCATGGGGCCTGGGGTCTTCTCAGGCCTCTCTGCTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGACCCTGCTGGACCTCCGCCTCAACCAGATTGTTCTCTTCCTAGATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGACCCTGCTGGACCTCCGCCTCAACCAGATTGTTCTCTTCCTAGATGGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GCTTTTGGGGAGCTAGGCAGCCTCCAGAAGCTGGAGGTTGGGGACAACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GCTTTTGGGGAGCTAGGCAGCCTCCAGAAGCTGGAGGTTGGGGACAACCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CCTGGTATTTGTGGCTCCGGGGGCCTTTGCAGGGCTAGCCAAGTTGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CCTGGTATTTGTGGCTCCGGGGGCCTTTGCAGGGCTAGCCAAGTTGAGCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CCCTCACCCTGGAGCGCTGCAACCTCAGCACAGTGCCTGGCCTAGCCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CCCTCACCCTGGAGCGCTGCAACCTCAGCACAGTGCCTGGCCTAGCCCTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GCCCGTCTCCCGGCACTAGTGGCCCTAAGGCTTAGAGAACTGGATATTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GCCCGTCTCCCGGCACTAGTGGCCCTAAGGCTTAGAGAACTGGATATTGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GAGGCTGCCAGCTGGGGCCCTGCGGGGGCTGGGGCAGCTCAAGGAGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GAGGCTGCCAGCTGGGGCCCTGCGGGGGCTGGGGCAGCTCAAGGAGCTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AGATCCACCTCTGGCCATCTCTGGAGGCTCTGGACCCTGGGAGCCTGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AGATCCACCTCTGGCCATCTCTGGAGGCTCTGGACCCTGGGAGCCTGGTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GGGCTCAATCTCAGCAGCCTGGCCATCACTCGCTGCAATCTGAGCTCGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GGGCTCAATCTCAGCAGCCTGGCCATCACTCGCTGCAATCTGAGCTCGGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GCCCTTCCAAGCACTGTACCACCTCAGCTTCCTCAGGGTCCTGGATCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GCCCTTCCAAGCACTGTACCACCTCAGCTTCCTCAGGGTCCTGGATCTGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CCCAGAATCCCATCTCAGCCATCCCAGCCCGAAGGCTCAGCCCCCTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CCCAGAATCCCATCTCAGCCATCCCAGCCCGAAGGCTCAGCCCCCTGGTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CGGCTCCAGGAGCTACGCCTGTCAGGGGCATGCCTCACCTCCATTGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CGGCTCCAGGAGCTACGCCTGTCAGGGGCATGCCTCACCTCCATTGCTGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CCATGCCTTCCATGGCTTGACTGCCTTCCACCTCCTGGATGTGGCAGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CCATGCCTTCCATGGCTTGACTGCCTTCCACCTCCTGGATGTGGCAGATA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 ACGCCCTTCAGACACTAGAGGAAACAGCTTTCCCTTCTCCAGACAAACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 ACGCCCTTCAGACACTAGAGGAAACAGCTTTCCCTTCTCCAGACAAACTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GTCACCTTGAGGCTGTCTGGCAACCCCCTAACCTGTGACTGCCGCCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GTCACCTTGAGGCTGTCTGGCAACCCCCTAACCTGTGACTGCCGCCTCCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 CTGGCTGCTCCGGCTCCGCCGCCACCTGGACTTTGGCATGTCCCCCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 CTGGCTGCTCCGGCTCCGCCGCCACCTGGACTTTGGCATGTCCCCCCCTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 CCTGTGCTGGCCCCCATCATGTCCAGGGGAAGAGCCTGAAGGAGTTTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 CCTGTGCTGGCCCCCATCATGTCCAGGGGAAGAGCCTGAAGGAGTTTTCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 GACATCCTGCCTCCAGGGCACTTCACCTGCAAACCAGCCCTGATCCGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 GACATCCTGCCTCCAGGGCACTTCACCTGCAAACCAGCCCTGATCCGAAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 GTCGGGGCCTCGATGGGTCATTGCAGAGGAGGGCGGGCATGCGGTTTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 GTCGGGGCCTCGATGGGTCATTGCAGAGGAGGGCGGGCATGCGGTTTTCT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 CCTGCTCTGGAGATGGAGACCCAGCCCCCACTGTCTCCTGGATGAGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 CCTGCTCTGGAGATGGAGACCCAGCCCCCACTGTCTCCTGGATGAGGCCT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 CATGGGGCTTGGCTGGGCAGGGCTGGGAGAGTAAGGGTCCTAGAGGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 CATGGGGCTTGGCTGGGCAGGGCTGGGAGAGTAAGGGTCCTAGAGGATGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 GACACTGGAGATCCGCTCAGTGCAGCTACGGGACAGAGGGGCCTATGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 GACACTGGAGATCCGCTCAGTGCAGCTACGGGACAGAGGGGCCTATGTCT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 GTGTGGTTAGCAATGTCGCTGGGAATGACTCCCTGAGGACCTGGCTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 GTGTGGTTAGCAATGTCGCTGGGAATGACTCCCTGAGGACCTGGCTGGAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 GTCATCCAGGTGGAACCACCAAACGGCACACTTTCTGACCCCAACATCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 GTCATCCAGGTGGAACCACCAAACGGCACACTTTCTGACCCCAACATCAC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 CGTGCCAGGGATCCCAGGGCCTTTTTTTCTGGATAGCAGAGGTGTGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 CGTGCCAGGGATCCCAGGGCCTTTTTTTCTGGATAGCAGAGGTGTGGCCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 TGGTGCTGGCAGTCGGCTTCCTCCCCTTCCTCACCTCAGTGACCCTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101601 TGGTGCTGGCAGTCGGCTTCCTCCCCTTCCTCACCTCAGTGACCCTCTGC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 TTTGGCCTGATTGCCCTTTGGAGCAAGGGCAAAGGTCGGGTCAAACATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101651 TTTGGCCTGATTGCCCTTTGGAGCAAGGGCAAAGGTCGGGTCAAACATCA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1701 CATGACCTTTGACTTTGTGGCACCTCGGCCCTCTGGGGATAAAAACTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101701 CATGACCTTTGACTTTGTGGCACCTCGGCCCTCTGGGGATAAAAACTCTG

   1750     .    :    .    :    .
   1751 GGGGTAACCGGGTCACTGCCAAGCTCTTC
        |||||||||||||||||||||||||||||
 101751 GGGGTAACCGGGTCACTGCCAAGCTCTTC