seq1 = pF1KB9640.tfa, 1083 bp
seq2 = pF1KB9640/gi568815575f_83408325.tfa (gi568815575f:83408325_83609407), 201083 bp

>pF1KB9640 1083
>gi568815575f:83408325_83609407 (ChrX)

1-1083  (100001-101083)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCACAGCTGCCTCGAATCCCTACAGCATTCTCAGTTCCACCTCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCACAGCTGCCTCGAATCCCTACAGCATTCTCAGTTCCACCTCCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGTCCATGCGGACTCTGCGGGCATGCAGCAGGGGAGTCCTTTCCGCAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGTCCATGCGGACTCTGCGGGCATGCAGCAGGGGAGTCCTTTCCGCAACC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTCAGAAACTTCTCCAAAGTGATTACTTGCAGGGAGTTCCCAGCAATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTCAGAAACTTCTCCAAAGTGATTACTTGCAGGGAGTTCCCAGCAATGGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CATCCCCTCGGGCATCACTGGGTGACCAGTCTGAGCGACGGGGGCCCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CATCCCCTCGGGCATCACTGGGTGACCAGTCTGAGCGACGGGGGCCCATG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GTCCTCCACACTGGCCACCAGCCCCCTGGACCAGCAGGACGTGAAGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GTCCTCCACACTGGCCACCAGCCCCCTGGACCAGCAGGACGTGAAGCCCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GGCGCGAAGACCTGCAACTGGGTGCGATCATCCATCACCGCTCGCCACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GGCGCGAAGACCTGCAACTGGGTGCGATCATCCATCACCGCTCGCCACAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GTAGCCCACCACTCACCGCACACTAACCACCCCAACGCCTGGGGGGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GTAGCCCACCACTCACCGCACACTAACCACCCCAACGCCTGGGGGGCCAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCCGGCACCGAACCCGTCTATCACGTCAAGCGGCCAACCCCTCAACGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CCCGGCACCGAACCCGTCTATCACGTCAAGCGGCCAACCCCTCAACGTGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ACTCGCAGCCTGGCTTCACCGTGAGCGGCATGCTGGAACACGGGGGACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ACTCGCAGCCTGGCTTCACCGTGAGCGGCATGCTGGAACACGGGGGACTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ACCCCACCTCCAGCTGCCGCCTCTGCACAGAGCCTGCACCCGGTGCTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ACCCCACCTCCAGCTGCCGCCTCTGCACAGAGCCTGCACCCGGTGCTCCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 AGAGCCCCCGGATCACGGCGAACTGGGCTCGCACCATTGCCAGGATCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 AGAGCCCCCGGATCACGGCGAACTGGGCTCGCACCATTGCCAGGATCACT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CCGACGAGGAGACGCCAACCTCTGATGAGTTGGAACAGTTCGCCAAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CCGACGAGGAGACGCCAACCTCTGATGAGTTGGAACAGTTCGCCAAACAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TTCAAACAAAGAAGAATCAAGTTGGGCTTCACGCAGGCCGACGTGGGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TTCAAACAAAGAAGAATCAAGTTGGGCTTCACGCAGGCCGACGTGGGGTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GGCGCTGGGCACACTGTATGGTAACGTGTTCTCGCAGACCACCATCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GGCGCTGGGCACACTGTATGGTAACGTGTTCTCGCAGACCACCATCTGCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GGTTCGAGGCCTTGCAGCTGAGCTTCAAAAATATGTGCAAGCTGAAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GGTTCGAGGCCTTGCAGCTGAGCTTCAAAAATATGTGCAAGCTGAAGCCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CTGCTGAACAAGTGGCTGGAGGAGGCGGATTCGTCCACAGGGAGCCCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CTGCTGAACAAGTGGCTGGAGGAGGCGGATTCGTCCACAGGGAGCCCGAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CAGCATTGACAAGATCGCTGCACAGGGCCGCAAGCGCAAGAAGCGGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CAGCATTGACAAGATCGCTGCACAGGGCCGCAAGCGCAAGAAGCGGACCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CCATCGAGGTGAGTGTCAAGGGCGTACTGGAGACGCATTTCCTCAAGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CCATCGAGGTGAGTGTCAAGGGCGTACTGGAGACGCATTTCCTCAAGTGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CCCAAGCCTGCCGCGCAGGAGATCTCCTCGCTGGCAGACAGCCTCCAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CCCAAGCCTGCCGCGCAGGAGATCTCCTCGCTGGCAGACAGCCTCCAGTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GGAGAAGGAAGTGGTGCGTGTCTGGTTCTGTAATCGAAGACAAAAAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GGAGAAGGAAGTGGTGCGTGTCTGGTTCTGTAATCGAAGACAAAAAGAGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 AAAGAATGACTCCGCCAGGGGATCAGCAGCCGCATGAGGTTTATTCGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 AAAGAATGACTCCGCCAGGGGATCAGCAGCCGCATGAGGTTTATTCGCAC

   1050     .    :    .    :    .    :
   1051 ACCGTGAAAACAGACACATCTTGCCATGATCTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 ACCGTGAAAACAGACACATCTTGCCATGATCTC