seq1 = pF1KB9633.tfa, 1386 bp
seq2 = pF1KB9633/gi568815589r_91309349.tfa (gi568815589r:91309349_91510734), 201386 bp

>pF1KB9633 1386
>gi568815589r:91309349_91510734 (Chr9)

(complement)

1-1386  (100001-101386)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAGCTGAGAAAAATGCAGACCGTCAAAAAGGAGCAGGCGTCTCTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCAGCTGAGAAAAATGCAGACCGTCAAAAAGGAGCAGGCGTCTCTTGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGCCAGTAGCAATGTGGACAAGATGATGGTCCTTAATTCTGCTTTAACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGCCAGTAGCAATGTGGACAAGATGATGGTCCTTAATTCTGCTTTAACGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AAGTGTCAGAAGACTCCACAACAGGTGAGGAGCTGCTTCTCAGTGAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AAGTGTCAGAAGACTCCACAACAGGTGAGGAGCTGCTTCTCAGTGAAGGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AGTGTGGGGAAGAACAAATCTTCTGCATGTCGGAGGAAACGGGAATTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AGTGTGGGGAAGAACAAATCTTCTGCATGTCGGAGGAAACGGGAATTCAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TCCTGATGAAAAGAAAGATGCTATGTATTGGGAAAAAAGGCGGAAAAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TCCTGATGAAAAGAAAGATGCTATGTATTGGGAAAAAAGGCGGAAAAATA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ATGAAGCTGCCAAAAGATCTCGTGAGAAGCGTCGACTGAATGACCTGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ATGAAGCTGCCAAAAGATCTCGTGAGAAGCGTCGACTGAATGACCTGGTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTAGAGAACAAACTAATTGCACTGGGAGAAGAAAACGCCACTTTAAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTAGAGAACAAACTAATTGCACTGGGAGAAGAAAACGCCACTTTAAAAGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGAGCTGCTTTCACTAAAATTAAAGTTTGGTTTAATTAGCTCCACAGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TGAGCTGCTTTCACTAAAATTAAAGTTTGGTTTAATTAGCTCCACAGCAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ATGCTCAAGAGATTCAGAAACTCAGTAATTCTACAGCTGTGTACTTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ATGCTCAAGAGATTCAGAAACTCAGTAATTCTACAGCTGTGTACTTTCAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GATTACCAGACTTCCAAATCCAATGTGAGTTCATTTGTGGACGAGCACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GATTACCAGACTTCCAAATCCAATGTGAGTTCATTTGTGGACGAGCACGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 ACCCTCGATGGTGTCAAGTAGTTGTATTTCTGTCATTAAACACTCTCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 ACCCTCGATGGTGTCAAGTAGTTGTATTTCTGTCATTAAACACTCTCCAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AAAGCTCGCTGTCCGATGTTTCAGAAGTGTCCTCAGTAGAACACACGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AAAGCTCGCTGTCCGATGTTTCAGAAGTGTCCTCAGTAGAACACACGCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GAGAGCTCTGTGCAGGGAAGCTGCAGAAGTCCTGAAAACAAGTTCCAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GAGAGCTCTGTGCAGGGAAGCTGCAGAAGTCCTGAAAACAAGTTCCAGAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TATCAAGCAAGAGCCGATGGAATTAGAGAGCTACACAAGGGAGCCAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TATCAAGCAAGAGCCGATGGAATTAGAGAGCTACACAAGGGAGCCAAGAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ATGACCGAGGCTCTTACACAGCGTCCATCTATCAAAACTATATGGGGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 ATGACCGAGGCTCTTACACAGCGTCCATCTATCAAAACTATATGGGGAAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TCTTTCTCTGGGTACTCACACTCTCCCCCACTACTGCAAGTCAACCGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TCTTTCTCTGGGTACTCACACTCTCCCCCACTACTGCAAGTCAACCGATC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CTCCAGCAACTCCCCGAGAACGTCGGAAACTGATGATGGTGTGGTAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CTCCAGCAACTCCCCGAGAACGTCGGAAACTGATGATGGTGTGGTAGGAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 AGTCATCTGATGGAGAAGACGAGCAACAGGTCCCCAAGGGCCCCATCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 AGTCATCTGATGGAGAAGACGAGCAACAGGTCCCCAAGGGCCCCATCCAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 TCTCCAGTTGAACTCAAGCATGTGCATGCAACTGTGGTTAAAGTTCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TCTCCAGTTGAACTCAAGCATGTGCATGCAACTGTGGTTAAAGTTCCAGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 AGTGAATTCCTCTGCCTTGCCACACAAGCTCCGGATCAAAGCCAAAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 AGTGAATTCCTCTGCCTTGCCACACAAGCTCCGGATCAAAGCCAAAGCCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 TGCAGATCAAAGTAGAAGCCTTTGATAATGAATTTGAGGCCACGCAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TGCAGATCAAAGTAGAAGCCTTTGATAATGAATTTGAGGCCACGCAAAAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 CTTTCCTCACCTATTGACATGACATCTAAAAGACATTTCGAACTCGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 CTTTCCTCACCTATTGACATGACATCTAAAAGACATTTCGAACTCGAAAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 GCATAGTGCCCCAAGTATGGTACATTCTTCTCTTACTCCTTTCTCAGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 GCATAGTGCCCCAAGTATGGTACATTCTTCTCTTACTCCTTTCTCAGTGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 AAGTGACTAACATTCAAGATTGGTCTCTCAAATCGGAGCACTGGCATCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 AAGTGACTAACATTCAAGATTGGTCTCTCAAATCGGAGCACTGGCATCAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 AAAGAACTGAGTGGCAAAACTCAGAATAGTTTCAAAACTGGAGTTGTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 AAAGAACTGAGTGGCAAAACTCAGAATAGTTTCAAAACTGGAGTTGTTGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 AATGAAAGACAGTGGCTACAAAGTTTCTGACCCAGAGAACTTGTATTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 AATGAAAGACAGTGGCTACAAAGTTTCTGACCCAGAGAACTTGTATTTGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 AGCAGGGGATAGCAAACTTATCTGCAGAGGTTGTCTCACTCAAGAGACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 AGCAGGGGATAGCAAACTTATCTGCAGAGGTTGTCTCACTCAAGAGACTT

   1350     .    :    .    :    .    :    .
   1351 ATAGCCACACAACCAATCTCTGCTTCAGACTCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 ATAGCCACACAACCAATCTCTGCTTCAGACTCTGGG