seq1 = pF1KB9629.tfa, 1011 bp
seq2 = pF1KB9629/gi568815591r_31238258.tfa (gi568815591r:31238258_31439268), 201011 bp

>pF1KB9629 1011
>gi568815591r:31238258_31439268 (Chr7)

(complement)

1-1011  (100001-101011)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTAACACTACCGTTTGATGAGTCTGTTGTAATGCCAGAATCCCAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTAACACTACCGTTTGATGAGTCTGTTGTAATGCCAGAATCCCAGAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTGCAGAAAGTTTTCTAGAGAATGCGAGGACCAGAAGCAAATTAAGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTGCAGAAAGTTTTCTAGAGAATGCGAGGACCAGAAGCAAATTAAGAAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CAGAAAGCTTTTCCAAACAGATTGTCCTTCGAGGAAAGAGCATCAAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CAGAAAGCTTTTCCAAACAGATTGTCCTTCGAGGAAAGAGCATCAAAAGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCCCCTGGAGAAGAAACCGAGAAAGAAGAAGAGGAGGAAGACAGGGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCCCCTGGAGAAGAAACCGAGAAAGAAGAAGAGGAGGAAGACAGGGAAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGAAGATGAAAATGGGTTGCCTAGAAGGAGGGGTCTTAGGAAAAAAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGAAGATGAAAATGGGTTGCCTAGAAGGAGGGGTCTTAGGAAAAAAAAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CAACAAAGCTGCGATTGGAAAGGGTCAAGTTCAGGAGACAGGAAGCGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CAACAAAGCTGCGATTGGAAAGGGTCAAGTTCAGGAGACAGGAAGCGAAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GCGCGCGAGAGGAACAGGATGCACGGCCTCAACGACGCTCTGGACAACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GCGCGCGAGAGGAACAGGATGCACGGCCTCAACGACGCTCTGGACAACTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AAGAAAAGTGGTCCCCTGTTATTCTAAAACCCAGAAACTGTCCAAAATAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AAGAAAAGTGGTCCCCTGTTATTCTAAAACCCAGAAACTGTCCAAAATAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGACTTTACGACTGGCCAAAAACTACATCTGGGCACTTTCTGAAATTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGACTTTACGACTGGCCAAAAACTACATCTGGGCACTTTCTGAAATTCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AGAATCGGCAAGAGACCAGATCTGCTCACATTCGTCCAAAACTTATGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AGAATCGGCAAGAGACCAGATCTGCTCACATTCGTCCAAAACTTATGCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 AGGTCTTTCCCAGCCAACTACAAACTTGGTGGCAGGCTGCTTGCAGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 AGGTCTTTCCCAGCCAACTACAAACTTGGTGGCAGGCTGCTTGCAGCTCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ACGCCAGGAGTTTCCTGATGGGTCAGGGTGGGGAGGCTGCACACCACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ACGCCAGGAGTTTCCTGATGGGTCAGGGTGGGGAGGCTGCACACCACACA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 AGGTCACCCTACTCTACCTTCTACCCACCCTACCACAGCCCTGAGCTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 AGGTCACCCTACTCTACCTTCTACCCACCCTACCACAGCCCTGAGCTCAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CACTCCCCCGGGGCATGGGACTCTTGATAATTCCAAGTCCATGAAACCCT
        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CACTCCCCCAGGGCATGGGACTCTTGATAATTCCAAGTCCATGAAACCCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ACAATTATTGCAGTGCGTATGAATCCTTCTATGAAAGTACTTCCCCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 ACAATTATTGCAGTGCGTATGAATCCTTCTATGAAAGTACTTCCCCTGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TGTGCCAGCCCTCAGTTTGAAGGTCCCTTAAGTCCTCCCCCAATTAACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TGTGCCAGCCCTCAGTTTGAAGGTCCCTTAAGTCCTCCCCCAATTAACTA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TAATGGGATATTTTCCCTGAAGCAAGAAGAAACCTTGGACTATGGTAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TAATGGGATATTTTCCCTGAAGCAAGAAGAAACCTTGGACTATGGTAAAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 ATTACAATTACGGCATGCATTACTGTGCAGTGCCACCCAGGGGTCCCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 ATTACAATTACGGCATGCATTACTGTGCAGTGCCACCCAGGGGTCCCCTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GGGCAGGGTGCCATGTTCAGGTTGCCCACCGACAGCCACTTCCCTTACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GGGCAGGGTGCCATGTTCAGGTTGCCCACCGACAGCCACTTCCCTTACGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CTTACATCTGCGCAGCCAATCTCTCACAATGCAAGATGAATTAAATGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CTTACATCTGCGCAGCCAATCTCTCACAATGCAAGATGAATTAAATGCAG

   1000     .    :
   1001 TTTTTCATAAT
        |||||||||||
 101001 TTTTTCATAAT