seq1 = pF1KB9627.tfa, 1146 bp
seq2 = pF1KB9627/gi568815581r_39505454.tfa (gi568815581r:39505454_39706599), 201146 bp

>pF1KB9627 1146
>gi568815581r:39505454_39706599 (Chr17)

(complement)

1-1146  (100001-101146)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTGACCCGCCTGTTCAGCGAGCCCGGCCTTCTCTCGGACGTGCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTGACCCGCCTGTTCAGCGAGCCCGGCCTTCTCTCGGACGTGCCCAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTTCGCCAGCTGGGGCGACGGCGAAGACGACGAGCCGAGGAGCGACAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTTCGCCAGCTGGGGCGACGGCGAAGACGACGAGCCGAGGAGCGACAAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCGACGCGCCGCCACCGCCACCGCCTGCGCCCGGGCCAGGGGCTCCGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCGACGCGCCGCCACCGCCACCGCCTGCGCCCGGGCCAGGGGCTCCGGGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCAGCCCGGGCGGCCAAGCCAGTCCCTCTCCGTGGAGAAGAGGGGACGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCAGCCCGGGCGGCCAAGCCAGTCCCTCTCCGTGGAGAAGAGGGGACGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGCCACGTTGGCCGAGGTCAAGGAGGAAGGCGAGCTGGGGGGAGAGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGCCACGTTGGCCGAGGTCAAGGAGGAAGGCGAGCTGGGGGGAGAGGAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGGAGGAAGAGGAGGAGGAAGAAGGACTGGACGAGGCGGAGGGCGAGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGGAGGAAGAGGAGGAGGAAGAAGGACTGGACGAGGCGGAGGGCGAGCGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CCCAAGAAGCGCGGGCCCAAGAAGCGCAAGATGACCAAGGCGCGCTTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CCCAAGAAGCGCGGGCCCAAGAAGCGCAAGATGACCAAGGCGCGCTTGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCGCTCCAAGCTTCGGCGGCAGAAGGCGAACGCGCGGGAGCGCAACCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GCGCTCCAAGCTTCGGCGGCAGAAGGCGAACGCGCGGGAGCGCAACCGCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGCACGACCTGAACGCAGCCCTGGACAACCTGCGCAAGGTGGTGCCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGCACGACCTGAACGCAGCCCTGGACAACCTGCGCAAGGTGGTGCCCTGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TACTCCAAGACGCAGAAGCTGTCCAAGATCGAGACGCTGCGCCTAGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TACTCCAAGACGCAGAAGCTGTCCAAGATCGAGACGCTGCGCCTAGCCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GAACTATATCTGGGCGCTCTCGGAGATCCTGCGCTCCGGCAAGCGGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GAACTATATCTGGGCGCTCTCGGAGATCCTGCGCTCCGGCAAGCGGCCAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ACCTAGTGTCCTACGTGCAGACTCTGTGCAAGGGTCTGTCGCAGCCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ACCTAGTGTCCTACGTGCAGACTCTGTGCAAGGGTCTGTCGCAGCCCACC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ACCAATCTGGTGGCCGGCTGTCTGCAGCTCAACTCTCGCAACTTCCTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ACCAATCTGGTGGCCGGCTGTCTGCAGCTCAACTCTCGCAACTTCCTCAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GGAGCAAGGCGCCGACGGTGCCGGCCGCTTCCACGGCTCGGGCGGCCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GGAGCAAGGCGCCGACGGTGCCGGCCGCTTCCACGGCTCGGGCGGCCCGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TCGCCATGCACCCCTACCCGTACCCGTGCTCGCGCCTGGCGGGCGCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TCGCCATGCACCCCTACCCGTACCCGTGCTCGCGCCTGGCGGGCGCACAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TGCCAGGCGGCCGGCGGCCTGGGCGGCGGCGCGGCGCACGCCCTGCGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TGCCAGGCGGCCGGCGGCCTGGGCGGCGGCGCGGCGCACGCCCTGCGGAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CCACGGCTACTGCGCCGCCTACGAGACGCTGTATGCGGCGGCAGGCGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CCACGGCTACTGCGCCGCCTACGAGACGCTGTATGCGGCGGCAGGCGGTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 GCGGCGCGAGCCCGGACTACAACAGCTCCGAGTACGAGGGCCCGCTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 GCGGCGCGAGCCCGGACTACAACAGCTCCGAGTACGAGGGCCCGCTCAGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CCCCCGCTCTGTCTCAATGGCAACTTCTCACTCAAGCAGGACTCCTCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CCCCCGCTCTGTCTCAATGGCAACTTCTCACTCAAGCAGGACTCCTCGCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CGACCACGAGAAAAGCTACCACTACTCTATGCACTACTCGGCGCTGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CGACCACGAGAAAAGCTACCACTACTCTATGCACTACTCGGCGCTGCCCG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 GTTCGCGGCCCACGGGCCACGGGCTAGTCTTCGGCTCGTCGGCTGTGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 GTTCGCGGCCCACGGGCCACGGGCTAGTCTTCGGCTCGTCGGCTGTGCGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GGGGGCGTCCACTCGGAGAATCTCTTGTCTTACGATATGCACCTTCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GGGGGCGTCCACTCGGAGAATCTCTTGTCTTACGATATGCACCTTCACCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1101 CGACCGGGGCCCCATGTACGAGGAGCTCAATGCGTTTTTTCATAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 CGACCGGGGCCCCATGTACGAGGAGCTCAATGCGTTTTTTCATAAC