seq1 = pF1KB9626.tfa, 405 bp
seq2 = pF1KB9626/gi568815597r_115737968.tfa (gi568815597r:115737968_115938372), 200405 bp

>pF1KB9626 405
>gi568815597r:115737968_115938372 (Chr1)

(complement)

1-405  (100001-100405)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATGCTGAGTCCGGACCAAGCAGCAGATTCGGACCATCCCAGCTCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATGCTGAGTCCGGACCAAGCAGCAGATTCGGACCATCCCAGCTCGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCACTCGGATCCGGAGTCCCTGGGCGGCACGGACACCAAGGTGCTCGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCACTCGGATCCGGAGTCCCTGGGCGGCACGGACACCAAGGTGCTCGGCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCGTGTCGGACCTGGAGCCGGTGGAGGAGGCCGAGGGCGACGGCAAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCGTGTCGGACCTGGAGCCGGTGGAGGAGGCCGAGGGCGACGGCAAGGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGCAGCCGAGCCGCGCTCTACCCGCACCCGCAGCAGCTGAGCCGCGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGCAGCCGAGCCGCGCTCTACCCGCACCCGCAGCAGCTGAGCCGCGAGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GAAGCGCCGCCGCCGGCGCGCCACGGCCAAGTACCGCTCGGCCCACGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GAAGCGCCGCCGCCGGCGCGCCACGGCCAAGTACCGCTCGGCCCACGCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCCGCGAGCGCATCCGCGTGGAAGCCTTCAACTTGGCCTTCGCCGAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CCCGCGAGCGCATCCGCGTGGAAGCCTTCAACTTGGCCTTCGCCGAGCTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CGCAAATTGCTGCCCACGCTGCCCCCGGACAAGAAGCTCTCCAAGATCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CGCAAATTGCTGCCCACGCTGCCCCCGGACAAGAAGCTCTCCAAGATCGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GATCCTGCGCCTGGCCATCTGCTACATCTCCTATCTCAACCACGTCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GATCCTGCGCCTGGCCATCTGCTACATCTCCTATCTCAACCACGTCCTGG

    400     .
    401 ACGTG
        |||||
 100401 ACGTG