seq1 = pF1KB9625.tfa, 399 bp
seq2 = pF1KB9625/gi568815597f_160270732.tfa (gi568815597f:160270732_160471130), 200399 bp

>pF1KB9625 399
>gi568815597f:160270732_160471130 (Chr1)

1-399  (100001-100399)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATGCTCAACTCAGACACCATGGAGCTGGACCTGCCGCCCACCCACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATGCTCAACTCAGACACCATGGAGCTGGACCTGCCGCCCACCCACTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGAGACTGAGTCGGGCTTCAGTGACTGTGGGGGCGGGGCGGGCCCTGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGAGACTGAGTCGGGCTTCAGTGACTGTGGGGGCGGGGCGGGCCCTGATG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GTGCCGGGCCTGGGGGTCCGGGAGGGGGCCAGGCCCGAGGCCCAGAGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GTGCCGGGCCTGGGGGTCCGGGAGGGGGCCAGGCCCGAGGCCCAGAGCCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGAGAGCCTGGCCGGAAAGACCTGCAGCATCTGAGCCGCGAGGAGCGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGAGAGCCTGGCCGGAAAGACCTGCAGCATCTGAGCCGCGAGGAGCGCCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCGCCGGCGCCGCGCCACAGCCAAGTACCGCACGGCCCACGCCACGCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCGCCGGCGCCGCGCCACAGCCAAGTACCGCACGGCCCACGCCACGCGAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AACGCATCCGCGTGGAAGCCTTCAACCTGGCCTTCGCCGAGCTGCGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AACGCATCCGCGTGGAAGCCTTCAACCTGGCCTTCGCCGAGCTGCGCAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGCTGCCTACGCTGCCCCCCGACAAGAAGCTCTCCAAGATTGAGATTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTGCTGCCTACGCTGCCCCCCGACAAGAAGCTCTCCAAGATTGAGATTCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    351 GCGCCTGGCCATCTGCTATATCTCCTACCTGAACCACGTGCTGGACGTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GCGCCTGGCCATCTGCTATATCTCCTACCTGAACCACGTGCTGGACGTC