seq1 = pF1KB9624.tfa, 1074 bp
seq2 = pF1KB9624/gi568815581f_20489293.tfa (gi568815581f:20489293_20690366), 201074 bp

>pF1KB9624 1074
>gi568815581f:20489293_20690366 (Chr17)

1-1074  (100001-101074)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCCGGAGGTACGATGAGCTGCCGCACTACCCAAGCATCGCGGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCCGGAGGTACGATGAGCTGCCGCACTACCCAAGCATCGCGGATGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCCCGCAGCCCTGGCTGGCTTCCCAGAGGCAGTGCCCGCGGCACCAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCCCGCAGCCCTGGCTGGCTTCCCAGAGGCAGTGCCCGCGGCACCAGGGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCTATGGCCCTCACCGGCCTCCCCAGCCCCTACCCCCAGGCTTGGACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCTATGGCCCTCACCGGCCTCCCCAGCCCCTACCCCCAGGCTTGGACAGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GACGGCCTGAAGAGGGACAAGGATGAGATCTATGGACACCCGCTCTTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GACGGCCTGAAGAGGGACAAGGATGAGATCTATGGACACCCGCTCTTCCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCTCTTGGCCCTGGTCTTTGAGAAATGTGAACTGGCTACATGCTCTCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCTCTTGGCCCTGGTCTTTGAGAAATGTGAACTGGCTACATGCTCTCCCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GTGATGGGGCCGGAGCTGGGCTGGGGACACCCCGCGGCGGCGACGTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GTGATGGGGCCGGAGCTGGGCTGGGGACACCCCGCGGCGGCGACGTCTGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TCCTCTGATTCCTTCAACGAGGACAACACTGCCTTCGCCAAGCAGGTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TCCTCTGATTCCTTCAACGAGGACAACACTGCCTTCGCCAAGCAGGTTCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTCTGAGAGGCCCTTCTTCTCCTCCAACCCAGAACTGGACAATCTGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTCTGAGAGGCCCTTCTTCTCCTCCAACCCAGAACTGGACAATCTGATGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCCAGGCCATCCAAGTGCTGCGGTTCCACCTGCTGGAGCTGGAGAAGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TCCAGGCCATCCAAGTGCTGCGGTTCCACCTGCTGGAGCTGGAGAAGGGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AAGATGCCCATCGACCTGGTCATCGAGGATCGGGATGGCGGCTGCAGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AAGATGCCCATCGACCTGGTCATCGAGGATCGGGATGGCGGCTGCAGGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GGACTTCGAGGACTACCCAGCCTCCTGCCTCAGCCTCCCAGACCAGAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GGACTTCGAGGACTACCCAGCCTCCTGCCTCAGCCTCCCAGACCAGAATA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ATATATGGATTCGAGACCATGAGGATAGCGGGTCTGTACATTTGGGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ATATATGGATTCGAGACCATGAGGATAGCGGGTCTGTACATTTGGGGACC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CCAGGTCCATCCAGCGGGGGCCTGGCCTCCCAGAGTGGGGACAACTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CCAGGTCCATCCAGCGGGGGCCTGGCCTCCCAGAGTGGGGACAACTCCAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TGACCAAGGAGTCGGGCTGGACACCAGCGTGGCCTCTCCCAGTTCTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TGACCAAGGAGTCGGGCTGGACACCAGCGTGGCCTCTCCCAGTTCTGGTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GAGAAGATGAGGACTTGGACCAGGAGCCACGGCGAAACAAGAAGAGGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GAGAAGATGAGGACTTGGACCAGGAGCCACGGCGAAACAAGAAGAGGGGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 ATCTTCCCCAAGGTGGCCACCAACATCATGCGAGCCTGGTTGTTCCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 ATCTTCCCCAAGGTGGCCACCAACATCATGCGAGCCTGGTTGTTCCAGCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CCTCTGGCACCCGTACCCCTCGGAGGAGCAGAAGAAACAGCTGGTGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CCTCTGGCACCCGTACCCCTCGGAGGAGCAGAAGAAACAGCTGGTGCAGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 ACACGGGGCTCACCATCCTGCAAGTCAACAACTGGTTCATTAATGCCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 ACACGGGGCTCACCATCCTGCAAGTCAACAACTGGTTCATTAATGCCCGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 AGACGCATGGTGCAACCTATGATCGATCAATCCAACCGCATAGGGCAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AGACGCATGGTGCAACCTATGATCGATCAATCCAACCGCATAGGGCAGGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 TGCAGCCTTCAGCCCAGAGGGCCAGCCCATCGGGGGCTATACCGAGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 TGCAGCCTTCAGCCCAGAGGGCCAGCCCATCGGGGGCTATACCGAGACAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 AGCCACACGTGGCCTTCCGGCCTCCAGCATCAGTGGGGATGAGTTTGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 AGCCACACGTGGCCTTCCGGCCTCCAGCATCAGTGGGGATGAGTTTGAAC

   1050     .    :    .    :
   1051 TTGGAAGGAGAATGGCATTATCTA
        ||||||||||||||||||||||||
 101051 TTGGAAGGAGAATGGCATTATCTA