seq1 = pF1KB9621.tfa, 2052 bp
seq2 = pF1KB9621/gi568815585r_41092206.tfa (gi568815585r:41092206_41294257), 202052 bp

>pF1KB9621 2052
>gi568815585r:41092206_41294257 (Chr13)

(complement)

1-2052  (100001-102052)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAGTCCCGGGAAGACGTCCCGCGCTCTCGCCGCCTCGCCAGTCCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCAGTCCCGGGAAGACGTCCCGCGCTCTCGCCGCCTCGCCAGTCCCCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGGTGGGAGGCGGCCCAAGAGGATTTCCAAGCCCTCGGTTTCGGCCTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGGTGGGAGGCGGCCCAAGAGGATTTCCAAGCCCTCGGTTTCGGCCTTTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCACGGGTCCAGAGGAGTTAAAGGACACGGCCCATTCTGCAGCCCTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCACGGGTCCAGAGGAGTTAAAGGACACGGCCCATTCTGCAGCCCTGCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCACAGCTCAAGTCCTTCTACGACGCGCGGCTGCTGTGTGATGTGACCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCACAGCTCAAGTCCTTCTACGACGCGCGGCTGCTGTGTGATGTGACCAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGAGGTGGTGACGCCTGGCAGCGGGCCTGGCACGGGTCGCCTCTTTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGAGGTGGTGACGCCTGGCAGCGGGCCTGGCACGGGTCGCCTCTTTTCCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCAATCGCAACGTGCTAGCAGCTGCGTGTCCCTACTTCAAGAGCATGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCAATCGCAACGTGCTAGCAGCTGCGTGTCCCTACTTCAAGAGCATGTTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ACAGGTGGCATGTACGAGAGCCAGCAGGCCAGCGTGACCATGCACGATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ACAGGTGGCATGTACGAGAGCCAGCAGGCCAGCGTGACCATGCACGATGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGACGCCGAGTCCTTCGAGGTGTTGGTCGACTACTGCTACACGGGTCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGACGCCGAGTCCTTCGAGGTGTTGGTCGACTACTGCTACACGGGTCGTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGTCTCTCAGTGAGGCCAATGTGCAGCGCCTGTACGCGGCCTCCGACATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGTCTCTCAGTGAGGCCAATGTGCAGCGCCTGTACGCGGCCTCCGACATG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CTACAGCTGGAATATGTGCGGGAAGCCTGTGCCTCCTTCTTAGCCCGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CTACAGCTGGAATATGTGCGGGAAGCCTGTGCCTCCTTCTTAGCCCGACG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TCTTGACCTGACCAACTGCACCGCCATCCTCAAGTTTGCAGACGCCTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TCTTGACCTGACCAACTGCACCGCCATCCTCAAGTTTGCAGACGCCTTCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ACCATCACAAGCTTCGATCTCAGGCCCAGTCCTACATAGCTCACAACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ACCATCACAAGCTTCGATCTCAGGCCCAGTCCTACATAGCTCACAACTTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 AAGCAGCTCAGCCGAATGGGTTCAATTCGGGAGGAGACTCTAGCAGATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 AAGCAGCTCAGCCGAATGGGTTCAATTCGGGAGGAGACTCTAGCAGATCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 AACCCTGGCCCAGCTGCTGGCTGTCCTACGCCTGGATAGTCTGGACATAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 AACCCTGGCCCAGCTGCTGGCTGTCCTACGCCTGGATAGTCTGGACATAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AGAGTGAGCGGACTGTATGCCATGTAGCTGTGCAGTGGCTGGAGGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AGAGTGAGCGGACTGTATGCCATGTAGCTGTGCAGTGGCTGGAGGCTGCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GCCAAAGAGCGGGGTCCCAGTGCTGCAGAAGTCTTCAAGTGCGTGCGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GCCAAAGAGCGGGGTCCCAGTGCTGCAGAAGTCTTCAAGTGCGTGCGCTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GATGCACTTCACTGAAGAAGATCAGGACTACTTAGAAGGGCTGCTGACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GATGCACTTCACTGAAGAAGATCAGGACTACTTAGAAGGGCTGCTGACCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 AGCCCATCGTGAAGAAGTACTGCCTGGACGTTATTGAAGGGGCCCTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 AGCCCATCGTGAAGAAGTACTGCCTGGACGTTATTGAAGGGGCCCTGCAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 ATGCGCTATGGTGACCTGTTGTACAAGTCTCTGGTGCCAGTGCCAAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 ATGCGCTATGGTGACCTGTTGTACAAGTCTCTGGTGCCAGTGCCAAACAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CAGCAGCAGCAGTAGCAGCAGCAACTCTCTTGTATCTGCAGCAGAAAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CAGCAGCAGCAGTAGCAGCAGCAACTCTCTTGTATCTGCAGCAGAAAATC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 CACCCCAGAGACTGGGTATGTGTGCCAAGGAGATGGTGATCTTCTTTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 CACCCCAGAGACTGGGTATGTGTGCCAAGGAGATGGTGATCTTCTTTGGA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 CACCCCAGAGATCCCTTTCTCTGCTATGACCCTTACTCGGGGGACATTTA
        || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 CATCCTAGAGATCCCTTTCTCTGCTATGACCCTTACTCGGGGGACATTTA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 CACAATGCCATCCCCTTTGACCAGCTTTGCTCACACTAAGACTGTCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 CACAATGCCATCCCCTTTGACCAGCTTTGCTCACACTAAGACTGTCACCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 CCTCAGCTGTCTGTGTGTCCCCAGACCATGACATCTATCTAGCTGCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 CCTCAGCTGTCTGTGTGTCCCCAGACCATGACATCTATCTAGCTGCTCAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 CCCAGGAAAGACCTCTGGGTGTATAAACCAGCTCAGAATAGTTGGCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 CCCAGGAAAGACCTCTGGGTGTATAAACCAGCTCAGAATAGTTGGCAGCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 ACTTGCAGATCGCTTGCTGTGTCGTGAGGGCATGGATGTGGCATATCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 ACTTGCAGATCGCTTGCTGTGTCGTGAGGGCATGGATGTGGCATATCTCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 ATGGCTACATCTACATTTTGGGGGGACGAGACCCTATTACTGGAGTTAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 ATGGCTACATCTACATTTTGGGGGGACGAGACCCTATTACTGGAGTTAAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 TTGAAGGAAGTGGAATGCTACAGTGTTCAGAGAAACCAGTGGGCATTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 TTGAAGGAAGTGGAATGCTACAGTGTTCAGAGAAACCAGTGGGCATTGGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 GGCTCCTGTCCCTCATTCCTTCTATTCCTTTGAACTCATAGTGGTTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 GGCTCCTGTCCCTCATTCCTTCTATTCCTTTGAACTCATAGTGGTTCAGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 ACTATCTTTATGCTGTCAACAGTAAGCGCATGCTTTGCTATGATCCTAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 ACTATCTTTATGCTGTCAACAGTAAGCGCATGCTTTGCTATGATCCTAGC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 CACAATATGTGGCTGAACTGTGCTTCTCTTAAACGTAGTGACTTTCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 CACAATATGTGGCTGAACTGTGCTTCTCTTAAACGTAGTGACTTTCAGGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 AGCATGTGTCTTCAATGATGAAATCTATTGTATCTGTGACATCCCAGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 AGCATGTGTCTTCAATGATGAAATCTATTGTATCTGTGACATCCCAGTCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 TGAAGGTCTACAACCCAGCTAGGGGAGAATGGAGGCGGATTAGTAATATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101601 TGAAGGTCTACAACCCAGCTAGGGGAGAATGGAGGCGGATTAGTAATATT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 CCTTTGGATTCAGAGACCCACAACTACCAGATTGTCAATCATGACCAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101651 CCTTTGGATTCAGAGACCCACAACTACCAGATTGTCAATCATGACCAAAA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1701 GTTGCTTCTCATCACTTCTACAACCCCACAATGGAAAAAGAACCGAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101701 GTTGCTTCTCATCACTTCTACAACCCCACAATGGAAAAAGAACCGAGTGA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1751 CAGTGTATGAGTATGATACTAGGGAAGATCAGTGGATTAATATAGGTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101751 CAGTGTATGAGTATGATACTAGGGAAGATCAGTGGATTAATATAGGTACC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1801 ATGTTAGGCCTTTTGCAGTTTGACTCTGGCTTTATTTGCCTTTGTGCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101801 ATGTTAGGCCTTTTGCAGTTTGACTCTGGCTTTATTTGCCTTTGTGCTCG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1851 TGTTTATCCTTCCTGCCTTGAACCTGGTCAGAGTTTTATTACTGAGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101851 TGTTTATCCTTCCTGCCTTGAACCTGGTCAGAGTTTTATTACTGAGGAAG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1901 ATGATGCACGGAGTGAGTCTAGTACTGAATGGGACTTAGATGGATTCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101901 ATGATGCACGGAGTGAGTCTAGTACTGAATGGGACTTAGATGGATTCAGT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1951 GAGCTGGACTCTGAGTCAGGAAGTTCAAGTTCTTTTTCAGATGATGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101951 GAGCTGGACTCTGAGTCAGGAAGTTCAAGTTCTTTTTCAGATGATGAAGT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2001 CTGGGTGCAAGTAGCACCTCAGCGAAATGCACAGGATCAGCAGGGTTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102001 CTGGGTGCAAGTAGCACCTCAGCGAAATGCACAGGATCAGCAGGGTTCTT

   2050 
   2051 TG
        ||
 102051 TG