seq1 = pF1KB9616.tfa, 669 bp
seq2 = pF1KB9616/gi568815579f_13053187.tfa (gi568815579f:13053187_13253855), 200669 bp

>pF1KB9616 669
>gi568815579f:13053187_13253855 (Chr19)

1-669  (100001-100669)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAAGTGCAGAAAGAGGCACAGCGCATCATGACCCTGTCGGTGTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAAGTGCAGAAAGAGGCACAGCGCATCATGACCCTGTCGGTGTGGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GATGTATCACTCCCGCATGCAGCGCGGTGGCCTGCGGCTGCACCGGAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GATGTATCACTCCCGCATGCAGCGCGGTGGCCTGCGGCTGCACCGGAGTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGCAGCTGTCGCTGGTCATGCGCAGCGCCCGGGAGCTCTACCTCTCGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGCAGCTGTCGCTGGTCATGCGCAGCGCCCGGGAGCTCTACCTCTCGGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AAGGTGGAGGCCCTCGAGCCCGAGGTGTCGTTGCCGGCCGCCCTCCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AAGGTGGAGGCCCTCGAGCCCGAGGTGTCGTTGCCGGCCGCCCTCCCCTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGACCCTCGCCTGCACCCGCCCCGAGAAGCCGAGTCCACGGCCGAGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGACCCTCGCCTGCACCCGCCCCGAGAAGCCGAGTCCACGGCCGAGACAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CGACCCCCGACGGTGAGCACCCGTTTCCGGAGCCAATGGACACGCAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CGACCCCCGACGGTGAGCACCCGTTTCCGGAGCCAATGGACACGCAGGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GCGCCGACAGCCGAGGAGACCTCCGCCTGCTGTGCCCCGCGCCCCGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GCGCCGACAGCCGAGGAGACCTCCGCCTGCTGTGCCCCGCGCCCCGCCAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AGTCAGCCGCAAACGACGCAGCAGCAGCCTGAGCGACGGCGGGGACGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AGTCAGCCGCAAACGACGCAGCAGCAGCCTGAGCGACGGCGGGGACGCTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GACTGGTCCCGAGCAAGAAAGCCCGTCTGGAAGAAAAGGAAGAAGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GACTGGTCCCGAGCAAGAAAGCCCGTCTGGAAGAAAAGGAAGAAGAGGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GGAGCGTCATCCGAAGTCGCCGATCGCCTGCAGCCCCCTCCGGCGCAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GGAGCGTCATCCGAAGTCGCCGATCGCCTGCAGCCCCCTCCGGCGCAAGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GGAGGGCGCCTTTCCCAACCTGGCCCGCGTCCTGCAGAGGCGCTTCTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GGAGGGCGCCTTTCCCAACCTGGCCCGCGTCCTGCAGAGGCGCTTCTCCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GCCTCCTGAACTGCAGCCCCGCGGCCCCTCCGACGGCGCCGCCCGCGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GCCTCCTGAACTGCAGCCCCGCGGCCCCTCCGACGGCGCCGCCCGCGTGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GAGGCAAAGCCCGCTTGCCGCCCGGCGGACAGCATGCTCAACGTGCTCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GAGGCAAAGCCCGCTTGCCGCCCGGCGGACAGCATGCTCAACGTGCTCGT

    650     .    :    .
    651 GCGGGCCGTGGTGGCCTTC
        |||||||||||||||||||
 100651 GCGGGCCGTGGTGGCCTTC