seq1 = pF1KB9611.tfa, 1767 bp
seq2 = pF1KB9611/gi568815583r_85668044.tfa (gi568815583r:85668044_85869810), 201767 bp

>pF1KB9611 1767
>gi568815583r:85668044_85869810 (Chr15)

(complement)

1-1767  (100001-101767)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCGGTCAGTGTCCATGAGACCCGCAAGTCGCGGAGCAGCACGGGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCGGTCAGTGTCCATGAGACCCGCAAGTCGCGGAGCAGCACGGGGTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CATGAACGTCACCCTCTTCCACAAGGCCTCCCACCCGGACTGTGTGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CATGAACGTCACCCTCTTCCACAAGGCCTCCCACCCGGACTGTGTGCTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCCACCTCAACACGCTTCGCAAGCACTGCATGTTCACCGACGTCACACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCCACCTCAACACGCTTCGCAAGCACTGCATGTTCACCGACGTCACACTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TGGGCGGGCGACCGTGCCTTCCCCTGTCACCGTGCCGTGCTGGCCGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TGGGCGGGCGACCGTGCCTTCCCCTGTCACCGTGCCGTGCTGGCCGCCTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TAGCCGCTATTTTGAGGCCATGTTCAGCCATGGCCTTCGGGAGAGCCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TAGCCGCTATTTTGAGGCCATGTTCAGCCATGGCCTTCGGGAGAGCCGGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ATGACACTGTCAACTTCCAGGACAACCTGCACCCGGAGGTGCTGGAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ATGACACTGTCAACTTCCAGGACAACCTGCACCCGGAGGTGCTGGAGCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGCTGGACTTTGCCTACTCCTCACGCATCGCCATCAACGAGGAGAACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTGCTGGACTTTGCCTACTCCTCACGCATCGCCATCAACGAGGAGAACGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGAGTCACTGTTGGAGGCAGGCGACATGCTGCAGTTCCACGATGTGCGGG
        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TGAGTCACTGCTGGAGGCAGGCGACATGCTGCAGTTCCACGATGTGCGGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ATGCTGCCGCCGAGTTCCTGGAGAAGAACCTTTTCCCCTCCAACTGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ATGCTGCCGCCGAGTTCCTGGAGAAGAACCTTTTCCCCTCCAACTGCCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GGCATGATGCTGCTCTCGGACGCCCACCAGTGCCGCCGGCTGTATGAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GGCATGATGCTGCTCTCGGACGCCCACCAGTGCCGCCGGCTGTATGAGTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTCCTGGCGCATGTGCCTGGTGCACTTTGAGACGGTGAGGCAGAGCGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTCCTGGCGCATGTGCCTGGTGCACTTTGAGACGGTGAGGCAGAGCGAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ACTTCAACAGCCTGTCCAAGGACACACTGCTGGACCTCATCTCGAGTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ACTTCAACAGCCTGTCCAAGGACACACTGCTGGACCTCATCTCGAGTGAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GAGCTGGAGACCGAGGACGAGCGGGTGGTCTTCGAGGCCATCCTCCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GAGCTGGAGACCGAGGACGAGCGGGTGGTCTTCGAGGCCATCCTCCAGTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GGTGAAGCACGACCTGGAGCCACGGAAGGTCCACTTGCCCGAGCTCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GGTGAAGCACGACCTGGAGCCACGGAAGGTCCACTTGCCCGAGCTCCTCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GCAGCGTGCGTCTGGCCTTGCTGCCGTCCGACTGCCTGCAGGAGGCCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GCAGCGTGCGTCTGGCCTTGCTGCCGTCCGACTGCCTGCAGGAGGCCGTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TCCAGCGAGGCCCTCCTCATGGCAGACGAGCGCACCAAGCTTATCATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TCCAGCGAGGCCCTCCTCATGGCAGACGAGCGCACCAAGCTTATCATGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TGAGGCCCTGCGCTGCAAGACCAGGATCCTGCAGAATGATGGCGTGGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TGAGGCCCTGCGCTGCAAGACCAGGATCCTGCAGAATGATGGCGTGGTCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CCAGCCCCTGTGCCCGGCCACGCAAGGCGGGCCACACGCTACTCATCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CCAGCCCCTGTGCCCGGCCACGCAAGGCGGGCCACACGCTACTCATCCTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GGGGGCCAGACCTTCATGTGTGACAAGATCTACCAGGTGGACCACAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GGGGGCCAGACCTTCATGTGTGACAAGATCTACCAGGTGGACCACAAGGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CAAGGAGATCATCCCCAAGGCCGACCTGCCCAGCCCCCGGAAGGAGTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CAAGGAGATCATCCCCAAGGCCGACCTGCCCAGCCCCCGGAAGGAGTTCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 GCGCCTCAGCGATCGGCTGCAAGGTCTATGTGACGGGGGGCAGGGGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 GCGCCTCAGCGATCGGCTGCAAGGTCTATGTGACGGGGGGCAGGGGCTCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GAGAACGGGGTCTCCAAGGATGTCTGGGTGTACGACACCGTACATGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GAGAACGGGGTCTCCAAGGATGTCTGGGTGTACGACACCGTACATGAGGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 ATGGTCCAAGGCGGCGCCCATGCTGATTGCCCGCTTTGGCCATGGCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 ATGGTCCAAGGCGGCGCCCATGCTGATTGCCCGCTTTGGCCATGGCTCAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 CTGAGCTGGAGAACTGCCTCTATGTGGTGGGGGGACACACATCCCTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 CTGAGCTGGAGAACTGCCTCTATGTGGTGGGGGGACACACATCCCTGGCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 GGGGTCTTCCCGGCCTCGCCTTCTGTCTCCCTGAAACAAGTGGAGAAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 GGGGTCTTCCCGGCCTCGCCTTCTGTCTCCCTGAAACAAGTGGAGAAATA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 CGACCCTGGGGCCAACAAGTGGATGATGGTGGCCCCCTTGCGGGATGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 CGACCCTGGGGCCAACAAGTGGATGATGGTGGCCCCCTTGCGGGATGGCG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 TCAGCAATGCCGCAGTGGTGAGTGCCAAGCTGAAGCTCTTTGTTTTTGGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
 101301 TCAGCAATGCCGCAGTGGTGAGTGCCAAGCTGAAGCTCTTTGTTTTCGGA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 GGAACCAGCATCCACCGGGACATGGTGTCCAAGGTCCAGTGCTATGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 GGAACCAGCATCCACCGGGACATGGTGTCCAAGGTCCAGTGCTATGACCC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 CTCGGAGAACAGGTGGACGATCAAGGCCGAGTGCCCCCAGCCTTGGCGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 CTCGGAGAACAGGTGGACGATCAAGGCCGAGTGCCCCCAGCCTTGGCGGT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 ACACAGCCGCTGCCGTCCTGGGCAGCCAGATCTTCATCATGGGAGGTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 ACACAGCCGCTGCCGTCCTGGGCAGCCAGATCTTCATCATGGGAGGTGAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 ACGGAATTCACAGCCGCCTCGGCCTACCGCTTTGACTGTGAGACCAACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 ACGGAATTCACAGCCGCCTCGGCCTACCGCTTTGACTGTGAGACCAACCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 GTGGACGCGGATTGGGGACATGACTGCCAAGCGCATGTCCTGCCATGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 GTGGACGCGGATTGGGGACATGACTGCCAAGCGCATGTCCTGCCATGCCC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 TGGCTTCCGGCAACAAGCTCTATGTGGTCGGGGGCTACTTTGGGACCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101601 TGGCTTCCGGCAACAAGCTCTATGTGGTCGGGGGCTACTTTGGGACCCAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 AGGTGTAAGACTCTGGACTGCTATGACCCCACTTCAGATACATGGAACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101651 AGGTGTAAGACTCTGGACTGCTATGACCCCACTTCAGATACATGGAACTG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1701 CATCACCACAGTGCCCTACTCACTTATCCCCACGGCCTTTGTCAGCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101701 CATCACCACAGTGCCCTACTCACTTATCCCCACGGCCTTTGTCAGCACCT

   1750     .    :    .
   1751 GGAAGCACCTGCCCGCG
        |||||||||||||||||
 101751 GGAAGCACCTGCCCGCG