seq1 = pF1KB9595.tfa, 1659 bp
seq2 = pF1KB9595/gi568815592f_1510446.tfa (gi568815592f:1510446_1712104), 201659 bp

>pF1KB9595 1659
>gi568815592f:1510446_1712104 (Chr6)

1-1659  (100001-101659)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAGGCGCGCTACTCCGTGTCCAGCCCCAACTCCCTGGGAGTGGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCAGGCGCGCTACTCCGTGTCCAGCCCCAACTCCCTGGGAGTGGTGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTACCTCGGCGGCGAGCAGAGCTACTACCGCGCGGCGGCCGCGGCGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTACCTCGGCGGCGAGCAGAGCTACTACCGCGCGGCGGCCGCGGCGGCCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGGGCGGCTACACCGCCATGCCGGCCCCCATGAGCGTGTACTCGCACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGGGCGGCTACACCGCCATGCCGGCCCCCATGAGCGTGTACTCGCACCCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCGCACGCCGAGCAGTACCCGGGCGGCATGGCCCGCGCCTACGGGCCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCGCACGCCGAGCAGTACCCGGGCGGCATGGCCCGCGCCTACGGGCCCTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CACGCCGCAGCCGCAGCCCAAGGACATGGTGAAGCCGCCCTATAGCTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CACGCCGCAGCCGCAGCCCAAGGACATGGTGAAGCCGCCCTATAGCTACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCGCGCTCATCACCATGGCCATCCAGAACGCCCCGGACAAGAAGATCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCGCGCTCATCACCATGGCCATCCAGAACGCCCCGGACAAGAAGATCACC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGAACGGCATCTACCAGTTCATCATGGACCGCTTCCCCTTCTACCGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTGAACGGCATCTACCAGTTCATCATGGACCGCTTCCCCTTCTACCGGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CAACAAGCAGGGCTGGCAGAACAGCATCCGCCACAACCTCTCGCTCAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CAACAAGCAGGGCTGGCAGAACAGCATCCGCCACAACCTCTCGCTCAACG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGTGCTTCGTCAAGGTGCCGCGCGACGACAAGAAGCCGGGCAAGGGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGTGCTTCGTCAAGGTGCCGCGCGACGACAAGAAGCCGGGCAAGGGCAGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TACTGGACGCTGGACCCGGACTCCTACAACATGTTCGAGAACGGCAGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TACTGGACGCTGGACCCGGACTCCTACAACATGTTCGAGAACGGCAGCTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CCTGCGGCGGCGGCGGCGCTTCAAGAAGAAGGACGCGGTGAAGGACAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CCTGCGGCGGCGGCGGCGCTTCAAGAAGAAGGACGCGGTGAAGGACAAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AGGAGAAGGACAGGCTGCACCTCAAGGAGCCGCCCCCGCCCGGCCGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AGGAGAAGGACAGGCTGCACCTCAAGGAGCCGCCCCCGCCCGGCCGCCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CCCCCGCCCGCGCCGCCGGAGCAGGCCGACGGCAACGCGCCCGGTCCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CCCCCGCCCGCGCCGCCGGAGCAGGCCGACGGCAACGCGCCCGGTCCGCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GCCGCCGCCCGTGCGCATCCAGGACATCAAGACCGAGAACGGTACGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GCCGCCGCCCGTGCGCATCCAGGACATCAAGACCGAGAACGGTACGTGCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CCTCGCCGCCCCAGCCCCTGTCCCCGGCCGCCGCCCTGGGCAGCGGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CCTCGCCGCCCCAGCCCCTGTCCCCGGCCGCCGCCCTGGGCAGCGGCAGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GCCGCCGCGGTGCCCAAGATCGAGAGCCCCGACAGCAGCAGCAGCAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GCCGCCGCGGTGCCCAAGATCGAGAGCCCCGACAGCAGCAGCAGCAGCCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GTCCAGCGGGAGCAGCCCCCCGGGCAGCCTGCCGTCGGCGCGGCCGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GTCCAGCGGGAGCAGCCCCCCGGGCAGCCTGCCGTCGGCGCGGCCGCTCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 GCCTGGACGGTGCGGATTCCGCGCCGCCGCCGCCCGCGCCCTCCGCCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 GCCTGGACGGTGCGGATTCCGCGCCGCCGCCGCCCGCGCCCTCCGCCCCG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CCGCCGCACCATAGCCAGGGCTTCAGCGTGGACAACATCATGACGTCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CCGCCGCACCATAGCCAGGGCTTCAGCGTGGACAACATCATGACGTCGCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GCGGGGGTCGCCGCAGAGCGCGGCCGCGGAGCTCAGCTCCGGCCTTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GCGGGGGTCGCCGCAGAGCGCGGCCGCGGAGCTCAGCTCCGGCCTTCTGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 CCTCGGCGGCCGCGTCCTCGCGCGCGGGGATCGCACCCCCGCTGGCGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 CCTCGGCGGCCGCGTCCTCGCGCGCGGGGATCGCACCCCCGCTGGCGCTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GGCGCCTACTCGCCCGGCCAGAGCTCCCTCTACAGCTCCCCCTGCAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GGCGCCTACTCGCCCGGCCAGAGCTCCCTCTACAGCTCCCCCTGCAGCCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 GACCTCCAGCGCGGGCAGCTCGGGCGGCGGCGGCGGCGGCGCGGGGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 GACCTCCAGCGCGGGCAGCTCGGGCGGCGGCGGCGGCGGCGCGGGGGCCG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 CGGGGGGCGCGGGCGGCGCCGGGACCTACCACTGCAACCTGCAAGCCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 CGGGGGGCGCGGGCGGCGCCGGGACCTACCACTGCAACCTGCAAGCCATG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 AGCCTGTACGCGGCCGGCGAGCGCGGGGGCCACTTGCAGGGCGCGCCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 AGCCTGTACGCGGCCGGCGAGCGCGGGGGCCACTTGCAGGGCGCGCCCGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 GGGCGCGGGCGGCTCGGCCGTGGACGACCCCCTGCCCGACTACTCTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 GGGCGCGGGCGGCTCGGCCGTGGACGACCCCCTGCCCGACTACTCTCTGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 CTCCGGTCACCAGCAGCAGCTCGTCGTCCCTGAGTCACGGCGGCGGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 CTCCGGTCACCAGCAGCAGCTCGTCGTCCCTGAGTCACGGCGGCGGCGGC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 GGCGGCGGCGGGGGAGGCCAGGAGGCCGGCCACCACCCTGCGGCCCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 GGCGGCGGCGGGGGAGGCCAGGAGGCCGGCCACCACCCTGCGGCCCACCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 AGGCCGCCTCACCTCGTGGTACCTGAACCAGGCGGGCGGAGACCTGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 AGGCCGCCTCACCTCGTGGTACCTGAACCAGGCGGGCGGAGACCTGGGCC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 ACTTGGCGAGCGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCCGCAGGCTACCCGGGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 ACTTGGCGAGCGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCCGCAGGCTACCCGGGCCAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 CAGCAGAACTTCCACTCGGTGCGGGAGATGTTCGAGTCACAGAGGATCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 CAGCAGAACTTCCACTCGGTGCGGGAGATGTTCGAGTCACAGAGGATCGG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 CTTGAACAACTCTCCAGTGAACGGGAATAGTAGCTGTCAAATGGCCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 CTTGAACAACTCTCCAGTGAACGGGAATAGTAGCTGTCAAATGGCCTTCC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 CTTCCAGCCAGTCTCTGTACCGCACGTCCGGAGCTTTCGTCTACGACTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101601 CTTCCAGCCAGTCTCTGTACCGCACGTCCGGAGCTTTCGTCTACGACTGT

   1650     .
   1651 AGCAAGTTT
        |||||||||
 101651 AGCAAGTTT