seq1 = pF1KB9594.tfa, 975 bp
seq2 = pF1KB9594/gi568815583f_59904964.tfa (gi568815583f:59904964_60105938), 200975 bp

>pF1KB9594 975
>gi568815583f:59904964_60105938 (Chr15)

1-975  (100001-100975)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCTCGGCCCGGCCGCAACACGTACAGCGACCAGAAGCCGCCCTACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCTCGGCCCGGCCGCAACACGTACAGCGACCAGAAGCCGCCCTACTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTACATCTCGCTGACCGCTATGGCCATCCAGAGCTCTCCCGAGAAGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTACATCTCGCTGACCGCTATGGCCATCCAGAGCTCTCCCGAGAAGATGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGCCGCTGAGCGAGATCTACAAGTTCATCATGGACCGCTTCCCCTACTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGCCGCTGAGCGAGATCTACAAGTTCATCATGGACCGCTTCCCCTACTAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AGGGAGAACACGCAGCGCTGGCAGAACAGTCTGCGCCACAACCTCTCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AGGGAGAACACGCAGCGCTGGCAGAACAGTCTGCGCCACAACCTCTCCTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAACGACTGCTTCATCAAGATCCCGCGGCGGCCGGACCAGCCAGGCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAACGACTGCTTCATCAAGATCCCGCGGCGGCCGGACCAGCCAGGCAAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCAGCTTCTGGGCGCTGCACCCAAGCTGCGGGGACATGTTCGAGAACGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCAGCTTCTGGGCGCTGCACCCAAGCTGCGGGGACATGTTCGAGAACGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AGCTTCCTGCGGCGCCGCAAGCGCTTCAAGGTGCTTAAGTCCGACCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AGCTTCCTGCGGCGCCGCAAGCGCTTCAAGGTGCTTAAGTCCGACCACCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGCGCCCAGCAAGCCAGCCGACGCGGCGCAGTACCTGCAGCAGCAGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGCGCCCAGCAAGCCAGCCGACGCGGCGCAGTACCTGCAGCAGCAGGCCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGCTGCGGCTCAGCGCGCTGGCGGCCTCGGGCACGCACCTGCCACAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGCTGCGGCTCAGCGCGCTGGCGGCCTCGGGCACGCACCTGCCACAGATG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CCCGCCGCCGCCTACAACTTGGGCGGCGTGGCGCAGCCCTCGGGCTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CCCGCCGCCGCCTACAACTTGGGCGGCGTGGCGCAGCCCTCGGGCTTCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GCACCCCTTCGCCATCGAGAACATCATCGCGCGGGAATACAAGATGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GCACCCCTTCGCCATCGAGAACATCATCGCGCGGGAATACAAGATGCCTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GGGGGCTGGCCTTCTCCGCCATGCAGCCGGTGCCCGCTGCCTACCCGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GGGGGCTGGCCTTCTCCGCCATGCAGCCGGTGCCCGCTGCCTACCCGCTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CCCAACCAGTTGACTACCATGGGCAGCTCGCTGGGCACCGGCTGGCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CCCAACCAGTTGACTACCATGGGCAGCTCGCTGGGCACCGGCTGGCCACA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CGTGTATGGCTCCGCCGGCATGATCGACTCGGCCACCCCCATCTCCATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CGTGTATGGCTCCGCCGGCATGATCGACTCGGCCACCCCCATCTCCATGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CGAGTGGCGACTACAGCGCCTACGGCGTGCCGTTGAAGCCGCTGTGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CGAGTGGCGACTACAGCGCCTACGGCGTGCCGTTGAAGCCGCTGTGCCAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GCGGCGGGCCAAACGCTGCCCGCCATCCCCGTGCCCATTAAGCCCACGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GCGGCGGGCCAAACGCTGCCCGCCATCCCCGTGCCCATTAAGCCCACGCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GGCCGCCGTGCCCGCGCTGCCTGCGCTGCCAGCGCCCATCCCCACCTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GGCCGCCGTGCCCGCGCTGCCTGCGCTGCCAGCGCCCATCCCCACCTTGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TCTCGAACTCGCCGCCCTCGCTCAGCCCCACGTCCTCGCAAACAGCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TCTCGAACTCGCCGCCCTCGCTCAGCCCCACGTCCTCGCAAACAGCCACC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 AGCCAAAGCAGCCCCGCCACCCCCAGCGAAACGCTCACCAGCCCGGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AGCCAAAGCAGCCCCGCCACCCCCAGCGAAACGCTCACCAGCCCGGCCTC

    950     .    :    .    :    .
    951 CGCCTTGCACTCGGTGGCGGTGCAC
        |||||||||||||||||||||||||
 100951 CGCCTTGCACTCGGTGGCGGTGCAC