seq1 = pF1KB9593.tfa, 990 bp
seq2 = pF1KB9593/gi568815578r_31744553.tfa (gi568815578r:31744553_31945542), 200990 bp

>pF1KB9593 990
>gi568815578r:31744553_31945542 (Chr20)

(complement)

1-990  (100001-100990)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAGCAGCAGCCTCTGCCCGGGCCTGGCGCCCCCACAACTGAGCCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCAGCAGCAGCCTCTGCCCGGGCCTGGCGCCCCCACAACTGAGCCAAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAAGCCTCCCTACAGCTACATCGCCCTTATTGCTATGGCCATCCAGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAAGCCTCCCTACAGCTACATCGCCCTTATTGCTATGGCCATCCAGAGCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CACCGGGGCAGCGGGCCACCCTCAGTGGCATCTACCGCTACATCATGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CACCGGGGCAGCGGGCCACCCTCAGTGGCATCTACCGCTACATCATGGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGATTCGCCTTCTACCGCCACAACCGGCCCGGCTGGCAGAACAGCATCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CGATTCGCCTTCTACCGCCACAACCGGCCCGGCTGGCAGAACAGCATCCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCACAACCTGTCACTCAACGAGTGCTTTGTCAAGGTGCCCCGCGATGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCACAACCTGTCACTCAACGAGTGCTTTGTCAAGGTGCCCCGCGATGACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCAAGCCAGGCAAGGGCAGCTACTGGACGCTGGACCCTGACTGCCACGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCAAGCCAGGCAAGGGCAGCTACTGGACGCTGGACCCTGACTGCCACGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATGTTTGAGCACGGCAGCTTCCTACGCCGCCGCCGCCGCTTCACCCGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ATGTTTGAGCACGGCAGCTTCCTACGCCGCCGCCGCCGCTTCACCCGGCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GACAGGTGCTGAGGGCACCCGGGGCCCCGCCAAGGCACGCCGTGGACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GACAGGTGCTGAGGGCACCCGGGGCCCCGCCAAGGCACGCCGTGGACCCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCAGGGCGACCAGCCAGGACCCAGGAGTCCCCAACGCCACGACCGGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TCAGGGCGACCAGCCAGGACCCAGGAGTCCCCAACGCCACGACCGGCAGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CAGTGCTCATTCCCACCAGAGCTGCCAGATCCCAAGGGCCTAAGCTTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CAGTGCTCATTCCCACCAGAGCTGCCAGATCCCAAGGGCCTAAGCTTTGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GGGTCTGGTGGGGGCCATGCCAGCCAGTATGTGCCCAGCAACCACTGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GGGTCTGGTGGGGGCCATGCCAGCCAGTATGTGCCCAGCAACCACTGATG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GCAGGCCTCGGCCACCCATGGAGCCCAAAGAGATTTCCACGCCCAAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GCAGGCCTCGGCCACCCATGGAGCCCAAAGAGATTTCCACGCCCAAGCCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GCATGCCCAGGGGAGCTCCCCGTGGCCACCTCATCTTCCTCATGCCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GCATGCCCAGGGGAGCTCCCCGTGGCCACCTCATCTTCCTCATGCCCAGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GTTTGGCTTTCCTGCCGGCTTCTCAGAGGCTGAGAGTTTTAATAAGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GTTTGGCTTTCCTGCCGGCTTCTCAGAGGCTGAGAGTTTTAATAAGGCCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CTACGCCCGTCTTGTCCCCGGAATCAGGCATCGGGAGCAGCTACCAGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CTACGCCCGTCTTGTCCCCGGAATCAGGCATCGGGAGCAGCTACCAGTGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CGGCTGCAGGCACTGAATTTTTGCATGGGGGCTGACCCAGGCCTTGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CGGCTGCAGGCACTGAATTTTTGCATGGGGGCTGACCCAGGCCTTGAGCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CCTCTTGGCCTCAGCAGCCCCCTCCCCTGCACCACCCACCCCTCCAGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CCTCTTGGCCTCAGCAGCCCCCTCCCCTGCACCACCCACCCCTCCAGGCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CACTCCGGGCCCCACTGCCCCTGCCAACTGACCACAAGGAACCCTGGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CACTCCGGGCCCCACTGCCCCTGCCAACTGACCACAAGGAACCCTGGGTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GCAGGTGGCTTCCCTGTCCAGGGAGGCTCCGGCTACCCATTGGGGCTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GCAGGTGGCTTCCCTGTCCAGGGAGGCTCCGGCTACCCATTGGGGCTGAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CCCCTGCCTATACCGGACGCCAGGAATGTTCTTCTTTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CCCCTGCCTATACCGGACGCCAGGAATGTTCTTCTTTGAG