seq1 = pF1KB9591.tfa, 1767 bp
seq2 = pF1KB9591/gi568815593r_74534719.tfa (gi568815593r:74534719_74736485), 201767 bp

>pF1KB9591 1767
>gi568815593r:74534719_74736485 (Chr5)

(complement)

1-1767  (100001-101767)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCAGTCAGTGTGCATGAGAACCGCAAGTCCAGGGCCAGCAGCGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCAGTCAGTGTGCATGAGAACCGCAAGTCCAGGGCCAGCAGCGGCTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CATTAACATCTATCTGTTTCACAAGTCCTCCTACGCTGACAGCGTCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CATTAACATCTATCTGTTTCACAAGTCCTCCTACGCTGACAGCGTCCTCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTCACCTGAATCTTTTACGCCAGCAGCGTCTCTTCACTGACGTCCTTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTCACCTGAATCTTTTACGCCAGCAGCGTCTCTTCACTGACGTCCTTCTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CATGCCGGAAATAGGACCTTCCCTTGCCACCGGGCAGTGCTGGCTGCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CATGCCGGAAATAGGACCTTCCCTTGCCACCGGGCAGTGCTGGCTGCATG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAGTCGCTACTTTGAGGCCATGTTCAGTGGTGGCCTGAAAGAGAGCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAGTCGCTACTTTGAGGCCATGTTCAGTGGTGGCCTGAAAGAGAGCCAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACAGTGAGGTCAACTTTGACAATTCCATCCACCCAGAAGTCTTGGAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACAGTGAGGTCAACTTTGACAATTCCATCCACCCAGAAGTCTTGGAGCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGCTTGACTATGCGTACTCCTCCCGGGTCATCATCAATGAAGAAAATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTGCTTGACTATGCGTACTCCTCCCGGGTCATCATCAATGAAGAAAATGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AGAATCGCTCCTGGAAGCTGGTGACATGCTGGAGTTTCAAGACATCCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AGAATCGCTCCTGGAAGCTGGTGACATGCTGGAGTTTCAAGACATCCGGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ATGCATGTGCAGAGTTCCTGGAAAAGAACCTGCATCCCACCAACTGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ATGCATGTGCAGAGTTCCTGGAAAAGAACCTGCATCCCACCAACTGCCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GGCATGCTGCTGCTGTCTGATGCACACCAGTGCACCAAGCTGTACGAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GGCATGCTGCTGCTGTCTGATGCACACCAGTGCACCAAGCTGTACGAACT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 ATCTTGGAGAATGTGTCTCAGCAACTTCCAAACCATCAGGAAGAATGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 ATCTTGGAGAATGTGTCTCAGCAACTTCCAAACCATCAGGAAGAATGAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ATTTCCTCCAGCTGCCCCAGGACATGGTAGTGCAACTCTTGTCCAGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ATTTCCTCCAGCTGCCCCAGGACATGGTAGTGCAACTCTTGTCCAGTGAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GAGCTGGAGACAGAGGATGAAAGGCTTGTGTACGAGTCTGCAATTAACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GAGCTGGAGACAGAGGATGAAAGGCTTGTGTACGAGTCTGCAATTAACTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GATCAGCTATGACCTGAAGAAGCGCTATTGCTACCTCCCAGAACTGTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GATCAGCTATGACCTGAAGAAGCGCTATTGCTACCTCCCAGAACTGTTGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AGACAGTAAGGCTGGCACTTCTGCCAGCCATCTATCTCATGGAGAATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AGACAGTAAGGCTGGCACTTCTGCCAGCCATCTATCTCATGGAGAATGTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GCCATGGAGGAACTCATCACCAAGCAGAGAAAGAGTAAGGAAATTGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GCCATGGAGGAACTCATCACCAAGCAGAGAAAGAGTAAGGAAATTGTGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 AGAGGCCATCAGGTGCAAACTGAAAATCCTGCAGAATGACGGTGTGGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 AGAGGCCATCAGGTGCAAACTGAAAATCCTGCAGAATGACGGTGTGGTAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CCAGCCTCTGTGCCCGACCTCGGAAAACTGGCCATGCCCTCTTCCTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CCAGCCTCTGTGCCCGACCTCGGAAAACTGGCCATGCCCTCTTCCTTCTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GGAGGACAGACTTTCATGTGTGACAAGTTGTATCTGGTAGACCAGAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GGAGGACAGACTTTCATGTGTGACAAGTTGTATCTGGTAGACCAGAAGGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CAAAGAAATCATTCCCAAGGCTGACATTCCCAGCCCAAGAAAAGAGTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CAAAGAAATCATTCCCAAGGCTGACATTCCCAGCCCAAGAAAAGAGTTTA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 GTGCATGTGCGATTGGCTGCAAAGTGTACATTACTGGGGGGCGGGGGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 GTGCATGTGCGATTGGCTGCAAAGTGTACATTACTGGGGGGCGGGGGTCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GAAAATGGGGTCTCAAAAGATGTCTGGGTTTATGATACCCTGCACGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GAAAATGGGGTCTCAAAAGATGTCTGGGTTTATGATACCCTGCACGAGGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 GTGGTCCAAGGCTGCCCCCATGCTGGTGGCCAGGTTTGGCCATGGCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 GTGGTCCAAGGCTGCCCCCATGCTGGTGGCCAGGTTTGGCCATGGCTCTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 CTGAACTGAAGCACTGCCTGTATGTGGTTGGGGGGCACACGGCCGCAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 CTGAACTGAAGCACTGCCTGTATGTGGTTGGGGGGCACACGGCCGCAACT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 GGCTGCCTCCCGGCCTCCCCCTCAGTCTCTCTAAAGCAGGTAGAACATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 GGCTGCCTCCCGGCCTCCCCCTCAGTCTCTCTAAAGCAGGTAGAACATTA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 TGACCCCACAATCAACAAATGGACCATGGTGGCCCCACTCCGAGAAGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 TGACCCCACAATCAACAAATGGACCATGGTGGCCCCACTCCGAGAAGGCG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 TTAGCAACGCCGCAGTAGTGAGTGCCAAACTTAAGTTATTTGCTTTCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 TTAGCAACGCCGCAGTAGTGAGTGCCAAACTTAAGTTATTTGCTTTCGGA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 GGTACCAGTGTCAGTCATGACAAGCTCCCCAAAGTTCAGTGTTACGATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 GGTACCAGTGTCAGTCATGACAAGCTCCCCAAAGTTCAGTGTTACGATCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 GTGTGAAAACAGGTGGACTGTACCGGCCACCTGTCCCCAGCCCTGGCGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 GTGTGAAAACAGGTGGACTGTACCGGCCACCTGTCCCCAGCCCTGGCGTT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 ACACAGCAGCAGCTGTGCTGGGGAACCAGATTTTTATTATGGGGGGTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 ACACAGCAGCAGCTGTGCTGGGGAACCAGATTTTTATTATGGGGGGTGAT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 ACAGAATTCTCTGCCTGCTCTGCTTATAAATTCAACAGTGAGACTTACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 ACAGAATTCTCTGCCTGCTCTGCTTATAAATTCAACAGTGAGACTTACCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 GTGGACCAAGGTGGGAGATGTGACAGCAAAGCGCATGAGCTGCCATGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 GTGGACCAAGGTGGGAGATGTGACAGCAAAGCGCATGAGCTGCCATGCTG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 TGGCCTCTGGAAACAAACTCTACGTGGTTGGAGGATACTTTGGCATTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101601 TGGCCTCTGGAAACAAACTCTACGTGGTTGGAGGATACTTTGGCATTCAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 CGATGCAAGACTTTGGACTGCTACGATCCAACATTAGACGTGTGGAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101651 CGATGCAAGACTTTGGACTGCTACGATCCAACATTAGACGTGTGGAACAG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1701 CATCACCACTGTCCCGTACTCGCTGATTCCTACTGCATTTGTCAGCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101701 CATCACCACTGTCCCGTACTCGCTGATTCCTACTGCATTTGTCAGCACCT

   1750     .    :    .
   1751 GGAAACATCTGCCTTCT
        |||||||||||||||||
 101751 GGAAACATCTGCCTTCT