seq1 = pF1KB9590.tfa, 1215 bp
seq2 = pF1KB9590/gi568815575r_133117045.tfa (gi568815575r:133117045_133318259), 201215 bp

>pF1KB9590 1215
>gi568815575r:133117045_133318259 (ChrX)

(complement)

1-1215  (100001-101215)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAAAATATGTCAGTCTCACTGAAGCTAACGAAGAACTCAAGGTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAAAATATGTCAGTCTCACTGAAGCTAACGAAGAACTCAAGGTCTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AATGGACGAGAACCAGACCAGCCGCCCCGTGGCCGTTCACACCTCCACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AATGGACGAGAACCAGACCAGCCGCCCCGTGGCCGTTCACACCTCCACCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGAACCCGCTCGGGAAGCAGCTCTTGCCGAAAACCTTTGGACAGTCCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGAACCCGCTCGGGAAGCAGCTCTTGCCGAAAACCTTTGGACAGTCCAGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTCAACATTGACCAGCAAGTGGTAATTGGTATGCCTCAGAGACCAGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTCAACATTGACCAGCAAGTGGTAATTGGTATGCCTCAGAGACCAGCAGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 ATCAAACATCCCTGTGGTAGGAAGCCCAAACCCACCCAGCACTCACTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 ATCAAACATCCCTGTGGTAGGAAGCCCAAACCCACCCAGCACTCACTTTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCTCTCAGAACCAGCATTCCTACTCCTCACCTCCTTGGGCCGGGCAGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CCTCTCAGAACCAGCATTCCTACTCCTCACCTCCTTGGGCCGGGCAGCAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AACAGGAAAGGAGAGAAGAATGGCATGGGCCTGTGCCGTCTTTCCATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AACAGGAAAGGAGAGAAGAATGGCATGGGCCTGTGCCGTCTTTCCATGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGTCTGGGAGACGGTGCAGAGGAAAGGGACCACTTCCTGCCAGGAAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGTCTGGGAGACGGTGCAGAGGAAAGGGACCACTTCCTGCCAGGAAGTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGGGCGAGCTGGTCGCCAAGTTCAGAGCTGCCAGCAACCACGCCTCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGGGCGAGCTGGTCGCCAAGTTCAGAGCTGCCAGCAACCACGCCTCACCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AACGAGTCAGCTTATGACGTGAAAAACATAAAACGGCGCACCTACGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AACGAGTCAGCTTATGACGTGAAAAACATAAAACGGCGCACCTACGATGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTTAAACGTGCTGATGGCCATGAATATCATCTCCAGGGAGAAAAAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTTAAACGTGCTGATGGCCATGAATATCATCTCCAGGGAGAAAAAGAAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TCAAGTGGATTGGTCTGACCACCAACTCGGCTCAGAACTGTCAGAACTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TCAAGTGGATTGGTCTGACCACCAACTCGGCTCAGAACTGTCAGAACTTA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CGGGTGGAAAGACAGAAGAGACTTGAAAGAATAAAGCAGAAACAGTCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CGGGTGGAAAGACAGAAGAGACTTGAAAGAATAAAGCAGAAACAGTCTGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 ACTTCAACAACTTATTCTACAGCAAATTGCTTTCAAGAACCTGGTGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 ACTTCAACAACTTATTCTACAGCAAATTGCTTTCAAGAACCTGGTGCTGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GAAACCAGTATGTGGAGGAGCAGGTCAGCCAGCGGCCGCTGCCCAACTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GAAACCAGTATGTGGAGGAGCAGGTCAGCCAGCGGCCGCTGCCCAACTCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GTCATCCACGTGCCCTTCATCATCATCAGCAGTAGCAAGAAGACCGTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GTCATCCACGTGCCCTTCATCATCATCAGCAGTAGCAAGAAGACCGTCAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CAACTGCAGCATCTCCGACGACAAATCAGAATATCTGTTTAAGTTTAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CAACTGCAGCATCTCCGACGACAAATCAGAATATCTGTTTAAGTTTAACA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 GCTCCTTTGAAATCCACGATGACACAGAAGTGCTGATGTGGATGGGCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 GCTCCTTTGAAATCCACGATGACACAGAAGTGCTGATGTGGATGGGCATG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 ACTTTTGGGCTAGAGTCCGGGAGCTGCTCTGCCGAAGACCTTAAAATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 ACTTTTGGGCTAGAGTCCGGGAGCTGCTCTGCCGAAGACCTTAAAATGGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CAGAAATTTGGTCCCAAAGGCTCTGGAGCCGTACGTGACAGAAATGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CAGAAATTTGGTCCCAAAGGCTCTGGAGCCGTACGTGACAGAAATGGCTC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 AGGGAACTTTTGGAGGTGTGTTCACGACGGCAGGTTCCAGGTCTAATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 AGGGAACTTTTGGAGGTGTGTTCACGACGGCAGGTTCCAGGTCTAATGGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 ACGTGGCTTTCTGCCAGTGACCTGACCAACATTGCGATTGGGATGCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 ACGTGGCTTTCTGCCAGTGACCTGACCAACATTGCGATTGGGATGCTGGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 CACAAGCTCCGGTGGATCTCAGTACAGTGGCTCCAGGGTGGAGACCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 CACAAGCTCCGGTGGATCTCAGTACAGTGGCTCCAGGGTGGAGACCCCAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 CAGTCGAGGAGGAAGAGGAGGAGGACAACAACGATGACGACCTCAGTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 CAGTCGAGGAGGAAGAGGAGGAGGACAACAACGATGACGACCTCAGTGAG

   1200     .    :    .
   1201 AATGACGAGGATGAC
        |||||||||||||||
 101201 AATGACGAGGATGAC