seq1 = pF1KB9588.tfa, 699 bp
seq2 = pF1KB9588/gi568815593r_157038733.tfa (gi568815593r:157038733_157239431), 200699 bp

>pF1KB9588 699
>gi568815593r:157038733_157239431 (Chr5)

(complement)

1-699  (100001-100699)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGTGAACCACAGCAAGTGAGTGCACTTCCACCACCTCCAATGCAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGTGAACCACAGCAAGTGAGTGCACTTCCACCACCTCCAATGCAATA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TATCAAGGAATATACGGATGAAAATATTCAAGAAGGCTTAGCTCCCAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TATCAAGGAATATACGGATGAAAATATTCAAGAAGGCTTAGCTCCCAAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTCCCCCTCCAATAAAAGACAGTTACATGATGTTTGGCAATCAGTTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTCCCCCTCCAATAAAAGACAGTTACATGATGTTTGGCAATCAGTTCCAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TGTGATGATCTTATCATCCGCCCTTTGGAAAGTCAGGGCATCGAACGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TGTGATGATCTTATCATCCGCCCTTTGGAAAGTCAGGGCATCGAACGGCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TCATCCTATGCAGTTTGATCACGAGAAAGAACTGAGAAAACTTAATATGT
        |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
 100201 TCATCCTATGCAGTTTGATCACAAGAAAGAACTGAGAAAACTTAATATGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CTATCCTTATTAATTTCTTGGACCTTTTAGATATTTTAATAAGGAGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CTATCCTTATTAATTTCTTGGACCTTTTAGATATTTTAATAAGGAGCCCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGGAGTATAAAACGAGAAGAGAAACTAGAAGATCTTAAGCTGCTTTTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGGAGTATAAAACGAGAAGAGAAACTAGAAGATCTTAAGCTGCTTTTTGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 ACACGTGCATCATCTTATAAATGAATACCGACCCCACCAAGCAAGAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 ACACGTGCATCATCTTATAAATGAATACCGACCCCACCAAGCAAGAGAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCTTGAGAGTCATGATGGAGGTCCAGAAACGTCAACGGCTTGAAACAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CCTTGAGAGTCATGATGGAGGTCCAGAAACGTCAACGGCTTGAAACAGCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GAGAGATTTCAAAAGCACCTGGAACGAGTAATTGAAATGATTCAGAATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GAGAGATTTCAAAAGCACCTGGAACGAGTAATTGAAATGATTCAGAATTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTTGGCTTCTTTGCCTGATGATTTGCCTCATTCAGAAGCAGGAATGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTTGGCTTCTTTGCCTGATGATTTGCCTCATTCAGAAGCAGGAATGAGAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TAAAAACTGAACCAATGGATGCTGATGATAGCAACAATTGTACTGGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TAAAAACTGAACCAATGGATGCTGATGATAGCAACAATTGTACTGGACAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 AATGAACATCAAAGAGAAAATTCAGGTCATAGGAGAGATCAGATTATAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 AATGAACATCAAAGAGAAAATTCAGGTCATAGGAGAGATCAGATTATAGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    651 GAAAGATGCTGCCTTGTGTGTCCTAATTGATGAGATGAATGAAAGACCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GAAAGATGCTGCCTTGTGTGTCCTAATTGATGAGATGAATGAAAGACCA