seq1 = pF1KB9580.tfa, 543 bp
seq2 = pF1KB9580/gi568815587r_8837619.tfa (gi568815587r:8837619_9038161), 200543 bp

>pF1KB9580 543
>gi568815587r:8837619_9038161 (Chr11)

(complement)

1-543  (100001-100543)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATGGACAACAGAGGCAACTCTAGTCTACCTGACAAACTTCCTATCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATGGACAACAGAGGCAACTCTAGTCTACCTGACAAACTTCCTATCTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCCTGATTCTGCCCGCTTGCCACTGACCAGGTCCTTCTATCTGGAGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCCTGATTCTGCCCGCTTGCCACTGACCAGGTCCTTCTATCTGGAGCCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGGTCACTTTCCACGTGCACCCAGAGGCCCCGGTGTCATCCCCTTACTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGGTCACTTTCCACGTGCACCCAGAGGCCCCGGTGTCATCCCCTTACTCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAGGAGCTGCCACGGCTGCCTTTTCCCAGCGACTCTCTTATCCTGGGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
 100151 GAGGAGCTGCCACGGCTGCCTTTTCCCAGCGACTCTCTTATCCTGGGAAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TTACAGTGAACCCTGCCCCTTCTCTTTCCCGATGCCTTATCCAAATTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TTACAGTGAACCCTGCCCCTTCTCTTTCCCGATGCCTTATCCAAATTACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GAGGGTGCGAGTACTCCTACGGGCCAGCCTTCACCCGGAAAAGGAATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GAGGGTGCGAGTACTCCTACGGGCCAGCCTTCACCCGGAAAAGGAATGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CGGGAAAGGCAGCGGGTGAAATGTGTCAATGAAGGCTATGCCCAGCTCCG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
 100301 CGGGAAAGGCAGCGGGTGAAATGTGTCAATGAAGGCTACGCCCAGCTCCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCATCATCTGCCAGAGGAGTATTTGGAGAAGCGACTCAGCAAAGTGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CCATCATCTGCCAGAGGAGTATTTGGAGAAGCGACTCAGCAAAGTGGAAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCCTCAGAGCTGCGATCAAGTACATTAACTACCTGCAGTCTCTTCTGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CCCTCAGAGCTGCGATCAAGTACATTAACTACCTGCAGTCTCTTCTGTAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CCTGATAAAGCTGAGACCAAGAATAACCCTGGAAAAGTTTCCTCCATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CCTGATAAAGCTGAGACCAAGAATAACCCTGGAAAAGTTTCCTCCATGAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :
    501 AGCAACCACCAGCCACCATGCTGACCCTATGTTCAGAATTGTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 AGCAACCACCAGCCACCATGCTGACCCTATGTTCAGAATTGTT