seq1 = pF1KB9573.tfa, 1125 bp
seq2 = pF1KB9573/gi568815592r_18126174.tfa (gi568815592r:18126174_18363987), 237814 bp

>pF1KB9573 1125
>gi568815592r:18126174_18363987 (Chr6)

(complement)

1-145  (100001-100145)   100% ->
146-247  (105583-105684)   100% ->
248-357  (105926-106035)   100% ->
358-452  (107533-107627)   98% ->
453-573  (108137-108257)   100% ->
574-762  (114149-114337)   99% ->
763-898  (126472-126607)   100% ->
899-1047  (127388-127536)   100% ->
1048-1125  (137746-137822)   94%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCGCCTCGGCCCCTGCTGCGGAGGGGGAGGGAACCCCCACCCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCCGCCTCGGCCCCTGCTGCGGAGGGGGAGGGAACCCCCACCCAGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGCGTCCGAGAAAGAACCCGAAATGCCCGGTCCCAGAGAGGAGAGCGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGCGTCCGAGAAAGAACCCGAAATGCCCGGTCCCAGAGAGGAGAGCGAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGAAGAGGACGAGGACGACGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAAAAAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 100101 AGGAAGAGGACGAGGACGACGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAAAAAGGTG..

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    146     AAAAGAGTCTCATCGTGGAAGGCAAGAGGGAAAAGAAAAAAGTAGA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 .TAGAAAAGAGTCTCATCGTGGAAGGCAAGAGGGAAAAGAAAAAAGTAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GAGGTTGACAATGCAAGTCTCTTCCTTACAGAGAGAGCCATTTACAATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105629 GAGGTTGACAATGCAAGTCTCTTCCTTACAGAGAGAGCCATTTACAATTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CACAAG         GAAAGGGGCAGAAACTTTGTGAAATTGAGAGGATA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105679 CACAAGGTA...CAGGAAAGGGGCAGAAACTTTGTGAAATTGAGAGGATA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CATTTTTTTCTAAGTAAGAAGAAAACCGATGAACTTAGAAATCTACACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105961 CATTTTTTTCTAAGTAAGAAGAAAACCGATGAACTTAGAAATCTACACAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 ACTGCTTTACAACAGGCCAGGCACT         GTGTCCTCATTAAAGA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 106011 ACTGCTTTACAACAGGCCAGGCACTGTA...CAGGTGTCCTCATTAAAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGAATGTGGGTCAGTTCAGTGGCTTTCCATTTGAAAAAGGAAGTGCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
 107549 AGAATGTGGGTCAGTTCAGTGGCTTTCCATTTGAAAAAGGAAGTGTCCAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TATAAAAAGAAGGAAGAAATGTTGAAAAA         ATTTAGAAATGC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 107599 TATAAAAAGAAGGAAGAAATGTTGAAAAAGTA...CAGATTTAGAAATGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CATGTTAAAGAGCATCTGTGAGGTTCTTGATTTGGAGAGATCAGGTGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108149 CATGTTAAAGAGCATCTGTGAGGTTCTTGATTTGGAGAGATCAGGTGTAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ATAGTGAACTAGTGAAGAGGATCTTGAATTTCTTAATGCATCCAAAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108199 ATAGTGAACTAGTGAAGAGGATCTTGAATTTCTTAATGCATCCAAAGCCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TCTGGCAAA         CCATTGCCGAAATCTAAAAAAACTTGTAGCAA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 108249 TCTGGCAAAGTG...CAGCCATTGCCGAAATCTAAAAAAACTTGTAGCAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 AGGCAGTAAAAAGGAACGGAACAGTTCTGGAATGGCAAGGAAGGCTAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114181 AGGCAGTAAAAAGGAACGGAACAGTTCTGGAATGGCAAGGAAGGCTAAGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 GAACCAAATGTCCTGAAATTCTGTCAGATGAATCTAGTAGTGATGAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114231 GAACCAAATGTCCTGAAATTCTGTCAGATGAATCTAGTAGTGATGAAGAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GAAAAGAAAAACAAGGAAGAGTCTTCAGAAGATGAAGATAAAGAAAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
 114281 GAAAAGAAAAACAAGGAAGAGTCTTCAGATGATGAAGATAAAGAAAGTGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 AGAGGAG         CCACCAAAAAAGACAGCCAAAAGAGAAAAACCTA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114331 AGAGGAGGTA...CAGCCACCAAAAAAGACAGCCAAAAGAGAAAAACCTA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 AACAGAAAGCTACTTCTAAAAGTAAAAAATCTGTGAAAAGTGCCAATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126506 AACAGAAAGCTACTTCTAAAAGTAAAAAATCTGTGAAAAGTGCCAATGTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 AAGAAAGCAGATAGCAGCACCACCAAGAAGAATCAAAACAGTTCCAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126556 AAGAAAGCAGATAGCAGCACCACCAAGAAGAATCAAAACAGTTCCAAAAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 AG         AAAGTGAGTCTGAGGATAGTTCAGATGATGAACCTTTAA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126606 AGGTA...TAGAAAGTGAGTCTGAGGATAGTTCAGATGATGAACCTTTAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 TTAAAAAGTTGAAGAAACCCCCTACAGATGAAGAGTTAAAGGAAACAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127427 TTAAAAAGTTGAAGAAACCCCCTACAGATGAAGAGTTAAAGGAAACAATA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 AAGAAATTACTGGCCAGTGCTAACTTGGAAGAAGTCACAATGAAACAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127477 AAGAAATTACTGGCCAGTGCTAACTTGGAAGAAGTCACAATGAAACAGAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 TTGCAAAAAG         GTCTATGAAAATTATCCTACTTATGATTTAA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 127527 TTGCAAAAAGGTA...TAGGTCTATGAAAATTATCCTACTTATGATTTAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1079 CTGAAAGAAAAGATTTCATAAAAACAACTGTAAAAGAGCTAATTTCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | -|
 137777 CTGAAAGAAAAGATTTCATAAAAACAACTGTAAAAGAGGTAAATA T