seq1 = pF1KB9572.tfa, 2364 bp
seq2 = pF1KB9572/gi568815590f_38687583.tfa (gi568815590f:38687583_38948020), 260438 bp

>pF1KB9572 2364
>gi568815590f:38687583_38948020 (Chr8)

1-161  (100001-100161)   100% ->
162-277  (101122-101237)   100% ->
278-1391  (131940-133053)   100% ->
1392-1427  (136408-136443)   100% ->
1428-1488  (137726-137786)   100% ->
1489-1609  (139586-139706)   100% ->
1610-1662  (143543-143595)   100% ->
1663-1788  (148580-148705)   99% ->
1789-1865  (150888-150964)   100% ->
1866-1909  (152642-152685)   100% ->
1910-2070  (154705-154865)   100% ->
2071-2177  (155707-155813)   100% ->
2178-2298  (159117-159237)   100% ->
2299-2364  (160373-160438)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGTTCAGCCCGTGGCAGATCCTGTCCCCCGTGCAGTGGGCGAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGTTCAGCCCGTGGCAGATCCTGTCCCCCGTGCAGTGGGCGAAATG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GACGTGGTCTGCGGTACGCGGCGGGGCCGCCGGCGAGGACGAGGCTGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GACGTGGTCTGCGGTACGCGGCGGGGCCGCCGGCGAGGACGAGGCTGGCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGCCCGAGGGCGACCCCGAGGAGGAGGATTCGCAAGCCGAGACCAAATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGCCCGAGGGCGACCCCGAGGAGGAGGATTCGCAAGCCGAGACCAAATCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTGAGTTTCAG         CTCGGATTCTGAAGGTAATTTTGAGACTCC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTGAGTTTCAGGCA...CAGCTCGGATTCTGAAGGTAATTTTGAGACTCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGAAGCTGAAACCCCGATCCGATCACCTTTCAAGGAGTCCTGTGATCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101152 TGAAGCTGAAACCCCGATCCGATCACCTTTCAAGGAGTCCTGTGATCCAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CACTCGGATTGGCAGGACCTGGGGCCAAAAGCCAAG         AATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 101202 CACTCGGATTGGCAGGACCTGGGGCCAAAAGCCAAGGTA...TAGAATCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CAAGAAGCTGATGAACAGCTTGTAGCAGAAGTGGTTGAAAAATGTTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131945 CAAGAAGCTGATGAACAGCTTGTAGCAGAAGTGGTTGAAAAATGTTCATC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TAAGACTTGTTCTAAACCTTCAGAAAATGAAGTGCCACAGCAGGCCATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131995 TAAGACTTGTTCTAAACCTTCAGAAAATGAAGTGCCACAGCAGGCCATTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ACTCTCACTCAGTCAAGAATTTCAGAGAAGAACCTGAACATGATTTTAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132045 ACTCTCACTCAGTCAAGAATTTCAGAGAAGAACCTGAACATGATTTTAGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AAAATTTCCATCGTGAGGCCATTTTCAATAGAAACGAAGGATTCCACGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132095 AAAATTTCCATCGTGAGGCCATTTTCAATAGAAACGAAGGATTCCACGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 TATCTCGGCAGTCCTCGGAACAAAAGCAGCTCATGGCTGTGTAACTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132145 TATCTCGGCAGTCCTCGGAACAAAAGCAGCTCATGGCTGTGTAACTGCAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TCTCAGGCAAGGCTCTGCCTTCCAGCCCGCCAGACGCCCTCCAGGACGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132195 TCTCAGGCAAGGCTCTGCCTTCCAGCCCGCCAGACGCCCTCCAGGACGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GCGATGACAGAAGGCAGCATGGGGGTCACCCTCGAGGCCTCCGCAGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132245 GCGATGACAGAAGGCAGCATGGGGGTCACCCTCGAGGCCTCCGCAGAAGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 TGATCTAAAAGCTGGCAACTCCTGTCCAGAGCTTGTGCCCAGCAGAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132295 TGATCTAAAAGCTGGCAACTCCTGTCCAGAGCTTGTGCCCAGCAGAAGAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 GCAAGCTGAGAAAGCCCAAGCCTGTCCCCCTGAGGAAGAAAGCAATTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132345 GCAAGCTGAGAAAGCCCAAGCCTGTCCCCCTGAGGAAGAAAGCAATTGGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 GGAGAGTTCTCAGACACCAACGCTGCTGTGGAGGGCACACCTCTCCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132395 GGAGAGTTCTCAGACACCAACGCTGCTGTGGAGGGCACACCTCTCCCCAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 GGCATCCTATCACTTCAGTCCTGAAGAGTTGGATGAGAACACAAGTCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132445 GGCATCCTATCACTTCAGTCCTGAAGAGTTGGATGAGAACACAAGTCCTT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 TGCTAGGAGATGCCAGGTTCCAGAAGTCTCCCCCTGACCTTAAAGAAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132495 TGCTAGGAGATGCCAGGTTCCAGAAGTCTCCCCCTGACCTTAAAGAAACT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 CCCGGCACTCTCAGTAGTGACACCAACGACTCAGGGGTTGAGCTGGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132545 CCCGGCACTCTCAGTAGTGACACCAACGACTCAGGGGTTGAGCTGGGGGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 GGAGTCGAGGAGCTCACCTCTCAAGCTTGAGTTTGATTTCACAGAAGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132595 GGAGTCGAGGAGCTCACCTCTCAAGCTTGAGTTTGATTTCACAGAAGATA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 CAGGAAACATAGAGGCCAGGAAAGCCCTTCCAAGGAAGCTTGGCAGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132645 CAGGAAACATAGAGGCCAGGAAAGCCCTTCCAAGGAAGCTTGGCAGGAAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 CTGGGTAGCACACTGACTCCCAAGATACAAAAAGATGGCATCAGTAAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132695 CTGGGTAGCACACTGACTCCCAAGATACAAAAAGATGGCATCAGTAAGTC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 AGCAGGTTTAGAACAGCCTACAGACCCAGTGGCACGAGACGGGCCTCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132745 AGCAGGTTTAGAACAGCCTACAGACCCAGTGGCACGAGACGGGCCTCTCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 CCCAAACATCTTCCAAGCCAGATCCTAGTCAGTGGGAAAGCCCCAGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132795 CCCAAACATCTTCCAAGCCAGATCCTAGTCAGTGGGAAAGCCCCAGCTTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1183 AACCCCTTTGGGAGCCACTCTGTTCTGCAGAACTCCCCACCCCTCTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132845 AACCCCTTTGGGAGCCACTCTGTTCTGCAGAACTCCCCACCCCTCTCTTC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1233 TGAGGGCTCCTACCACTTTGACCCAGATAACTTTGACGAATCCATGGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132895 TGAGGGCTCCTACCACTTTGACCCAGATAACTTTGACGAATCCATGGATC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1283 CCTTTAAACCAACTACGACCTTAACAAGCAGTGACTTTTGTTCTCCCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132945 CCTTTAAACCAACTACGACCTTAACAAGCAGTGACTTTTGTTCTCCCACT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1333 GGTAATCACGTTAATGAAATCTTAGAATCACCCAAGAAGGCAAAGTCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132995 GGTAATCACGTTAATGAAATCTTAGAATCACCCAAGAAGGCAAAGTCGCG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1383 TTTAATAAC         GACTACTGAACAAGTGAAATTTCTCTGTTTTC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 133045 TTTAATAACGTG...CAGGACTACTGAACAAGTGAAATTTCTCTGTTTTC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1424 TGTT         GAGTGGCTGTAAGGTGAAGAAGCATGAAACTCAGTCT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136440 TGTTGTA...CAGGAGTGGCTGTAAGGTGAAGAAGCATGAAACTCAGTCT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1465 CTCGCCCTGGATGCATGTTCTCGG         GATGAAGGGGCAGTGAT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 137763 CTCGCCCTGGATGCATGTTCTCGGGTG...CAGGATGAAGGGGCAGTGAT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1506 CTCCCAGATTTCAGACATTTCTAATAGGGATGGCCATGCTACTGATGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139603 CTCCCAGATTTCAGACATTTCTAATAGGGATGGCCATGCTACTGATGAGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1556 AGAAACTGGCATCCACGTCATGTGGTCAGAAATCAGCTGGTGCCGAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139653 AGAAACTGGCATCCACGTCATGTGGTCAGAAATCAGCTGGTGCCGAGGTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1606 AAAG         GCATAGAGAAGGAGACGTGCCAGAAGATGGAAGAAGA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139703 AAAGGTG...TAGGCATAGAGAAGGAGACGTGCCAGAAGATGGAAGAAGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1647 CGGGTCCACTGTGCTT         GGGCTGCTGGAGTCCTCTGCAGAGA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 143580 CGGGTCCACTGTGCTTGTA...CAGGGGCTGCTGGAGTCCTCTGCAGAGA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1688 AGGCCCCTGTGTCGGTGTCCTGTGGAGGTGAGAGCCCCCTGGATGGGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148605 AGGCCCCTGTGTCGGTGTCCTGTGGAGGTGAGAGCCCCCTGGATGGGATC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1738 TGCCTCAGCGAATCAGACAAGACAGCTGTGCTCACCTTAATAAGAGAAGA
        |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
 148655 TGCCTCAGCGAATCAGACAAGACAGCCGTGCTCACCTTAATAAGAGAAGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1788 G         ATAATTACTAAAGAGATTGAAGCAAATGAATGGAAGAAGA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148705 GGTA...TAGATAATTACTAAAGAGATTGAAGCAAATGAATGGAAGAAGA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1829 AATACGAAGAGACCCGGCAAGAAGTTTTGGAGATGAG         GAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 150928 AATACGAAGAGACCCGGCAAGAAGTTTTGGAGATGAGGTT...TAGGAAA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1870 ATTGTAGCTGAATATGAAAAGACTATTGCTCAAATGATTG         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 152646 ATTGTAGCTGAATATGAAAAGACTATTGCTCAAATGATTGGTA...CAGA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1911 AGATGAACAAAGGACAAGTATGACCTCTCAGAAGAGCTTCCAGCAACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154706 AGATGAACAAAGGACAAGTATGACCTCTCAGAAGAGCTTCCAGCAACTGA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1961 CCATGGAGAAGGAACAGGCCCTGGCTGACCTTAACTCTGTGGAAAGGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154756 CCATGGAGAAGGAACAGGCCCTGGCTGACCTTAACTCTGTGGAAAGGTCC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2011 CTTTCTGATCTCTTCAGGAGATATGAGAACCTGAAAGGTGTTCTGGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154806 CTTTCTGATCTCTTCAGGAGATATGAGAACCTGAAAGGTGTTCTGGAAGG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2061 GTTCAAGAAG         AATGAAGAAGCCTTGAAGAAATGTGCTCAGG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 154856 GTTCAAGAAGGTA...CAGAATGAAGAAGCCTTGAAGAAATGTGCTCAGG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2102 ATTACTTAGCCAGAGTTAAACAAGAGGAGCAGCGATACCAGGCCCTGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155738 ATTACTTAGCCAGAGTTAAACAAGAGGAGCAGCGATACCAGGCCCTGAAA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2152 ATCCACGCAGAAGAGAAACTGGACAA         AGCCAATGAAGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 155788 ATCCACGCAGAAGAGAAACTGGACAAGTA...CAGAGCCAATGAAGAGAT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2193 TGCTCAGGTTCGAACAAAAGCAAAGGCTGAGAGTGCAGCTCTCCATGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159132 TGCTCAGGTTCGAACAAAAGCAAAGGCTGAGAGTGCAGCTCTCCATGCTG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2243 GACTCCGCAAAGAGCAGATGAAGGTGGAGTCCCTGGAAAGGGCCCTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159182 GACTCCGCAAAGAGCAGATGAAGGTGGAGTCCCTGGAAAGGGCCCTGCAG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2293 CAGAAG         AACCAAGAAATTGAAGAACTGACAAAAATCTGTGA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159232 CAGAAGGTA...CAGAACCAAGAAATTGAAGAACTGACAAAAATCTGTGA

   2450     .    :    .    :    .    :
   2334 TGAGCTGATTGCAAAGCTGGGAAAGACTGAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||
 160408 TGAGCTGATTGCAAAGCTGGGAAAGACTGAC