seq1 = pF1KB9562.tfa, 2364 bp
seq2 = pF1KB9562/gi568815581r_74851573.tfa (gi568815581r:74851573_75072656), 221084 bp

>pF1KB9562 2364
>gi568815581r:74851573_75072656 (Chr17)

(complement)

1-66  (100001-100066)   100% ->
67-216  (108025-108174)   100% ->
217-387  (108747-108917)   100% ->
388-504  (109576-109692)   100% ->
505-611  (110317-110423)   100% ->
612-728  (110668-110784)   100% ->
729-951  (112409-112631)   100% ->
952-1008  (112720-112776)   100% ->
1009-1149  (113606-113746)   100% ->
1150-1240  (113894-113984)   100% ->
1241-1392  (114179-114330)   100% ->
1393-1471  (114438-114516)   100% ->
1472-1636  (116701-116865)   99% ->
1637-1864  (118292-118519)   100% ->
1865-1971  (119006-119112)   100% ->
1972-2052  (119571-119651)   100% ->
2053-2144  (120297-120388)   98% ->
2145-2303  (120594-120752)   100% ->
2304-2364  (121024-121084)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGTCGACCGACTCCAAGCTGAACTTCCGGAAGGCGGTGATCCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGTCGACCGACTCCAAGCTGAACTTCCGGAAGGCGGTGATCCAGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CACCACCAAGACGCAG         CCCGTGGAAGCCACCGATGATGCCT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 100051 CACCACCAAGACGCAGGTG...CAGCCCGTGGAAGCCACCGATGATGCCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TTTGGGACCAGTTCTGGGCAGACACAGCCACCTCGGTGCAGGATGTGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108050 TTTGGGACCAGTTCTGGGCAGACACAGCCACCTCGGTGCAGGATGTGTTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCACTGGTGCCGGCAGCAGAGATCCGGGCCGTGCGGGAAGAGTCACCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108100 GCACTGGTGCCGGCAGCAGAGATCCGGGCCGTGCGGGAAGAGTCACCCTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CAACTTGGCCACCCTGTGCTACAAG         GCCGTTGAGAAGCTGG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 108150 CAACTTGGCCACCCTGTGCTACAAGGTG...CAGGCCGTTGAGAAGCTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TGCAGGGAGCTGAGAGTGGCTGCCACTCGGAGAAGGAGAAGCAGATCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108763 TGCAGGGAGCTGAGAGTGGCTGCCACTCGGAGAAGGAGAAGCAGATCGTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CTGAACTGCAGCCGGCTGCTCACCCGCGTGCTGCCCTACATCTTTGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108813 CTGAACTGCAGCCGGCTGCTCACCCGCGTGCTGCCCTACATCTTTGAGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CCCCGACTGGAGGGGCTTCTTCTGGTCCACAGTGCCCGGGGCAGGGCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108863 CCCCGACTGGAGGGGCTTCTTCTGGTCCACAGTGCCCGGGGCAGGGCGAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GAGGG         CAGGGAGAAGAGGATGATGAGCATGCCAGGCCCCTG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108913 GAGGGGTC...CAGCAGGGAGAAGAGGATGATGAGCATGCCAGGCCCCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GCCGAGTCCCTGCTCCTGGCCATTGCTGACCTGCTCTTCTGCCCGGACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109612 GCCGAGTCCCTGCTCCTGGCCATTGCTGACCTGCTCTTCTGCCCGGACTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CACGGTTCAGAGCCACCGGAGGAGCACTGTG         GACTCGGCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 109662 CACGGTTCAGAGCCACCGGAGGAGCACTGTGGTG...CAGGACTCGGCAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AGGACGTCCACTCCCTGGACAGCTGTGAATACATCTGGGAGGCTGGTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110327 AGGACGTCCACTCCCTGGACAGCTGTGAATACATCTGGGAGGCTGGTGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GGCTTCGCTCACTCCCCCCAGCCTAACTACATCCACGATATGAACCG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 110377 GGCTTCGCTCACTCCCCCCAGCCTAACTACATCCACGATATGAACCGGTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    612       GATGGAGCTGCTGAAACTGCTGCTGACATGCTTCTCCGAGGCCA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110427 ...AAGGATGGAGCTGCTGAAACTGCTGCTGACATGCTTCTCCGAGGCCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TGTACCTGCCCCCAGCTCCGGAAAGTGGCAGCACCAACCCATGGGTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110712 TGTACCTGCCCCCAGCTCCGGAAAGTGGCAGCACCAACCCATGGGTTCAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 TTCTTTTGTTCCACGGAGAACAG         ACATGCCCTGCCCCTCTT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 110762 TTCTTTTGTTCCACGGAGAACAGGTG...CAGACATGCCCTGCCCCTCTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 CACCTCCCTCCTCAACACCGTGTGTGCCTATGACCCTGTGGGCTACGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112427 CACCTCCCTCCTCAACACCGTGTGTGCCTATGACCCTGTGGGCTACGGGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TCCCCTACAACCACCTGCTCTTCTCTGACTACCGGGAACCCCTGGTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112477 TCCCCTACAACCACCTGCTCTTCTCTGACTACCGGGAACCCCTGGTGGAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GAGGCTGCCCAGGTGCTCATTGTCACTTTGGACCACGACAGTGCCAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112527 GAGGCTGCCCAGGTGCTCATTGTCACTTTGGACCACGACAGTGCCAGCAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 TGCCAGCCCCACTGTGGACGGCACCACCACTGGCACCGCCATGGATGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112577 TGCCAGCCCCACTGTGGACGGCACCACCACTGGCACCGCCATGGATGATG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 CCGAT         CCTCCAGGCCCTGAGAACCTGTTTGTGAACTACCTG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112627 CCGATGTA...CAGCCTCCAGGCCCTGAGAACCTGTTTGTGAACTACCTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 TCCCGCATCCATCGTGAGGAG         GACTTCCAGTTCATCCTCAA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 112756 TCCCGCATCCATCGTGAGGAGGCA...CAGGACTTCCAGTTCATCCTCAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 GGGTATAGCCCGGCTGCTGTCCAACCCCCTGCTCCAGACCTACCTGCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113626 GGGTATAGCCCGGCTGCTGTCCAACCCCCTGCTCCAGACCTACCTGCCTA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 ACTCCACCAAGAAGATCCAGTTCCACCAGGAGCTGCTAGTTCTCTTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113676 ACTCCACCAAGAAGATCCAGTTCCACCAGGAGCTGCTAGTTCTCTTCTGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 AAGCTCTGCGACTTCAACAAG         AAATTCCTCTTCTTCGTGCT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 113726 AAGCTCTGCGACTTCAACAAGGTG...TAGAAATTCCTCTTCTTCGTGCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 GAAGAGCAGCGACGTCCTAGACATCCTTGTCCCCATCCTCTTCTTCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113914 GAAGAGCAGCGACGTCCTAGACATCCTTGTCCCCATCCTCTTCTTCCTCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 ACGATGCCCGGGCCGATCAGT         CTCGGGTGGGCCTGATGCAC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 113964 ACGATGCCCGGGCCGATCAGTGTA...CAGCTCGGGTGGGCCTGATGCAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 ATTGGTGTCTTCATCTTGCTGCTTCTGAGCGGGGAGCGGAACTTCGGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114199 ATTGGTGTCTTCATCTTGCTGCTTCTGAGCGGGGAGCGGAACTTCGGGGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 GCGGCTGAACAAACCCTACTCAATCCGCGTGCCCATGGACATCCCAGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114249 GCGGCTGAACAAACCCTACTCAATCCGCGTGCCCATGGACATCCCAGTCT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 TCACAGGGACCCACGCCGACCTGCTCATTGTG         GTGTTCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 114299 TCACAGGGACCCACGCCGACCTGCTCATTGTGGTG...CAGGTGTTCCAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 AAGATCATCACCAGCGGGCACCAGCGGTTGCAGCCCCTCTTCGACTGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114447 AAGATCATCACCAGCGGGCACCAGCGGTTGCAGCCCCTCTTCGACTGCCT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 GCTCACCATCGTGGTCAACG         TGTCCCCCTACCTCAAGAGCC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 114497 GCTCACCATCGTGGTCAACGGTA...CAGTGTCCCCCTACCTCAAGAGCC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1493 TGTCCATGGTGACCGCCAACAAGTTGCTGCACCTGCTGGAGGCCTTCTCC
        ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116722 TGTCCATGGTGACTGCCAACAAGTTGCTGCACCTGCTGGAGGCCTTCTCC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 ACCACCTGGTTCCTCTTCTCTGCCGCCCAGAACCACCACCTGGTCTTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116772 ACCACCTGGTTCCTCTTCTCTGCCGCCCAGAACCACCACCTGGTCTTCTT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 CCTCCTGGAGGTCTTCAACAACATCATCCAGTACCAGTTTGATG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 116822 CCTCCTGGAGGTCTTCAACAACATCATCCAGTACCAGTTTGATGGTG...

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1637    GCAACTCCAACCTGGTCTACGCCATCATCCGCAAGCGCAGCATCTTC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118289 CAGGCAACTCCAACCTGGTCTACGCCATCATCCGCAAGCGCAGCATCTTC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1684 CACCAGCTGGCCAACCTGCCCACGGACCCGCCCACCATTCACAAGGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118339 CACCAGCTGGCCAACCTGCCCACGGACCCGCCCACCATTCACAAGGCCCT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 GCAGCGGCGCCGGCGGACACCTGAGCCCTTGTCTCGCACCGGCTCCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118389 GCAGCGGCGCCGGCGGACACCTGAGCCCTTGTCTCGCACCGGCTCCCAGG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1784 AGGGCACCTCCATGGAGGGCTCCCGCCCCGCTGCCCCTGCAGAGCCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118439 AGGGCACCTCCATGGAGGGCTCCCGCCCCGCTGCCCCTGCAGAGCCAGGC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 ACCCTCAAGACCAGTCTGGTGGCTACTCCAG         GCATTGACAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 118489 ACCCTCAAGACCAGTCTGGTGGCTACTCCAGGTC...CAGGCATTGACAA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1875 GCTGACCGAGAAGTCCCAGGTGTCAGAGGATGGCACCTTGCGGTCCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119016 GCTGACCGAGAAGTCCCAGGTGTCAGAGGATGGCACCTTGCGGTCCCTGG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1925 AACCTGAGCCCCAGCAGAGCTTGGAGGATGGCAGCCCGGCTAAGGGG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 119066 AACCTGAGCCCCAGCAGAGCTTGGAGGATGGCAGCCCGGCTAAGGGGGTG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1972       GAGCCCAGCCAGGCATGGAGGGAGCAGCGGCGACCGTCCACCTC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119116 ...CAGGAGCCCAGCCAGGCATGGAGGGAGCAGCGGCGACCGTCCACCTC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2016 ATCAGCCAGTGGGCAGTGGAGCCCAACGCCAGAGTGG         GTCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 119615 ATCAGCCAGTGGGCAGTGGAGCCCAACGCCAGAGTGGGTG...CAGGTCC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2057 TCTCCTGGAAGTCGAAGCTGCCGCTGCAGACCATCATGAGGCTGCTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120301 TCTCCTGGAAGTCGAAGCTGCCGCTGCAGACCATCATGAGGCTGCTGCAG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2107 GTGCTGGTTCCGCAGGTGGAGAAGATCTGCATCGACAA         GGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||>>>...>>>|||
 120351 GTGCTGGTTCCGCAGGTGGAGAAGATCTGCATTGACAAGTG...CAGGGG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2148 CCTGACGGATGAGTCTGAGATCCTGCGGTTCCTGCAGCATGGCACCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120597 CCTGACGGATGAGTCTGAGATCCTGCGGTTCCTGCAGCATGGCACCCTGG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2198 TGGGGCTGCTGCCCGTGCCCCACCCCATCCTCATCCGCAAGTACCAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120647 TGGGGCTGCTGCCCGTGCCCCACCCCATCCTCATCCGCAAGTACCAGGCC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2248 AACTCGGGCACTGCCATGTGGTTCCGCACCTACATGTGGGGCGTCATCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120697 AACTCGGGCACTGCCATGTGGTTCCGCACCTACATGTGGGGCGTCATCTA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2298 TCTGAG         GAATGTGGACCCCCCTGTCTGGTACGACACCGACG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120747 TCTGAGGTG...CAGGAATGTGGACCCCCCTGTCTGGTACGACACCGACG

   2500     .    :    .    :    .
   2339 TGAAGCTGTTTGAGATACAGCGGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||
 121059 TGAAGCTGTTTGAGATACAGCGGGTG