seq1 = pF1KB9559.tfa, 3258 bp
seq2 = pF1KB9559/gi568815582f_47363939.tfa (gi568815582f:47363939_47799363), 435425 bp

>pF1KB9559 3258
>gi568815582f:47363939_47799363 (Chr16)

1-55  (100001-100055)   100% ->
56-145  (133461-133550)   100% ->
146-284  (135818-135956)   100% ->
285-384  (139053-139152)   100% ->
385-492  (147727-147834)   100% ->
493-573  (151583-151663)   100% ->
574-689  (183495-183610)   100% ->
690-753  (216357-216420)   100% ->
754-849  (223730-223825)   100% ->
850-1047  (224967-225164)   100% ->
1048-1105  (229562-229619)   100% ->
1106-1183  (230199-230276)   100% ->
1184-1342  (232435-232593)   100% ->
1343-1437  (246888-246982)   100% ->
1438-1493  (277097-277152)   100% ->
1494-1587  (277661-277754)   100% ->
1588-1671  (284595-284678)   100% ->
1672-1776  (285162-285266)   100% ->
1777-1859  (286606-286688)   100% ->
1860-1950  (286893-286983)   100% ->
1951-2012  (296568-296629)   100% ->
2013-2175  (296719-296881)   100% ->
2176-2257  (297781-297862)   100% ->
2258-2315  (299739-299796)   100% ->
2316-2406  (302004-302094)   100% ->
2407-2609  (305277-305479)   99% ->
2610-2744  (325103-325237)   100% ->
2745-2874  (329440-329569)   100% ->
2875-2982  (332443-332550)   100% ->
2983-3123  (334510-334650)   100% ->
3124-3258  (335291-335425)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCTGCTCACCTGATGCAGTCGTCTCTCCGTCTTCCGCTTTCTTAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCTGCTCACCTGATGCAGTCGTCTCTCCGTCTTCCGCTTTCTTAAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTCTG         GCTCAGTTTATGAACCTCTTAAAAGCATTAATCTTC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTCTGGTA...TAGGCTCAGTTTATGAACCTCTTAAAAGCATTAATCTTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CAAGACCTGATAATGAAACTCTCTGGGATAAGTTGGACCATTATTACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133497 CAAGACCTGATAATGAAACTCTCTGGGATAAGTTGGACCATTATTACAGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATTG         TCAAGTCAACATTGCTGCTGTATCAAAGTCCAACTAC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133547 ATTGGTG...CAGTCAAGTCAACATTGCTGCTGTATCAAAGTCCAACTAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CGGTCTCTTTCCCACTAAAACATGCGGTGGTGACCAGAAGGCCAAGATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135855 CGGTCTCTTTCCCACTAAAACATGCGGTGGTGACCAGAAGGCCAAGATCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGGACAGCCTATACTGCGCTGCTGGGGCCTGGGCTTTGGCTCTTGCATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135905 AGGACAGCCTATACTGCGCTGCTGGGGCCTGGGCTTTGGCTCTTGCATAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AG         GCGAATTGATGATGACAAGGGAAGGACCCATGAGCTGGA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135955 AGGTG...CAGGCGAATTGATGATGACAAGGGAAGGACCCATGAGCTGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GCACTCAGCTATAAAATGCATGAGAGGAATTCTCTACTGCTATATGCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139092 GCACTCAGCTATAAAATGCATGAGAGGAATTCTCTACTGCTATATGCGTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGGCCGATAAG         GTCCAGCAGTTTAAGCAGGATCCACGCCCA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 139142 AGGCCGATAAGGTA...TAGGTCCAGCAGTTTAAGCAGGATCCACGCCCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 ACAACATGTCTTCACTCTGTTTTCAATGTGCATACAGGAGATGAGTTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147757 ACAACATGTCTTCACTCTGTTTTCAATGTGCATACAGGAGATGAGTTGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TTCCTATGAGGAATATGGTCATCTTCAG         ATAAATGCAGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 147807 TTCCTATGAGGAATATGGTCATCTTCAGGTA...CAGATAAATGCAGTGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 CACTTTATCTCCTTTACCTTGTGGAAATGATTTCCTCAGGACTCCAGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151596 CACTTTATCTCCTTTACCTTGTGGAAATGATTTCCTCAGGACTCCAGATT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 ATCTACAACACTGATGAG         GTCTCTTTTATTCAAAACCTTGT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 151646 ATCTACAACACTGATGAGGTA...TAGGTCTCTTTTATTCAAAACCTTGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 ATTTTGTGTGGAAAGAGTTTACCGTGTGCCTGACTTTGGTGTCTGGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183518 ATTTTGTGTGGAAAGAGTTTACCGTGTGCCTGACTTTGGTGTCTGGGAAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 GAGGAAGCAAATATAATAATGGCAGCACAGAGCTACATTCGAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 183568 GAGGAAGCAAATATAATAATGGCAGCACAGAGCTACATTCGAGGTA...T

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    690   CTCGGTTGGTTTAGCAAAAGCAGCTCTAGAAGCAATTAATGGATTCAA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 216355 AGCTCGGTTGGTTTAGCAAAAGCAGCTCTAGAAGCAATTAATGGATTCAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 CCTTTTTGGCAACCAG         GGCTGTTCGTGGTCAGTTATATTTG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 216405 CCTTTTTGGCAACCAGGTA...CAGGGCTGTTCGTGGTCAGTTATATTTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 TGGATCTCGATGCTCACAATCGCAACAGGCAAACTTTGTGCTCGCTGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 223755 TGGATCTCGATGCTCACAATCGCAACAGGCAAACTTTGTGCTCGCTGTTA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 CCCAGAGAATCAAGATCACAT         AATACAGATGCTGCCCTGCT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 223805 CCCAGAGAATCAAGATCACATGTG...CAGAATACAGATGCTGCCCTGCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    870 CCCCTGCATCAGTTATCCTGCATTTGCCCTGGATGATGAAGTTCTTTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 224987 CCCCTGCATCAGTTATCCTGCATTTGCCCTGGATGATGAAGTTCTTTTTA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 GCCAGACACTTGATAAAGTGGTTAGAAAATTAAAAGGAAAATATGGATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 225037 GCCAGACACTTGATAAAGTGGTTAGAAAATTAAAAGGAAAATATGGATTT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 AAACGTTTCTTGAGAGATGGGTATAGAACATCATTGGAAGATCCCAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 225087 AAACGTTTCTTGAGAGATGGGTATAGAACATCATTGGAAGATCCCAACAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 ATGCTACTACAAGCCAGCTGAAATTAAG         CTATTTGATGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 225137 ATGCTACTACAAGCCAGCTGAAATTAAGGTA...TAGCTATTTGATGGCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1061 TTGAATGTGAATTTCCCATATTTTTCCTTTATATGATGATTGATG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 229575 TTGAATGTGAATTTCCCATATTTTTCCTTTATATGATGATTGATGGTA..

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106     GAGTTTTTAGAGGCAATCCTAAGCAAGTACAGGAATATCAGGATCT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 229625 .TAGGAGTTTTTAGAGGCAATCCTAAGCAAGTACAGGAATATCAGGATCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1152 TTTGACTCCAGTACTTCATCATACCACAGAAG         GATATCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 230245 TTTGACTCCAGTACTTCATCATACCACAGAAGGTA...TAGGATATCCTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1193 TTGTACCAAAGTACTATTATGTGCCAGCTGACTTTGTAGAATATGAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 232444 TTGTACCAAAGTACTATTATGTGCCAGCTGACTTTGTAGAATATGAAAAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1243 AATAACCCTGGTAGTCAAAAACGATTTCCTAGCAACTGTGGCCGTGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 232494 AATAACCCTGGTAGTCAAAAACGATTTCCTAGCAACTGTGGCCGTGATGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1293 AAAACTGTTTCTTTGGGGACAAGCACTTTATATCATCGCAAAACTCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 232544 AAAACTGTTTCTTTGGGGACAAGCACTTTATATCATCGCAAAACTCCTGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1343          CTGATGAACTTATTAGTCCTAAAGACATTGATCCTGTCCAG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 232594 GTA...CAGCTGATGAACTTATTAGTCCTAAAGACATTGATCCTGTCCAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1384 CGCTATGTCCCACTAAAGGATCAACGTAACGTGAGCATGAGGTTTTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 246929 CGCTATGTCCCACTAAAGGATCAACGTAACGTGAGCATGAGGTTTTCCAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1434 TCAG         GGCCCACTGGAAAATGACTTGGTAGTTCATGTGGCAC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 246979 TCAGGTA...CAGGGCCCACTGGAAAATGACTTGGTAGTTCATGTGGCAC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1475 TTATAGCAGAAAGCCAAAG         ACTTCAAGTTTTTCTGAACACA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 277134 TTATAGCAGAAAGCCAAAGGTA...TAGACTTCAAGTTTTTCTGAACACA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1516 TATGGTATTCAAACTCAAACTCCTCAACAAGTAGAACCCATTCAGATATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 277683 TATGGTATTCAAACTCAAACTCCTCAACAAGTAGAACCCATTCAGATATG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1566 GCCTCAGCAGGAGCTTGTGAAA         GCTTATTTGCAGCTGGGTA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 277733 GCCTCAGCAGGAGCTTGTGAAAGTA...CAGGCTTATTTGCAGCTGGGTA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1607 TCAATGAAAAGTTAGGACTCTCTGGAAGGCCAGACAGGCCCATTGGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 284614 TCAATGAAAAGTTAGGACTCTCTGGAAGGCCAGACAGGCCCATTGGCTGC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1657 CTCGGGACATCAAAG         ATTTATCGCATTCTAGGAAAGACTGT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 284664 CTCGGGACATCAAAGGTA...CAGATTTATCGCATTCTAGGAAAGACTGT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1698 GGTTTGTTACCCGATTATTTTCGACCTAAGTGATTTCTACATGTCTCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 285188 GGTTTGTTACCCGATTATTTTCGACCTAAGTGATTTCTACATGTCTCAGG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1748 ATGTTTTCCTGCTGATAGATGACATAAAG         AATGCGCTGCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 285238 ATGTTTTCCTGCTGATAGATGACATAAAGGTA...CAGAATGCGCTGCAG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1789 TTCATTAAACAATATTGGAAAATGCATGGACGTCCACTTTTCCTTGTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 286618 TTCATTAAACAATATTGGAAAATGCATGGACGTCCACTTTTCCTTGTTCT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1839 CATCCGGGAAGACAATATAAG         AGGTAGCCGGTTCAACCCCA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 286668 CATCCGGGAAGACAATATAAGGTA...TAGAGGTAGCCGGTTCAACCCCA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1880 TATTAGATATGCTGGCAGCCCTTAAAAAAGGAATAATTGGAGGAGTCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 286913 TATTAGATATGCTGGCAGCCCTTAAAAAAGGAATAATTGGAGGAGTCAAA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1930 GTTCATGTGGATCGTCTACAG         ACACTAATATCTGGAGCTGT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 286963 GTTCATGTGGATCGTCTACAGGTA...CAGACACTAATATCTGGAGCTGT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1971 GGTAGAACAACTTGATTTCCTACGAATCAGTGACACAGAAGA        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 296588 GGTAGAACAACTTGATTTCCTACGAATCAGTGACACAGAAGAGTA...TA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2013  GCTTCCAGAATTTAAGAGTTTTGAGGAACTAGAACCTCCCAAACATTCA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 296718 GGCTTCCAGAATTTAAGAGTTTTGAGGAACTAGAACCTCCCAAACATTCA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2062 AAAGTCAAACGGCAAAGCAGCACCCCTAGTGCTCCTGAACTGGGACAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 296768 AAAGTCAAACGGCAAAGCAGCACCCCTAGTGCTCCTGAACTGGGACAGCA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2112 GCCGGATGTCAACATTAGTGAATGGAAGGACAAACCCACCCACGAAATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 296818 GCCGGATGTCAACATTAGTGAATGGAAGGACAAACCCACCCACGAAATTC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2162 TTCAAAAACTGAAT         GATTGCAGTTGTCTGGCTAGCCAAGCC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 296868 TTCAAAAACTGAATGTG...CAGGATTGCAGTTGTCTGGCTAGCCAAGCC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2203 ATCCTGCTGGGTATACTGCTCAAAAGAGAAGGCCCCAACTTCATCACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 297808 ATCCTGCTGGGTATACTGCTCAAAAGAGAAGGCCCCAACTTCATCACAAA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2253 GGAAG         GTACCGTTTCTGATCACATTGAGAGAGTCTATAGAA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 297858 GGAAGGTA...TAGGTACCGTTTCTGATCACATTGAGAGAGTCTATAGAA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2294 GAGCTGGCAGCCAAAAACTTTG         GTCGGTTGTACGCCGTGCA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 299775 GAGCTGGCAGCCAAAAACTTTGGTT...CAGGTCGGTTGTACGCCGTGCA

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2335 GCAAGTCTTTTAAGTAAAGTAGTGGACAGCCTGGCCCCATCCATTACTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 302023 GCAAGTCTTTTAAGTAAAGTAGTGGACAGCCTGGCCCCATCCATTACTAA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2385 TGTTTTAGTGCAGGGCAAACAG         GTAACTCTGGGTGCCTTTG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 302073 TGTTTTAGTGCAGGGCAAACAGGTA...TAGGTAACTCTGGGTGCCTTTG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2426 GGCATGAAGAAGAAGTTATCTCTAATCCTTTGTCTCCAAGAGTGATTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 305296 GGCATGAAGAAGAAGTTATCTCTAATCCTTTGTCTCCAAGAGTGATTCAA

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2476 AACATCATCTATTATAAGTGTAACACCCATGATGAGAGGGAAGCGGTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 305346 AACATCATCTATTATAAGTGTAACACCCATGATGAGAGGGAAGCGGTCAT

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2526 TCAGAAAGAACTGGTCATCCATATTGGCTGGATCATCTCCAATAACCCTG
        |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 305396 TCAGCAAGAACTGGTCATCCATATTGGCTGGATCATCTCCAATAACCCTG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2576 AGTTATTCAGTGGCATGCTGAAAATACGAATCGG         GTGGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 305446 AGTTATTCAGTGGCATGCTGAAAATACGAATCGGGTG...CAGGTGGATC

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2617 ATCCATGCCATGGAGTATGAACTTCAGATCCGTGGCGGAGACAAGCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 325110 ATCCATGCCATGGAGTATGAACTTCAGATCCGTGGCGGAGACAAGCCAGC

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2667 CTTGGACTTGTATCAGCTGTCACCTAGTGAAGTTAAACAGCTTCTGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 325160 CTTGGACTTGTATCAGCTGTCACCTAGTGAAGTTAAACAGCTTCTGCTGG

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2717 ATATTCTGCAGCCTCAACAGAATGGAAG         ATGTTGGCTGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 325210 ATATTCTGCAGCCTCAACAGAATGGAAGGTA...CAGATGTTGGCTGAAC

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2758 AGGCGTCAGATCGATGGGTCTTTGAATAGAACTCCCACCGGGTTCTATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 329453 AGGCGTCAGATCGATGGGTCTTTGAATAGAACTCCCACCGGGTTCTATGA

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2808 CCGAGTGTGGCAGATTCTGGAGCGCACGCCCAATGGGATCATTGTTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 329503 CCGAGTGTGGCAGATTCTGGAGCGCACGCCCAATGGGATCATTGTTGCTG

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2858 GGAAGCATTTGCCTCAG         CAACCAACCCTGTCAGATATGACC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 329553 GGAAGCATTTGCCTCAGGTA...CAGCAACCAACCCTGTCAGATATGACC

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2899 ATGTATGAGATGAATTTCTCTCTCCTTGTTGAAGACACGTTGGGAAATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 332467 ATGTATGAGATGAATTTCTCTCTCCTTGTTGAAGACACGTTGGGAAATAT

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2949 TGACCAGCCACAGTACAGACAGATCGTTGTAGAG         TTACTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 332517 TGACCAGCCACAGTACAGACAGATCGTTGTAGAGGTG...TAGTTACTTA

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2990 TGGTTGTATCCATTGTACTGGAAAGAAACCCCGAGCTAGAATTTCAAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 334517 TGGTTGTATCCATTGTACTGGAAAGAAACCCCGAGCTAGAATTTCAAGAC

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3040 AAAGTAGATCTAGACAGACTGGTCAAAGAAGCATTTAATGAATTTCAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 334567 AAAGTAGATCTAGACAGACTGGTCAAAGAAGCATTTAATGAATTTCAAAA

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3090 AGATCAGAGTCGGCTAAAGGAAATTGAAAAACAA         GATGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 334617 AGATCAGAGTCGGCTAAAGGAAATTGAAAAACAAGTA...TAGGATGACA

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3131 TGACTTCCTTTTACAACACTCCTCCCCTGGGAAAAAGAGGAACATGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 335298 TGACTTCCTTTTACAACACTCCTCCCCTGGGAAAAAGAGGAACATGCAGC

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3181 TATTTGACAAAGGCGGTGATGAATCTGCTGCTGGAAGGAGAAGTCAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 335348 TATTTGACAAAGGCGGTGATGAATCTGCTGCTGGAAGGAGAAGTCAAGCC

   3500     .    :    .    :    .
   3231 AAACAATGATGACCCGTGTCTGATTAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||
 335398 AAACAATGATGACCCGTGTCTGATTAGC