seq1 = pF1KB9558.tfa, 2049 bp
seq2 = pF1KB9558/gi568815582f_3183819.tfa (gi568815582f:3183819_3390555), 206737 bp

>pF1KB9558 2049
>gi568815582f:3183819_3390555 (Chr16)

1-387  (100001-100387)   100% ->
388-568  (101241-101421)   100% ->
569-642  (101863-101936)   100% ->
643-769  (102205-102331)   100% ->
770-886  (104636-104752)   100% ->
887-2049  (105575-106737)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGTCGGGCCCGGGCTCCCAGGAACGGGAAGGGCTCCTGATAGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGTCGGGCCCGGGCTCCCAGGAACGGGAAGGGCTCCTGATAGTGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTGGAGGAGGACTGCGCCTGGAGCCAGGAGCTGCCCCCACCTGACCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTGGAGGAGGACTGCGCCTGGAGCCAGGAGCTGCCCCCACCTGACCCAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GACCGAGCCCCGAGGCCTCCCACTTGCGCTTCAGACGGTTCCGCTTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GACCGAGCCCCGAGGCCTCCCACTTGCGCTTCAGACGGTTCCGCTTCCAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAGGCAGCTGGTCCCCGGGAAGCCCTCAGCCGGCTCCAAGAGCTTTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GAGGCAGCTGGTCCCCGGGAAGCCCTCAGCCGGCTCCAAGAGCTTTGCCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGGGTGGCTTCGGCCTGAGATGCGCACGAAGGAGCAGATCTTGGAGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGGGTGGCTTCGGCCTGAGATGCGCACGAAGGAGCAGATCTTGGAGCTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGGTGTTAGAGCAGTTCCTGACCATCCTGCCCCAGGAGATCCAGAGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGGTGTTAGAGCAGTTCCTGACCATCCTGCCCCAGGAGATCCAGAGCAGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GTGCAGGAGCTGCATCCGGAGAGCGGCGAAGAAGCGGTGACCCTTGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GTGCAGGAGCTGCATCCGGAGAGCGGCGAAGAAGCGGTGACCCTTGTGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGATATGCAGAGAGAGCTTGGGAGACTGAGACAACAG         GTCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100351 GGATATGCAGAGAGAGCTTGGGAGACTGAGACAACAGGTG...CAGGTCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CAAACCATGGGCGGGGAACAGAAGTGCTTTTGGAGGAGCCTTTGCCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101245 CAAACCATGGGCGGGGAACAGAAGTGCTTTTGGAGGAGCCTTTGCCTCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GAAACAGCACGAGAGTCACCGAGCTTCAAGCTGGAGCCAATGGAGACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101295 GAAACAGCACGAGAGTCACCGAGCTTCAAGCTGGAGCCAATGGAGACTGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GCGAAGCCCTGGCCCCAGGCTGCAGGAGCTGCTAGGCCCCAGCCCCCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101345 GCGAAGCCCTGGCCCCAGGCTGCAGGAGCTGCTAGGCCCCAGCCCCCAAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 GGGACCCCCAGGCTGTAAAGGAGAGGG         CATTATCTGCTCCC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 101395 GGGACCCCCAGGCTGTAAAGGAGAGGGGTG...CAGCATTATCTGCTCCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 TGGCTTTCTCTTTTTCCTCCTGAAGGGAACATGGAAGACAAGGAGATGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101877 TGGCTTTCTCTTTTTCCTCCTGAAGGGAACATGGAAGACAAGGAGATGAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 TGGGCCCCAG         TTGCCTGAGAGCTTAGAGGACGTGGCAATGT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 101927 TGGGCCCCAGGTG...CAGTTGCCTGAGAGCTTAGAGGACGTGGCAATGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 ACATCTCCCAGGAGGAGTGGGGGCATCAGGATCCTAGTAAGAGGGCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102236 ACATCTCCCAGGAGGAGTGGGGGCATCAGGATCCTAGTAAGAGGGCCCTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 TCCAGGGACACGGTGCAGGAGAGTTATGAGAATGTGGACTCACTGG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 102286 TCCAGGGACACGGTGCAGGAGAGTTATGAGAATGTGGACTCACTGGGTA.

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    770      AGTCTCACATTCCCAGTCAGGAGGTCCCAGGCACCCAGGTGGGAC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102336 ..CAGAGTCTCACATTCCCAGTCAGGAGGTCCCAGGCACCCAGGTGGGAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 AAGGAGGAAAGCTATGGGATCCCAGTGTCCAGAGCTGCAAGGAGGGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104681 AAGGAGGAAAGCTATGGGATCCCAGTGTCCAGAGCTGCAAGGAGGGCCTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 AGCCCCAGAGGCCCAGCTCCAG         GAGAAGAGAAATTTGAGAA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 104731 AGCCCCAGAGGCCCAGCTCCAGGTA...CAGGAGAAGAGAAATTTGAGAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 CCTGGAAGGTGTTCCGTCTGTATGCTCTGAGAACATCCACCCTCAGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105594 CCTGGAAGGTGTTCCGTCTGTATGCTCTGAGAACATCCACCCTCAGGTGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 TGCTTCCTGACCAGGCCCGAGGGGAGGTGCCCTGGAGTCCTGAGCTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105644 TGCTTCCTGACCAGGCCCGAGGGGAGGTGCCCTGGAGTCCTGAGCTGGGA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 AGACCTCATGACCGGTCGCAAGGGGATTGGGCGCCTCCCCCAGAGGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105694 AGACCTCATGACCGGTCGCAAGGGGATTGGGCGCCTCCCCCAGAGGGTGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 AATGGAGCAGGCCTTGGCAGGAGCCTCAAGTGGCAGAGAACTGGGGCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105744 AATGGAGCAGGCCTTGGCAGGAGCCTCAAGTGGCAGAGAACTGGGGCGAC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 CGAAGGAACTGCAGCCAAAGAAACTCCATTTATGTCCCTTGTGTGGCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105794 CGAAGGAACTGCAGCCAAAGAAACTCCATTTATGTCCCTTGTGTGGCAAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 AATTTCTCTAACAACTCAAACCTAATTAGGCACCAGAGAATACATGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105844 AATTTCTCTAACAACTCAAACCTAATTAGGCACCAGAGAATACATGCAGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 TGAAAGACTGTGTATGGGTGTGGACTGCACTGAAATCTTTGGTGGGAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105894 TGAAAGACTGTGTATGGGTGTGGACTGCACTGAAATCTTTGGTGGGAACC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1256 CACGTTTCCTGTCACTACACAGAGCACACCTGGGAGAGGAGGCCCACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105944 CACGTTTCCTGTCACTACACAGAGCACACCTGGGAGAGGAGGCCCACAAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1306 TGCCTTGAATGTGGGAAATGCTTCAGTCAGAACACCCATCTGACTCGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105994 TGCCTTGAATGTGGGAAATGCTTCAGTCAGAACACCCATCTGACTCGCCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1356 CCAACGCACCCACACGGGTGAGAAGCCCTATCAGTGCAACATTTGCGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106044 CCAACGCACCCACACGGGTGAGAAGCCCTATCAGTGCAACATTTGCGGAA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1406 AATGTTTCTCCTGCAACTCCAACCTCCACAGGCACCAGAGAACGCACACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106094 AATGTTTCTCCTGCAACTCCAACCTCCACAGGCACCAGAGAACGCACACT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1456 GGGGAGAAGCCCTACAAGTGCCCTGAGTGTGGGGAGATCTTTGCTCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106144 GGGGAGAAGCCCTACAAGTGCCCTGAGTGTGGGGAGATCTTTGCTCACAG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1506 TTCCAACCTCCTTCGGCACCAGAGAATTCACACTGGAGAGCGACCTTATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106194 TTCCAACCTCCTTCGGCACCAGAGAATTCACACTGGAGAGCGACCTTATA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1556 AGTGTCCCGAGTGTGGGAAAAGTTTCTCTCGGAGTTCACACCTCGTCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106244 AGTGTCCCGAGTGTGGGAAAAGTTTCTCTCGGAGTTCACACCTCGTCATT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1606 CACGAAAGAACTCATGAGAGAGAGAGACTTTACCCCTTCTCTGAGTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106294 CACGAAAGAACTCATGAGAGAGAGAGACTTTACCCCTTCTCTGAGTGTGG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1656 GGAAGCTGTGAGTGACAGCACCCCCTTTCTTACAAACCATGGAGCCCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106344 GGAAGCTGTGAGTGACAGCACCCCCTTTCTTACAAACCATGGAGCCCATA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1706 AGGCAGAGAAGAAGCTCTTTGAATGTTTGACTTGTGGGAAAAGCTTCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106394 AGGCAGAGAAGAAGCTCTTTGAATGTTTGACTTGTGGGAAAAGCTTCCGG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1756 CAGGGCATGCACCTCACCAGACATCAGAGAACACACACAGGAGAGAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106444 CAGGGCATGCACCTCACCAGACATCAGAGAACACACACAGGAGAGAAACC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1806 GTATAAATGTACCCTTTGTGGGGAAAACTTCTCTCATAGATCCAATTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106494 GTATAAATGTACCCTTTGTGGGGAAAACTTCTCTCATAGATCCAATTTAA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1856 TCAGGCACCAGAGAATCCACACAGGAGAAAAACCCTATACCTGTCATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106544 TCAGGCACCAGAGAATCCACACAGGAGAAAAACCCTATACCTGTCATGAG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1906 TGCGGAGACAGCTTCTCTCACAGCTCCAATCGGATTCGCCACCTGAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106594 TGCGGAGACAGCTTCTCTCACAGCTCCAATCGGATTCGCCACCTGAGAAC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1956 GCATACGGGAGAGAGACCCTATAAATGTTCTGAATGTGGAGAAAGCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106644 GCATACGGGAGAGAGACCCTATAAATGTTCTGAATGTGGAGAAAGCTTCT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :
   2006 CTCGGAGTTCCCGTCTTATGAGTCATCAGAGAACTCACACAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106694 CTCGGAGTTCCCGTCTTATGAGTCATCAGAGAACTCACACAGGT