seq1 = pF1KB9553.tfa, 783 bp
seq2 = pF1KB9553/gi568815576r_28695549.tfa (gi568815576r:28695549_28900524), 204976 bp

>pF1KB9553 783
>gi568815576r:28695549_28900524 (Chr22)

(complement)

1-227  (100001-100227)   100% ->
228-324  (101372-101468)   100% ->
325-453  (103320-103448)   100% ->
454-599  (104333-104478)   100% ->
600-783  (104793-104976)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTGGTGGTGGCAGCCGCGCCGAACCCGGCCGACGGGACCCCTAAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTGGTGGTGGCAGCCGCGCCGAACCCGGCCGACGGGACCCCTAAAGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCTGCTTCTGTCGGGGCAGCCCGCCTCCGCCGCCGGAGCCCCGGCCGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCTGCTTCTGTCGGGGCAGCCCGCCTCCGCCGCCGGAGCCCCGGCCGGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGCCCTGCCGCTCATGGTGCCAGCCCAGAGAGGGGCCAGCCCGGAGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGGCCCTGCCGCTCATGGTGCCAGCCCAGAGAGGGGCCAGCCCGGAGGCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCGAGCGGGGGGCTGCCCCAGGCGCGCAAGCGACAGCGCCTCACGCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCGAGCGGGGGGCTGCCCCAGGCGCGCAAGCGACAGCGCCTCACGCACCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GAGCCCCGAGGAGAAGGCGCTGAGGAG         GAAACTGAAAAACA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 100201 GAGCCCCGAGGAGAAGGCGCTGAGGAGGTG...TAGGAAACTGAAAAACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GAGTAGCAGCTCAGACTGCCAGAGATCGAAAGAAGGCTCGAATGAGTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101386 GAGTAGCAGCTCAGACTGCCAGAGATCGAAAGAAGGCTCGAATGAGTGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CTGGAACAGCAAGTGGTAGATTTAGAAGAAGAG         AACCAAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 101436 CTGGAACAGCAAGTGGTAGATTTAGAAGAAGAGGTA...CAGAACCAAAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 ACTTTTGCTAGAAAATCAGCTTTTACGAGAGAAAACTCATGGCCTTGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103328 ACTTTTGCTAGAAAATCAGCTTTTACGAGAGAAAACTCATGGCCTTGTAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TTGAGAACCAGGAGTTAAGACAGCGCTTGGGGATGGATGCCCTGGTTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103378 TTGAGAACCAGGAGTTAAGACAGCGCTTGGGGATGGATGCCCTGGTTGCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GAAGAGGAGGCGGAAGCCAAG         GGGAATGAAGTGAGGCCAGT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 103428 GAAGAGGAGGCGGAAGCCAAGGTA...CAGGGGAATGAAGTGAGGCCAGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GGCCGGGTCTGCTGAGTCCGCAGCACTCAGACTACGTGCACCTCTGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104353 GGCCGGGTCTGCTGAGTCCGCAGCACTCAGACTACGTGCACCTCTGCAGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AGGTGCAGGCCCAGTTGTCACCCCTCCAGAACATCTCCCCATGGATTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104403 AGGTGCAGGCCCAGTTGTCACCCCTCCAGAACATCTCCCCATGGATTCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GCGGTATTGACTCTTCAGATTCAGAG         TCTGATATCCTGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 104453 GCGGTATTGACTCTTCAGATTCAGAGGTA...CAGTCTGATATCCTGTTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GGCATTCTGGACAACTTGGACCCAGTCATGTTCTTCAAATGCCCTTCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104808 GGCATTCTGGACAACTTGGACCCAGTCATGTTCTTCAAATGCCCTTCCCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 AGAGCCTGCCAGCCTGGAGGAGCTCCCAGAGGTCTACCCAGAAGGACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104858 AGAGCCTGCCAGCCTGGAGGAGCTCCCAGAGGTCTACCCAGAAGGACCCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GTTCCTTACCAGCCTCCCTTTCTCTGTCAGTGGGGACGTCATCAGCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104908 GTTCCTTACCAGCCTCCCTTTCTCTGTCAGTGGGGACGTCATCAGCCAAG

    800     .    :    .
    765 CTGGAAGCCATTAATGAAC
        |||||||||||||||||||
 104958 CTGGAAGCCATTAATGAAC