seq1 = pF1KB9552.tfa, 1398 bp
seq2 = pF1KB9552/gi568815576r_37873498.tfa (gi568815576r:37873498_38083784), 210287 bp

>pF1KB9552 1398
>gi568815576r:37873498_38083784 (Chr22)

(complement)

1-428  (100001-100428)   99% ->
429-697  (105650-105918)   100% ->
698-1398  (109587-110287)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGAGGAGCAGGATCTATCGGAGGTGGAGCTGAGCCCCGTGGGCTC
        ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGAGGAGCAGGACCTATCGGAGGTGGAGCTGAGCCCCGTGGGCTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAGGAGCCCCGCTGCCTGTCCCCGGGGAGCGCGCCCTCGCTAGGGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGAGGAGCCCCGCTGCCTGTCCCCGGGGAGCGCGCCCTCGCTAGGGCCCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACGGCGGCGGCGGCGGATCGGGCCTGCGAGCCAGCCCGGGGCCAGGCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACGGCGGCGGCGGCGGATCGGGCCTGCGAGCCAGCCCGGGGCCAGGCGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGGGCAAGGTCAAGAAGGAGCAGCAGGACGGCGAGGCGGACGATGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTGGGCAAGGTCAAGAAGGAGCAGCAGGACGGCGAGGCGGACGATGACAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GTTCCCCGTGTGCATCCGCGAGGCCGTCAGCCAGGTGCTCAGCGGCTACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GTTCCCCGTGTGCATCCGCGAGGCCGTCAGCCAGGTGCTCAGCGGCTACG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACTGGACGCTGGTGCCCATGCCCGTGCGCGTCAACGGCGCCAGCAAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACTGGACGCTGGTGCCCATGCCCGTGCGCGTCAACGGCGCCAGCAAAAGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AAGCCGCACGTCAAGCGGCCCATGAACGCCTTCATGGTGTGGGCTCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AAGCCGCACGTCAAGCGGCCCATGAACGCCTTCATGGTGTGGGCTCAGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AGCGCGCAGGAAGCTCGCGGACCAGTACCCGCACCTGCACAACGCTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AGCGCGCAGGAAGCTCGCGGACCAGTACCCGCACCTGCACAACGCTGAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCAGCAAGACGCTGGGCAAGCTCTGGAG         GCTGCTGAACGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 100401 TCAGCAAGACGCTGGGCAAGCTCTGGAGGTG...CAGGCTGCTGAACGAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 AGTGACAAGCGCCCCTTCATCGAGGAGGCTGAGCGGCTCCGTATGCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105663 AGTGACAAGCGCCCCTTCATCGAGGAGGCTGAGCGGCTCCGTATGCAGCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CAAGAAAGACCACCCGGACTACAAGTACCAGCCCAGGCGGCGGAAGAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105713 CAAGAAAGACCACCCGGACTACAAGTACCAGCCCAGGCGGCGGAAGAACG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 GGAAGGCCGCCCAGGGCGAGGCGGAGTGCCCCGGTGGGGAGGCCGAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105763 GGAAGGCCGCCCAGGGCGAGGCGGAGTGCCCCGGTGGGGAGGCCGAGCAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 GGTGGGACCGCCGCCATCCAGGCCCACTACAAGAGCGCCCACTTGGACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105813 GGTGGGACCGCCGCCATCCAGGCCCACTACAAGAGCGCCCACTTGGACCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 CCGGCACCCAGGAGAGGGCTCCCCCATGTCAGATGGGAACCCCGAGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105863 CCGGCACCCAGGAGAGGGCTCCCCCATGTCAGATGGGAACCCCGAGCACC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 CCTCAG         GCCAGAGCCATGGCCCACCCACCCCTCCAACCACC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105913 CCTCAGGTG...CAGGCCAGAGCCATGGCCCACCCACCCCTCCAACCACC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 CCGAAGACAGAGCTGCAGTCGGGCAAGGCAGACCCGAAGCGGGACGGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109622 CCGAAGACAGAGCTGCAGTCGGGCAAGGCAGACCCGAAGCGGGACGGGCG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 CTCCATGGGGGAGGGCGGGAAGCCTCACATCGACTTCGGCAACGTGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109672 CTCCATGGGGGAGGGCGGGAAGCCTCACATCGACTTCGGCAACGTGGACA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 TTGGTGAGATCAGCCACGAGGTAATGTCCAACATGGAGACCTTTGATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109722 TTGGTGAGATCAGCCACGAGGTAATGTCCAACATGGAGACCTTTGATGTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 GCTGAGTTGGACCAGTACCTGCCGCCCAATGGGCACCCAGGCCATGTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109772 GCTGAGTTGGACCAGTACCTGCCGCCCAATGGGCACCCAGGCCATGTGAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 CAGCTACTCAGCAGCCGGCTATGGGCTGGGCAGTGCCCTGGCCGTGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109822 CAGCTACTCAGCAGCCGGCTATGGGCTGGGCAGTGCCCTGGCCGTGGCCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 GTGGACACTCCGCCTGGATCTCCAAGCCACCAGGCGTGGCTCTGCCCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109872 GTGGACACTCCGCCTGGATCTCCAAGCCACCAGGCGTGGCTCTGCCCACG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 GTCTCACCACCTGGTGTGGATGCCAAAGCCCAGGTGAAGACAGAGACCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109922 GTCTCACCACCTGGTGTGGATGCCAAAGCCCAGGTGAAGACAGAGACCGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 GGGGCCCCAGGGGCCCCCACACTACACCGACCAGCCATCCACCTCACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109972 GGGGCCCCAGGGGCCCCCACACTACACCGACCAGCCATCCACCTCACAGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 TCGCCTACACCTCCCTCAGCCTGCCCCACTATGGCTCAGCCTTCCCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110022 TCGCCTACACCTCCCTCAGCCTGCCCCACTATGGCTCAGCCTTCCCCTCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1183 ATCTCCCGCCCCCAGTTTGACTACTCTGACCATCAGCCCTCAGGACCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110072 ATCTCCCGCCCCCAGTTTGACTACTCTGACCATCAGCCCTCAGGACCCTA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1233 TTATGGCCACTCGGGCCAGGCCTCTGGCCTCTACTCGGCCTTCTCCTATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110122 TTATGGCCACTCGGGCCAGGCCTCTGGCCTCTACTCGGCCTTCTCCTATA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1283 TGGGGCCCTCGCAGCGGCCCCTCTACACGGCCATCTCTGACCCCAGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110172 TGGGGCCCTCGCAGCGGCCCCTCTACACGGCCATCTCTGACCCCAGCCCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1333 TCAGGGCCCCAGTCCCACAGCCCCACACACTGGGAGCAGCCAGTATATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110222 TCAGGGCCCCAGTCCCACAGCCCCACACACTGGGAGCAGCCAGTATATAC

   1400     .    :    .
   1383 GACACTGTCCCGGCCC
        ||||||||||||||||
 110272 GACACTGTCCCGGCCC