seq1 = pF1KB9550.tfa, 951 bp
seq2 = pF1KB9550/gi568815576f_32258072.tfa (gi568815576f:32258072_32460829), 202758 bp

>pF1KB9550 951
>gi568815576f:32258072_32460829 (Chr22)

1-373  (100001-100373)   100% ->
374-951  (102181-102758)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAAAGGTTGTCACTTGTCACAACTAACAGGCTTTCACCTCAAGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAAAGGTTGTCACTTGTCACAACTAACAGGCTTTCACCTCAAGGAAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTTTCTTCCCTTGTGTACTTTTCCCCTGGCAGTGGACATGGCTGCACTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTTTCTTCCCTTGTGTACTTTTCCCCTGGCAGTGGACATGGCTGCACTCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCCAAGAAGCAAGCAGCTGTCCCGTCTGCTCAGACTATCTGGAAAAACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCCAAGAAGCAAGCAGCTGTCCCGTCTGCTCAGACTATCTGGAAAAACCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATGTCCCTGGAGTGTGGATGCACCGTCTGCCTCAAGTGCATCAATTCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATGTCCCTGGAGTGTGGATGCACCGTCTGCCTCAAGTGCATCAATTCGCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCAGAAGGAGCCCCATGGGGAGGATCTGCTTTGCTGTTGCTGTTCCATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCAGAAGGAGCCCCATGGGGAGGATCTGCTTTGCTGTTGCTGTTCCATGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCTCTCAGAGGAACAAAATCAGGCCCAATCGGCAGCTAGAGAGGCTGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCTCTCAGAGGAACAAAATCAGGCCCAATCGGCAGCTAGAGAGGCTGGTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TCCCACATCAAGGAACTGGAGCCCAAGCTGAAGAAGATTCTACAGATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TCCCACATCAAGGAACTGGAGCCCAAGCTGAAGAAGATTCTACAGATGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCCAAGGATGCGGAAGTTCCAAG         TGGATATGACCTTGGATG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100351 CCCAAGGATGCGGAAGTTCCAAGGTA...CAGTGGATATGACCTTGGATG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CCGACACAGCCAACAACTTCCTCCTCATTTCTGACGACCTCAGGAGCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102199 CCGACACAGCCAACAACTTCCTCCTCATTTCTGACGACCTCAGGAGCGTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CGAAGTGGGCTCATCACACAGAATCGGCAAGACCTTGCCGAGAGATTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102249 CGAAGTGGGCTCATCACACAGAATCGGCAAGACCTTGCCGAGAGATTTGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CGTGTCCGTTTGCATCCTGGGCTCCCCTCGCTTTACCTGTGGCCGCCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102299 CGTGTCCGTTTGCATCCTGGGCTCCCCTCGCTTTACCTGTGGCCGCCACT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 ACTGGGAGGTGGACGTGGGAACAAGCACAGAATGGGACCTGGGAGTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102349 ACTGGGAGGTGGACGTGGGAACAAGCACAGAATGGGACCTGGGAGTCTGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 AGAGAATCTGTTCACTGCAAAGGGAAGATCCAGCTGACCACAGAGCTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102399 AGAGAATCTGTTCACTGCAAAGGGAAGATCCAGCTGACCACAGAGCTTGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 ATTCTGGACTGTGAGTTTGAGGGATGGAAGCCGCCTCTCTGCCAGCACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102449 ATTCTGGACTGTGAGTTTGAGGGATGGAAGCCGCCTCTCTGCCAGCACGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TGCCGCTGACTTTCCTCTTAGTAGACCGCAAGTTACAGCGAGTGGGGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102499 TGCCGCTGACTTTCCTCTTAGTAGACCGCAAGTTACAGCGAGTGGGGATT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 TTTCTGGATATGGGCATGCAGAACGTTTCCTTTTTTGATGCTGAAAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102549 TTTCTGGATATGGGCATGCAGAACGTTTCCTTTTTTGATGCTGAAAGTGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 TTCCCATGTCTATACATTCAGGAGCGTCTCTGCTGAGGAGCCACTGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102599 TTCCCATGTCTATACATTCAGGAGCGTCTCTGCTGAGGAGCCACTGCGCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 CATTTTTGGCTCCTTCAATTCCACCTAATGGTGATCAAGGTGTCTTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102649 CATTTTTGGCTCCTTCAATTCCACCTAATGGTGATCAAGGTGTCTTGAGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 ATCTGTCCTTTGATGAACTCAGGCACTACTGATGCTCCAGTCCGTCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102699 ATCTGTCCTTTGATGAACTCAGGCACTACTGATGCTCCAGTCCGTCCTGG

    950     .    :
    942 GGAGGCCAAA
        ||||||||||
 102749 GGAGGCCAAA