seq1 = pF1KB9548.tfa, 381 bp
seq2 = pF1KB9548/gi568815576f_37856773.tfa (gi568815576f:37856773_38067712), 210940 bp

>pF1KB9548 381
>gi568815576f:37856773_38067712 (Chr22)

1-20  (97016-97035)   100% ->
21-90  (100001-100070)   100% ->
91-221  (102574-102704)   100% ->
222-293  (110327-110398)   100% ->
294-381  (110853-110940)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCAGACAACGAGGACAA         TTTTGATGGCGACGACTTTGA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
  97016 ATGTCAGACAACGAGGACAAGTG...CAGTTTTGATGGCGACGACTTTGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 TGATGTGGAGGAGGATGAAGGGCTAGATGACTTGGAGAATGCCGAAGAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 100022 TGATGTGGAGGAGGATGAAGGGCTAGATGACTTGGAGAATGCCGAAGAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     91         GAAGGCCAGGAGAATGTCGAGATCCTCCCCTCTGGGGAGCGA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100072 TC...CAGGAAGGCCAGGAGAATGTCGAGATCCTCCCCTCTGGGGAGCGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 CCGCAGGCCAACCAGAAGCGAATCACCACACCATACATGACCAAGTACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102616 CCGCAGGCCAACCAGAAGCGAATCACCACACCATACATGACCAAGTACGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GCGAGCCCGCGTGCTGGGCACCCGAGCGCTCCAGATTGC         GA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 102666 GCGAGCCCGCGTGCTGGGCACCCGAGCGCTCCAGATTGCGTG...CAGGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 TGTGTGCCCCTGTGATGGTGGAGCTGGAGGGGGAGACAGATCCTCTGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110329 TGTGTGCCCCTGTGATGGTGGAGCTGGAGGGGGAGACAGATCCTCTGCTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 ATTGCCATGAAGGAACTCAA         GGCCCGAAAGATCCCCATCAT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 110379 ATTGCCATGAAGGAACTCAAGTA...CAGGGCCCGAAAGATCCCCATCAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 CATTCGCCGTTACCTGCCAGATGGGAGCTATGAAGACTGGGGGGTGGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110874 CATTCGCCGTTACCTGCCAGATGGGAGCTATGAAGACTGGGGGGTGGACG

    400     .    :    .
    365 AGCTCATCATCACCGAC
        |||||||||||||||||
 110924 AGCTCATCATCACCGAC