seq1 = pF1KB9546.tfa, 1467 bp
seq2 = pF1KB9546/gi568815576r_44783089.tfa (gi568815576r:44783089_45109549), 326461 bp

>pF1KB9546 1467
>gi568815576r:44783089_45109549 (Chr22)

(complement)

1-54  (100001-100054)   100% ->
55-120  (100940-101005)   100% ->
121-213  (189060-189152)   100% ->
214-564  (192920-193270)   99% ->
565-705  (195588-195728)   100% ->
706-757  (213467-213518)   100% ->
758-834  (216017-216093)   100% ->
835-889  (218190-218244)   100% ->
890-912  (219768-219790)   100% ->
913-1071  (221429-221587)   100% ->
1072-1147  (223612-223687)   100% ->
1148-1251  (224021-224124)   100% ->
1252-1467  (226246-226461)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGCTGCAGAGCCGGCCCGAGGCGCTCGCCGTGGAACTCGCGCGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGCTGCAGAGCCGGCCCGAGGCGCTCGCCGTGGAACTCGCGCGCCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCAG         AACGGCGACCTCAAGAAGCAGCTCCACGAAAGGCAGC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCAGGTA...CAGAACGGCGACCTCAAGAAGCAGCTCCACGAAAGGCAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CGCGGATCGCCGCGCTCAGCGACAAACAA         GCTTTGGGAACG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100977 CGCGGATCGCCGCGCTCAGCGACAAACAAGTA...CAGGCTTTGGGAACG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 ATCACTGCAGTGCCTGTCACGGGTCCTCAGGTCAGCTCCTTGCAGAGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 189072 ATCACTGCAGTGCCTGTCACGGGTCCTCAGGTCAGCTCCTTGCAGAGGTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GGCCGGGCAAGGAGCGGCAGTGCTACCTCAG         GTTAGGCCAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 189122 GGCCGGGCAAGGAGCGGCAGTGCTACCTCAGGTA...CAGGTTAGGCCAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 AGACTCTGATTCCAGACAGCCTCCCCGTTGCCCCGGGCCGGGACCGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192930 AGACTCTGATTCCAGACAGCCTCCCCGTTGCCCCGGGCCGGGACCGGCCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 CCCAAGCAGCCCCCAACATTCCAGAAGGCCACCGTGGTCAGCGTCAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192980 CCCAAGCAGCCCCCAACATTCCAGAAGGCCACCGTGGTCAGCGTCAAGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CCCCAGCCCAGCCCTCCCCACCGCCAACAACACTGTCAGCCATGTGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193030 CCCCAGCCCAGCCCTCCCCACCGCCAACAACACTGTCAGCCATGTGCCAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CGCCCGGCAGCCAGCCCCAGGCCCTCGCCGAGCCCGCCGCCCTCGCCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193080 CGCCCGGCAGCCAGCCCCAGGCCCTCGCCGAGCCCGCCGCCCTCGCCTCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CCGCTGAGCAGTGCGGGGGTGGCCTACGCCATCATCTCCACCTCCCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193130 CCGCTGAGCAGTGCGGGGGTGGCCTACGCCATCATCTCCACCTCCCCCAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CAATGCTGCCGCCATGGCCCCCAGCACCGCCGTGTCTGTGGTCAGTGACA
        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193180 CAATGCCGCCGCCATGGCCCCCAGCACCGCCGTGTCTGTGGTCAGTGACA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GCATCAAAGTCCAGCCCCTCCTCATCAGTGCTGACAACAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 193230 GCATCAAAGTCCAGCCCCTCCTCATCAGTGCTGACAACAAGGTG...CAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GTCATCATCATTCAGCCTCAAGTGCAGACGCAGCCCGAGAGCACGGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 195588 GTCATCATCATTCAGCCTCAAGTGCAGACGCAGCCCGAGAGCACGGCAGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GTCGCGGCCGCCCACAGAGGAGCCATCTCAGGGAGCTCAGGCCACCAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 195638 GTCGCGGCCGCCCACAGAGGAGCCATCTCAGGGAGCTCAGGCCACCAAAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 AGAAGAAGGAAGACCGGCCCCCGACCCAGGAGAACCCCGAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 195688 AGAAGAAGGAAGACCGGCCCCCGACCCAGGAGAACCCCGAGGTA...CAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 AAAATCGCCTTCATGGTAGCGCTAGGCCTGGTTACCACGGAACATTTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 213467 AAAATCGCCTTCATGGTAGCGCTAGGCCTGGTTACCACGGAACATTTGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 AG         AAATCCAGAGCAAGCGACAGGAGCGGAAGAGAAGAAGCA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 213517 AGGTA...CAGAAATCCAGAGCAAGCGACAGGAGCGGAAGAGAAGAAGCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 CAGCCAACCCTGCCTACAGCGGCCTCCTGGAGACCGAG         AGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 216056 CAGCCAACCCTGCCTACAGCGGCCTCCTGGAGACCGAGGTG...CAGAGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 AAACGGCTGGCCTCCAACTATCTCAACAACCCCCTGTTCCTCACAGCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 218193 AAACGGCTGGCCTCCAACTATCTCAACAACCCCCTGTTCCTCACAGCGAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 AG         CCAATGAGGACCCCTGCTGGAAG         AACGAGA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 218243 AGGTA...TAGCCAATGAGGACCCCTGCTGGAAGGTA...CAGAACGAGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 TCACCCACGATGAGCACTGTGCCGCCTGCAAGCGAGGGGCCAACCTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 221436 TCACCCACGATGAGCACTGTGCCGCCTGCAAGCGAGGGGCCAACCTGCAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 CCCTGCGGCACCTGCCCGGGGGCCTACCACCTCAGCTGCCTGGAGCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 221486 CCCTGCGGCACCTGCCCGGGGGCCTACCACCTCAGCTGCCTGGAGCCGCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 CCTCAAGACGGCGCCCAAGGGCGTGTGGGTGTGCCCCAGGTGCCAGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 221536 CCTCAAGACGGCGCCCAAGGGCGTGTGGGTGTGCCCCAGGTGCCAGCAGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 AG         GCCTTAAAGAAAGACGAGGGTGTGCCCTGGACTGGGATG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 221586 AGGTA...CAGGCCTTAAAGAAAGACGAGGGTGTGCCCTGGACTGGGATG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 CTGGCCATCGTGCACTCTTATGTCACCCACAAGACAG         TCAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 223651 CTGGCCATCGTGCACTCTTATGTCACCCACAAGACAGGTG...TAGTCAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1152 AGAAGAGGAGAAGCAGAAGCTGCTGCAACGAGGCAGTGAGCTGCAGAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 224025 AGAAGAGGAGAAGCAGAAGCTGCTGCAACGAGGCAGTGAGCTGCAGAACG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1202 AGCACCAGCAGCTGGAGGAGCGGGACCGGCGGCTGGCGTCAGCAGTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 224075 AGCACCAGCAGCTGGAGGAGCGGGACCGGCGGCTGGCGTCAGCAGTGCAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252          AAATGCCTGGAGTTGAAGACAAGCCTGCTGGCCCGCCAGAG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 224125 GTG...CAGAAATGCCTGGAGTTGAAGACAAGCCTGCTGGCCCGCCAGAG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1293 GGGCACCCAGTCATCCCTGGACCGCCTGCGGGCCCTCCTGAGACTGATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 226287 GGGCACCCAGTCATCCCTGGACCGCCTGCGGGCCCTCCTGAGACTGATAC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1343 AGGGCGAGCAGCTGCTCCAGGTCACCATGACGACCACTAGCCCTGCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 226337 AGGGCGAGCAGCTGCTCCAGGTCACCATGACGACCACTAGCCCTGCCCCA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1393 CTGCTGGCCGGGCCCTGGACCAAGCCCTCAGTGGCAGCCACACACCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 226387 CTGCTGGCCGGGCCCTGGACCAAGCCCTCAGTGGCAGCCACACACCCCAC

   1550     .    :    .    :    .
   1443 CGTCCAGCACCCCCAGGGCCACAAC
        |||||||||||||||||||||||||
 226437 CGTCCAGCACCCCCAGGGCCACAAC