seq1 = pF1KB9499.tfa, 3402 bp
seq2 = pF1KB9499/gi568815582f_4752918.tfa (gi568815582f:4752918_4980129), 227212 bp

>pF1KB9499 3402
>gi568815582f:4752918_4980129 (Chr16)

1-249  (100001-100249)   100% ->
250-336  (105073-105159)   100% ->
337-432  (105651-105746)   100% ->
433-567  (106108-106242)   100% ->
568-671  (106948-107051)   100% ->
672-1110  (107747-108185)   100% ->
1111-1181  (115916-115986)   100% ->
1182-1311  (117295-117424)   100% ->
1312-1430  (117599-117717)   100% ->
1431-1559  (117927-118055)   100% ->
1560-1706  (118238-118384)   100% ->
1707-1757  (119967-120017)   100% ->
1758-1800  (120114-120156)   100% ->
1801-3024  (121294-122517)   99% ->
3025-3265  (123954-124194)   100% ->
3266-3355  (124468-124557)   100% ->
3356-3402  (127166-127212)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCGGAGCCCCACAGGGTCCAGTTCACCTCTCTCCCAGGTTCCCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCGGAGCCCCACAGGGTCCAGTTCACCTCTCTCCCAGGTTCCCTGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCCTGCGTTTTTGAAGAAGTCCCGGAAGGAGGAGGCTGGGGCAGGAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCCTGCGTTTTTGAAGAAGTCCCGGAAGGAGGAGGCTGGGGCAGGAGAAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGCATCAGGACTGTGAGCCGGCTGCAGCAGCTGTTCGGATTACACTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGCATCAGGACTGTGAGCCGGCTGCAGCAGCTGTTCGGATTACACTCACC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTCTTTGAACCAGATCACAAACGCTGCCCAGAGTTCTTCTACCCAGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTCTTTGAACCAGATCACAAACGCTGCCCAGAGTTCTTCTACCCAGAGCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGTGAAGAATATCCGAGGGAAGGTAAAAGGCCTTCAGCCTGGAGATAAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 100201 GGTGAAGAATATCCGAGGGAAGGTAAAAGGCCTTCAGCCTGGAGATAAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    250         AAGAAAGATCTGTCAGATCCTTTCAATGACGAAGAAAAGGAA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TA...CAGAAGAAAGATCTGTCAGATCCTTTCAATGACGAAGAAAAGGAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AGGCATAAAGTAGAGGCCCTTGCCCGAAAATTTGAAGAAAAATAC     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 105115 AGGCATAAAGTAGAGGCCCTTGCCCGAAAATTTGAAGAAAAATACGTA..

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    337     GGTGGAAAGAAACGTAGAAAAGACCGAATACAGGACTTGATCGATA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105165 .TAGGGTGGAAAGAAACGTAGAAAAGACCGAATACAGGACTTGATCGATA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TGGGGTATGGTTATGATGAATCCGACTCCTTCATCGATAACTCTGAGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105697 TGGGGTATGGTTATGATGAATCCGACTCCTTCATCGATAACTCTGAGGCG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433          TATGATGAGCTTGTTCCTGCTTCTTTGACTACGAAGTATGG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105747 GTA...CAGTATGATGAGCTTGTTCCTGCTTCTTTGACTACGAAGTATGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AGGATTTTACATTAACTCGGGAACCCTGCAGTTTAGACAAGCATCAGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106149 AGGATTTTACATTAACTCGGGAACCCTGCAGTTTAGACAAGCATCAGAGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CTGAAGATGACTTCATTAAAGAAAAGAAGAAAAAATCTCCAAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 106199 CTGAAGATGACTTCATTAAAGAAAAGAAGAAAAAATCTCCAAAGGTT...

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    568    AAGCGGAAGTTGAAGGAAGGTGGTGAGAAGATAAAGAAGAAGAAAAA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106945 CAGAAGCGGAAGTTGAAGGAAGGTGGTGAGAAGATAAAGAAGAAGAAAAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 AGATGACACTTATGACAAGGAGAAGAAATCGAAAAAGTCCAAGTTTTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106995 AGATGACACTTATGACAAGGAGAAGAAATCGAAAAAGTCCAAGTTTTCCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 AAGCCGG         CTTCACAGCCCTCAATGCCAGTAAGGAGAAGAAG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107045 AAGCCGGGTG...CAGCTTCACAGCCCTCAATGCCAGTAAGGAGAAGAAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 AAGAAGAAATATTCTGGGGCTTTAAGCGTTAAAGAGATGCTAAAGAAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107781 AAGAAGAAATATTCTGGGGCTTTAAGCGTTAAAGAGATGCTAAAGAAATT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TCAGAAAGAGAAAGAGGCTCAGAAAAAAAGGGAGGAGGAGCATAAGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107831 TCAGAAAGAGAAAGAGGCTCAGAAAAAAAGGGAGGAGGAGCATAAGCCTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TTGCGGTCCCATCAGCGGAAGCTCAGGGCCTGCGGGAACTGGAGGGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107881 TTGCGGTCCCATCAGCGGAAGCTCAGGGCCTGCGGGAACTGGAGGGTGCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 TCTGACCCCTTGCTCTCACTCTTTGGCTCTACTTCTGACAACGACTTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107931 TCTGACCCCTTGCTCTCACTCTTTGGCTCTACTTCTGACAACGACTTGCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 CCAGGCGGCCACTGCCATGGACTCGCTGACGGATTTGGACTTGGAGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107981 CCAGGCGGCCACTGCCATGGACTCGCTGACGGATTTGGACTTGGAGCATC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 TGCTCAGTGAGTCTCCAGAAGGAAGTCCCTTCCGAGATATGGATGATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108031 TGCTCAGTGAGTCTCCAGAAGGAAGTCCCTTCCGAGATATGGATGATGGA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 AGTGATTCCCTTGGGGTGGGATTGGACCAGGAATTCAGGCAGCCCTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108081 AGTGATTCCCTTGGGGTGGGATTGGACCAGGAATTCAGGCAGCCCTCTTC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 TCTCCCCGAAGGCCTGCCAGCACCCCTGGAGAAGCGCGTTAAGGAGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108131 TCTCCCCGAAGGCCTGCCAGCACCCCTGGAGAAGCGCGTTAAGGAGCTGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 CTCAG         GCTGCCAGAGCTGCTGAGGGGGAGAGCAGACAGAAG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108181 CTCAGGTA...CAGGCTGCCAGAGCTGCTGAGGGGGAGAGCAGACAGAAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 TTCTTCACCCAGGATATTAATGGAATCCTATTAGA         CATAGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 115952 TTCTTCACCCAGGATATTAATGGAATCCTATTAGAGTG...CAGCATAGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 GGCGCAGACTCGGGAGCTGAGCAGTCAGGTCCGCTCTGGGGTGTATGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117301 GGCGCAGACTCGGGAGCTGAGCAGTCAGGTCCGCTCTGGGGTGTATGCCT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 ATCTTGCGTCATTCCTGCCCTGCAGCAAGGATGCCCTGCTCAAGCGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117351 ATCTTGCGTCATTCCTGCCCTGCAGCAAGGATGCCCTGCTCAAGCGTGCT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 CGGAAACTTCACCTCTATGAACAG         GGGGGCCGTCTGAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 117401 CGGAAACTTCACCTCTATGAACAGGTG...CAGGGGGGCCGTCTGAAGGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 GCCTCTCCAGAAGCTCAAGGAAGCCATTGGCAGGGCGATGCCAGAGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117616 GCCTCTCCAGAAGCTCAAGGAAGCCATTGGCAGGGCGATGCCAGAGCAGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 TGGCCAAGTACCAGGACGAATGCCAGGCACACACGCAGGCAAAGGTTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117666 TGGCCAAGTACCAGGACGAATGCCAGGCACACACGCAGGCAAAGGTTGCC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 AA         GATGCTGGAAGAGGAGAAAGACAAGGAGCAGAGGGACCG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117716 AAGTA...TAGGATGCTGGAAGAGGAGAAAGACAAGGAGCAGAGGGACCG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 GATTTGTTCGGATGAGGAAGAAGATGAAGAAAAAGGGGGCAGGAGGATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117966 GATTTGTTCGGATGAGGAAGAAGATGAAGAAAAAGGGGGCAGGAGGATAA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 TGGGACCTCGGAAGAAGTTCCAATGGAATGATGAGATCAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 118016 TGGGACCTCGGAAGAAGTTCCAATGGAATGATGAGATCAGGTG...CAGG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 GAGCTACTGTGCCAGGTGGTGAAGATCAAACTGGAGAGCCAGGACCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118239 GAGCTACTGTGCCAGGTGGTGAAGATCAAACTGGAGAGCCAGGACCTGGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1611 GAGGAACAACAAAGCCCAGGCTTGGGAGGACTGTGTGAAGGGCTTTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118289 GAGGAACAACAAAGCCCAGGCTTGGGAGGACTGTGTGAAGGGCTTTCTGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 ATGCGGAAGTCAAGCCCCTCTGGCCCAAAGGCTGGATGCAGGCCAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 118339 ATGCGGAAGTCAAGCCCCTCTGGCCCAAAGGCTGGATGCAGGCCAGGTG.

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1707      AACTCTGTTTAAGGAGAGCAGACGAGGCCATGGGCACCTGACTTC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118389 ..CAGAACTCTGTTTAAGGAGAGCAGACGAGGCCATGGGCACCTGACTTC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1752 AATCCT         GGCCAAGAAGAAAGTTATGGCCCCTTCTAAAATCA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120012 AATCCTGTG...CAGGGCCAAGAAGAAAGTTATGGCCCCTTCTAAAATCA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1793 AGGTGAAG         GAATCGTCTACGAAGCCTGATAAAAAGGTTTCT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 120149 AGGTGAAGGTG...TAGGAATCGTCTACGAAGCCTGATAAAAAGGTTTCT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 GTCCCATCAGGACAGATTGGTGGCCCCATTGCTTTGCCCTCAGATCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121327 GTCCCATCAGGACAGATTGGTGGCCCCATTGCTTTGCCCTCAGATCACCA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1884 AACAGGAGGCCTGAGTATTGGGGCCTCGAGCAGGGAGCTCCCATCCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121377 AACAGGAGGCCTGAGTATTGGGGCCTCGAGCAGGGAGCTCCCATCCCAGG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1934 CATCGGGCGGCCTTGCTAACCCTCCTCCTGTCAACCTGGAGGACTCATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121427 CATCGGGCGGCCTTGCTAACCCTCCTCCTGTCAACCTGGAGGACTCATTG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1984 GATGAAGACTTGATCCGCAATCCAGCCTCCTCGGTGGAAGCCGTGTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121477 GATGAAGACTTGATCCGCAATCCAGCCTCCTCGGTGGAAGCCGTGTCCAA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2034 GGAATTGGCTGCATTGAATAGCAGAGCAGCTGGGAACTCTGAATTCACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121527 GGAATTGGCTGCATTGAATAGCAGAGCAGCTGGGAACTCTGAATTCACAC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2084 TGCCTGCACCCTCAAAAGCACCTGCAGAAAAAGTTGGAGGCGTTTTATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121577 TGCCTGCACCCTCAAAAGCACCTGCAGAAAAAGTTGGAGGCGTTTTATGT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2134 ACAGAAGAAAAAAGGAACTTTGCGAAGCCTAGTCCTTCTGCTCCACCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121627 ACAGAAGAAAAAAGGAACTTTGCGAAGCCTAGTCCTTCTGCTCCACCACC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2184 AGCTAGCTCTCTGCAGTCACCCCTCAATTTTCTGGCAGAACAGGCTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121677 AGCTAGCTCTCTGCAGTCACCCCTCAATTTTCTGGCAGAACAGGCTCTGG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2234 CACTGGGGCAGTCCTCTCAGGAGAAAAAACCAGAGAGTTCTGGCTACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121727 CACTGGGGCAGTCCTCTCAGGAGAAAAAACCAGAGAGTTCTGGCTACAAA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2284 GAGCTGTCCTGCCAGGCTCCCCTCAATAAGGGCCTGCCAGAAGTACATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121777 GAGCTGTCCTGCCAGGCTCCCCTCAATAAGGGCCTGCCAGAAGTACATCA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2334 GTCCAAAGCTAAGCACCACAGCTTGCCACGGACGTCTCACGGGCCCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121827 GTCCAAAGCTAAGCACCACAGCTTGCCACGGACGTCTCACGGGCCCCAAG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2384 TGGCAGTTCCTGTGCCTGGCCCCCAGGTCAAAGTCTTTCATGCCGGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121877 TGGCAGTTCCTGTGCCTGGCCCCCAGGTCAAAGTCTTTCATGCCGGCACT

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2434 CAGCAGCAGAAAAACTTCACGCCCCCATCTCCATTTGCCAATAAGCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121927 CAGCAGCAGAAAAACTTCACGCCCCCATCTCCATTTGCCAATAAGCTCCA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2484 GGGCCCAAAGGCTTCTCCCACACAGTGTCATCGTTCCCTCCTGCAGTTAG
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121977 AGGCCCAAAGGCTTCTCCCACACAGTGTCATCGTTCCCTCCTGCAGTTAG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2534 TGAAGACAGCGGCCAAAGGCCAGGGCTTCCATCCCTCTGCACCAGCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122027 TGAAGACAGCGGCCAAAGGCCAGGGCTTCCATCCCTCTGCACCAGCCACC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2584 TCAGGAGGCCTGTCAGCCTCCAGCAGCAGCTCTCACAAGACCCCAGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122077 TCAGGAGGCCTGTCAGCCTCCAGCAGCAGCTCTCACAAGACCCCAGCCTC

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2634 GTCCTCTTCTGCCCTGAGCCATCCAGCAAAGCCACATTCAGTCAGCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122127 GTCCTCTTCTGCCCTGAGCCATCCAGCAAAGCCACATTCAGTCAGCTCTG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2684 CAGGCTCATCTTACAAGAATAATCCCTTTGCCAGCTCAATCTCCAAACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122177 CAGGCTCATCTTACAAGAATAATCCCTTTGCCAGCTCAATCTCCAAACAT

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2734 GGGGTTTCTTCTGGCAGCTCTTCCTCGGGAGGAACACCAGTCCAGAGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122227 GGGGTTTCTTCTGGCAGCTCTTCCTCGGGAGGAACACCAGTCCAGAGTTC

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2784 TGTTTCTGGGAGCCTGGTCCCTGGCATACAGCCTCCCTCCGTGGGACAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122277 TGTTTCTGGGAGCCTGGTCCCTGGCATACAGCCTCCCTCCGTGGGACAGG

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2834 CCACCAGCCGACCCGTCCCAAGTTCAGCAGGGAAAAAAATGCCTGTTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122327 CCACCAGCCGACCCGTCCCAAGTTCAGCAGGGAAAAAAATGCCTGTTTCC

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2884 CAGAAGTTGACTCTGGTAGCCCCTCCAGGCGGTCCAAACGGAGATTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122377 CAGAAGTTGACTCTGGTAGCCCCTCCAGGCGGTCCAAACGGAGATTCCAG

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2934 TGGTGGGACCCAGGGAGTGGCAAAGTTGCTGACCTCGCCGTCCCTAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122427 TGGTGGGACCCAGGGAGTGGCAAAGTTGCTGACCTCGCCGTCCCTAAAGC

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2984 CCTCTGCAGTTAGTAGTGTGACATCGTCTACCTCCTTGTCA         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 122477 CCTCTGCAGTTAGTAGTGTGACATCGTCTACCTCCTTGTCAGTG...TAG

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3025 AAAGGAGCGAGTGGGACTGTGCTGCTGGCCGGCTCCTCTTTGATGGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123954 AAAGGAGCGAGTGGGACTGTGCTGCTGGCCGGCTCCTCTTTGATGGCTTC

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3075 ACCCTACAAATCCAGCAGCCCAAAGCTGTCTGGGGCCATGAGCTCGAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124004 ACCCTACAAATCCAGCAGCCCAAAGCTGTCTGGGGCCATGAGCTCGAACT

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3125 CCTTGGGAATTATAACCCCTGTCCCTATTCCTGTCCATGTGCTCTCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124054 CCTTGGGAATTATAACCCCTGTCCCTATTCCTGTCCATGTGCTCTCCTTC

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3175 AGCGCTGACTCCTCTGCCAAAGCAGGGGTCTCCAAGGATGCCATCGTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124104 AGCGCTGACTCCTCTGCCAAAGCAGGGGTCTCCAAGGATGCCATCGTCAC

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3225 AGGCCCTGCCCCCGGGTCCTTCCACCATGGCCTTGGCCACA         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 124154 AGGCCCTGCCCCCGGGTCCTTCCACCATGGCCTTGGCCACAGTA...CAG

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3266 GTCTTCTGGCTGGCTTGCACTCCAGCCCGCCCCATGCAGCGCCTCTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124468 GTCTTCTGGCTGGCTTGCACTCCAGCCCGCCCCATGCAGCGCCTCTCCCA

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3316 CACGCTGCGGTGCCCACCCATATCCCGCAGAGTCTGCCAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 124518 CACGCTGCGGTGCCCACCCATATCCCGCAGAGTCTGCCAGGTA...CAGG

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   3357 TGCTTCTCAGCTTCACGGGAAAGGGCCTGCTGTACCACGGAAATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127167 TGCTTCTCAGCTTCACGGGAAAGGGCCTGCTGTACCACGGAAATTG