seq1 = pF1KB9497.tfa, 3525 bp
seq2 = pF1KB9497/gi568815597r_16886224.tfa (gi568815597r:16886224_17105781), 219558 bp

>pF1KB9497 3525
>gi568815597r:16886224_17105781 (Chr1)

(complement)

1-105  (99994-100098)   96% ->
106-288  (100226-100408)   100% ->
289-347  (100710-100768)   100% ->
348-462  (100961-101075)   100% ->
463-542  (101371-101450)   100% ->
543-620  (103409-103486)   100% ->
621-690  (103679-103748)   100% ->
691-825  (105248-105382)   100% ->
826-892  (105470-105536)   100% ->
893-1024  (105640-105771)   100% ->
1025-1180  (108607-108762)   100% ->
1181-1291  (109286-109396)   100% ->
1292-1338  (109482-109528)   100% ->
1339-1527  (109618-109806)   100% ->
1528-1734  (111947-112153)   100% ->
1735-1830  (113201-113296)   100% ->
1831-1990  (113380-113539)   100% ->
1991-2111  (113653-113773)   100% ->
2112-2236  (113924-114048)   99% ->
2237-2397  (115495-115655)   100% ->
2398-2514  (115779-115895)   100% ->
2515-2594  (116012-116091)   100% ->
2595-2747  (117308-117460)   100% ->
2748-2844  (117548-117644)   100% ->
2845-3068  (118513-118736)   100% ->
3069-3220  (118826-118977)   100% ->
3221-3390  (119150-119319)   100% ->
3391-3525  (119424-119558)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGCGCAGACAGCAGCCCTCTCGTGGGCAGCACGCCCACCGGTTATGG
         ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99994 CTGTCCACAGACAGCAGCCCTCTCGTGGGCAGCACGCCCACCGGTTATGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GACCCTGACGATAGGGACATCAATAGATCCCCTCAGCTCCTCAGTTTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100044 GACCCTGACGATAGGGACATCAATAGATCCCCTCAGCTCCTCAGTTTCAT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCGTG         AGGCTCAGCGGCTACTGTGGCAGTCCATGGAGGGTC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100094 CCGTGGTA...CAGAGGCTCAGCGGCTACTGTGGCAGTCCATGGAGGGTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATCGGCTATCACGTCGTGGTCTGGATGATGGCTGGGATCCCTTTGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100262 ATCGGCTATCACGTCGTGGTCTGGATGATGGCTGGGATCCCTTTGCTGCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTTCCGTTGGAAGCCCCTGTGGGGGGTGCGGCTGCGGCTCCGGCCCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100312 CTTCCGTTGGAAGCCCCTGTGGGGGGTGCGGCTGCGGCTCCGGCCCTGCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ACCTGGCCCACGCCGAAACACTCGTTATCGAAATAAGAGACAAAGAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 100362 ACCTGGCCCACGCCGAAACACTCGTTATCGAAATAAGAGACAAAGAGGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    289       GATAGTTCCTGGCAGCTCTTCACTGTCCAGGTGCAGACTGAGGC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100412 ...CAGGATAGTTCCTGGCAGCTCTTCACTGTCCAGGTGCAGACTGAGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CATCGGCGAGGGCAG         CCTGGAGCCGTCCCCACAGTCCCAGG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 100754 CATCGGCGAGGGCAGGTG...CAGCCTGGAGCCGTCCCCACAGTCCCAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CAGAGGATGGCCGGAGCCAGGCGGCAGTTGGGGCGGTACCAGAGGGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100987 CAGAGGATGGCCGGAGCCAGGCGGCAGTTGGGGCGGTACCAGAGGGTGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TGGAAGGATACGGCCCAGCTCCACAAGAGCGAGGAGGCG         AA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 101037 TGGAAGGATACGGCCCAGCTCCACAAGAGCGAGGAGGCGGTG...CAGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GCGGGTGCTGCGGTATTACCTCTTCCAGGGCCAGCGCTATATCTGGATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101373 GCGGGTGCTGCGGTATTACCTCTTCCAGGGCCAGCGCTATATCTGGATCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AGACCCAGCAAGCCTTCTACCAGGTCAG         CCTCCTGGACCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 101423 AGACCCAGCAAGCCTTCTACCAGGTCAGGTA...CAGCCTCCTGGACCAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GGCCGCTCTTGTGACGACGTCCACCGCTCCCGCCATGGCCTCAGCCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103422 GGCCGCTCTTGTGACGACGTCCACCGCTCCCGCCATGGCCTCAGCCTCCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GGACCAAATGGTGAG         GAAGGCCATTTACGGCCCCAACGTGA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 103472 GGACCAAATGGTGAGGTC...CAGGAAGGCCATTTACGGCCCCAACGTGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 TCAGCATACCGGTCAAGTCCTACCCCCAGCTGCTGGTGGACGAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 103705 TCAGCATACCGGTCAAGTCCTACCCCCAGCTGCTGGTGGACGAGGTA...

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    691    GCACTGAACCCCTACTATGGGTTCCAGGCCTTCAGCATCGCGCTGTG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105245 CAGGCACTGAACCCCTACTATGGGTTCCAGGCCTTCAGCATCGCGCTGTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 GCTGGCTGACCACTACTACTGGTACGCCCTGTGCATCTTCCTCATTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105295 GCTGGCTGACCACTACTACTGGTACGCCCTGTGCATCTTCCTCATTTCCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 CCATCTCCATCTGCCTGTCGCTGTACAAGACCAGAAAG         CAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 105345 CCATCTCCATCTGCCTGTCGCTGTACAAGACCAGAAAGGTG...CAGCAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 AGCCAGACTCTAAGGGACATGGTCAAGTTGTCCATGCGGGTGTGCGTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105473 AGCCAGACTCTAAGGGACATGGTCAAGTTGTCCATGCGGGTGTGCGTGTG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 CCGGCCAGGGGGAG         AGGAAGAGTGGGTGGACTCCAGTGAGC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 105523 CCGGCCAGGGGGAGGTG...CAGAGGAAGAGTGGGTGGACTCCAGTGAGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 TAGTGCCCGGAGACTGCCTGGTGCTGCCCCAGGAGGGTGGGCTGATGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105667 TAGTGCCCGGAGACTGCCTGGTGCTGCCCCAGGAGGGTGGGCTGATGCCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 TGTGATGCCGCCCTGGTGGCCGGCGAGTGCATGGTGAATGAGAGCTCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105717 TGTGATGCCGCCCTGGTGGCCGGCGAGTGCATGGTGAATGAGAGCTCTCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 GACAG         GAGAGAGCATTCCAGTGCTGAAGACGGCACTGCCGG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105767 GACAGGTG...CAGGAGAGAGCATTCCAGTGCTGAAGACGGCACTGCCGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1061 AGGGGCTGGGGCCCTACTGTGCAGAGACACACCGGCGGCACACACTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108643 AGGGGCTGGGGCCCTACTGTGCAGAGACACACCGGCGGCACACACTCTTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 TGCGGGACCCTCATCTTGCAGGCCCGGGCCTATGTGGGACCGCACGTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108693 TGCGGGACCCTCATCTTGCAGGCCCGGGCCTATGTGGGACCGCACGTCCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 GGCAGTGGTGACCCGCACAG         GGTTCTGCACGGCAAAAGGGG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 108743 GGCAGTGGTGACCCGCACAGGTA...CAGGGTTCTGCACGGCAAAAGGGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1202 GCCTGGTGAGCTCCATCTTGCACCCCCGGCCCATCAACTTCAAGTTCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109307 GCCTGGTGAGCTCCATCTTGCACCCCCGGCCCATCAACTTCAAGTTCTAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252 AAACACAGCATGAAGTTTGTGGCTGCCCTCTCTGTCCTGG         C
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 109357 AAACACAGCATGAAGTTTGTGGCTGCCCTCTCTGTCCTGGGTG...CAGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1293 TCTCCTCGGCACCATCTACAGCATCTTCATCCTCTACCGAAACCGG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 109483 TCTCCTCGGCACCATCTACAGCATCTTCATCCTCTACCGAAACCGGGTA.

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1339      GTGCCTCTGAATGAGATTGTAATCCGGGCTCTCGACCTGGTGACC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109533 ..CAGGTGCCTCTGAATGAGATTGTAATCCGGGCTCTCGACCTGGTGACC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1384 GTGGTGGTGCCACCTGCCCTGCCTGCTGCCATGACTGTGTGCACGCTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109663 GTGGTGGTGCCACCTGCCCTGCCTGCTGCCATGACTGTGTGCACGCTCTA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1434 CGCCCAGAGCCGACTGCGGAGACAGGGCATTTTCTGCATCCACCCACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109713 CGCCCAGAGCCGACTGCGGAGACAGGGCATTTTCTGCATCCACCCACTGC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1484 GCATCAACCTGGGGGGCAAGCTGCAGCTGGTGTGTTTCGACAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 109763 GCATCAACCTGGGGGGCAAGCTGCAGCTGGTGTGTTTCGACAAGGTG...

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1528    ACGGGCACCCTCACTGAGGACGGCTTAGACGTGATGGGGGTGGTGCC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111944 CAGACGGGCACCCTCACTGAGGACGGCTTAGACGTGATGGGGGTGGTGCC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1575 CCTGAAGGGGCAGGCATTCCTGCCCCTGGTCCCAGAGCCTCGCCGCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111994 CCTGAAGGGGCAGGCATTCCTGCCCCTGGTCCCAGAGCCTCGCCGCCTGC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1625 CTGTGGGGCCCCTGCTCCGAGCACTGGCCACCTGCCATGCCCTCAGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112044 CTGTGGGGCCCCTGCTCCGAGCACTGGCCACCTGCCATGCCCTCAGCCGG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1675 CTCCAGGACACCCCCGTGGGCGACCCCATGGACTTGAAGATGGTGGAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112094 CTCCAGGACACCCCCGTGGGCGACCCCATGGACTTGAAGATGGTGGAGTC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1725 TACTGGCTGG         GTCCTGGAGGAAGAGCCGGCTGCAGACTCAG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 112144 TACTGGCTGGGTG...CAGGTCCTGGAGGAAGAGCCGGCTGCAGACTCAG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1766 CATTTGGGACCCAGGTCTTGGCAGTGATGAGACCCCCACTTTGGGAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113232 CATTTGGGACCCAGGTCTTGGCAGTGATGAGACCCCCACTTTGGGAGCCC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1816 CAGCTGCAGGCAATG         GAGGAGCCCCCGGTGCCAGTCAGCGT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 113282 CAGCTGCAGGCAATGGTG...CAGGAGGAGCCCCCGGTGCCAGTCAGCGT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1857 CCTCCACCGCTTCCCCTTCTCTTCGGCTCTGCAGCGCATGAGTGTGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113406 CCTCCACCGCTTCCCCTTCTCTTCGGCTCTGCAGCGCATGAGTGTGGTGG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1907 TGGCGTGGCCAGGGGCCACTCAGCCCGAGGCCTACGTCAAAGGCTCCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113456 TGGCGTGGCCAGGGGCCACTCAGCCCGAGGCCTACGTCAAAGGCTCCCCG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1957 GAGCTGGTGGCAGGGCTCTGCAACCCCGAGACAG         TGCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 113506 GAGCTGGTGGCAGGGCTCTGCAACCCCGAGACAGGTG...CAGTGCCCAC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1998 CGACTTCGCCCAGATGCTGCAGAGCTATACAGCTGCTGGCTACCGTGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113660 CGACTTCGCCCAGATGCTGCAGAGCTATACAGCTGCTGGCTACCGTGTCG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2048 TGGCCCTGGCCAGCAAGCCACTGCCCACTGTGCCCAGCCTGGAGGCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113710 TGGCCCTGGCCAGCAAGCCACTGCCCACTGTGCCCAGCCTGGAGGCAGCC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2098 CAGCAACTGACGAG         GGACACTGTGGAAGGAGATCTGAGCCT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||| ||||||||
 113760 CAGCAACTGACGAGGTG...CAGGGACACTGTGGAAGGAGACCTGAGCCT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2139 CCTGGGGCTGCTGGTCATGAGGAACCTACTGAAGCCGCAGACAACGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113951 CCTGGGGCTGCTGGTCATGAGGAACCTACTGAAGCCGCAGACAACGCCAG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2189 TTATCCAGGCTCTGCGAAGGACCCGCATCCGCGCCGTCATGGTGACAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 114001 TTATCCAGGCTCTGCGAAGGACCCGCATCCGCGCCGTCATGGTGACAGGT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2237        GGGACAACCTGCAGACAGCGGTGACTGTGGCCCGGGGCTGTGG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114051 A...CAGGGGACAACCTGCAGACAGCGGTGACTGTGGCCCGGGGCTGTGG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2280 CATGGTGGCCCCCCAGGAGCATCTGATCATCGTCCACGCCACCCACCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115538 CATGGTGGCCCCCCAGGAGCATCTGATCATCGTCCACGCCACCCACCCTG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2330 AGCGGGGTCAGCCTGCCTCTCTCGAGTTCCTGCCGATGGAGTCCCCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115588 AGCGGGGTCAGCCTGCCTCTCTCGAGTTCCTGCCGATGGAGTCCCCCACA

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2380 GCCGTGAATGGCGTTAAG         GATCCTGACCAGGCTGCAAGCTA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 115638 GCCGTGAATGGCGTTAAGGTG...CAGGATCCTGACCAGGCTGCAAGCTA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2421 CACCGTGGAGCCAGACCCCCGATCCAGGCACCTGGCCCTCAGCGGGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115802 CACCGTGGAGCCAGACCCCCGATCCAGGCACCTGGCCCTCAGCGGGCCCA

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2471 CCTTTGGTATCATTGTGAAGCACTTCCCCAAGCTGCTGCCCAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 115852 CCTTTGGTATCATTGTGAAGCACTTCCCCAAGCTGCTGCCCAAGGTA...

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2515    GTCCTGGTCCAGGGCACTGTCTTTGCCCGCATGGCCCCTGAGCAGAA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116009 CAGGTCCTGGTCCAGGGCACTGTCTTTGCCCGCATGGCCCCTGAGCAGAA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2562 GACAGAGCTGGTGTGCGAGCTACAGAAGCTTCA         GTACTGCG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 116059 GACAGAGCTGGTGTGCGAGCTACAGAAGCTTCAGTG...CAGGTACTGCG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2603 TGGGCATGTGCGGAGACGGCGCCAATGACTGTGGGGCCCTGAAGGCGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117316 TGGGCATGTGCGGAGACGGCGCCAATGACTGTGGGGCCCTGAAGGCGGCT

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2653 GATGTCGGCATCTCGCTGTCCCAGGCAGAAGCCTCAGTGGTCTCACCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117366 GATGTCGGCATCTCGCTGTCCCAGGCAGAAGCCTCAGTGGTCTCACCCTT

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2703 CACCTCGAGCATGGCCAGTATTGAGTGCGTGCCCATGGTCATCAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 117416 CACCTCGAGCATGGCCAGTATTGAGTGCGTGCCCATGGTCATCAGGTA..

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2748     GGAGGGGCGCTGTTCCCTTGACACTTCGTTCAGCGTCTTCAAGTAC
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117466 .CAGGGAGGGGCGCTGTTCCCTTGACACTTCGTTCAGCGTCTTCAAGTAC

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2794 ATGGCTCTGTACAGCCTGACCCAGTTCATCTCCGTCCTGATCCTCTACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117594 ATGGCTCTGTACAGCCTGACCCAGTTCATCTCCGTCCTGATCCTCTACAC

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2844 G         ATCAACACCAACCTGGGTGACCTGCAGTTCCTGGCCATCG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117644 GGTG...CAGATCAACACCAACCTGGGTGACCTGCAGTTCCTGGCCATCG

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2885 ACCTGGTCATCACCACCACAGTGGCAGTGCTCATGAGCCGCACGGGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118553 ACCTGGTCATCACCACCACAGTGGCAGTGCTCATGAGCCGCACGGGGCCA

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2935 GCGCTGGTCCTGGGACGGGTGCGGCCACCGGGGGCGCTGCTCAGCGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118603 GCGCTGGTCCTGGGACGGGTGCGGCCACCGGGGGCGCTGCTCAGCGTGCC

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2985 CGTGCTCAGCAGCCTGCTGCTGCAGATGGTCCTGGTGACCGGCGTGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118653 CGTGCTCAGCAGCCTGCTGCTGCAGATGGTCCTGGTGACCGGCGTGCAGC

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3035 TAGGGGGCTACTTCCTGACCCTGGCCCAGCCATG         GTTCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 118703 TAGGGGGCTACTTCCTGACCCTGGCCCAGCCATGGTG...CAGGTTCGTG

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3076 CCTCTGAACAGGACAGTGGCCGCACCAGACAACCTGCCCAACTACGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118833 CCTCTGAACAGGACAGTGGCCGCACCAGACAACCTGCCCAACTACGAGAA

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3126 CACCGTGGTCTTCTCTCTGTCCAGCTTCCAGTACCTCATCCTGGCTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118883 CACCGTGGTCTTCTCTCTGTCCAGCTTCCAGTACCTCATCCTGGCTGCAG

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3176 CCGTGTCCAAGGGGGCGCCCTTCCGCCGGCCGCTCTACACCAATG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 118933 CCGTGTCCAAGGGGGCGCCCTTCCGCCGGCCGCTCTACACCAATGGTG..

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3221     TGCCCTTCCTGGTGGCCCTGGCGCTCCTGAGCTCCGTCCTGGTGGG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118983 .CAGTGCCCTTCCTGGTGGCCCTGGCGCTCCTGAGCTCCGTCCTGGTGGG

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3267 CCTTGTCCTGGTCCCCGGCCTCCTGCAGGGGCCGCTGGCGCTGAGGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119196 CCTTGTCCTGGTCCCCGGCCTCCTGCAGGGGCCGCTGGCGCTGAGGAACA

   3550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3317 TCACTGACACCGGCTTCAAGCTGCTGCTGCTGGGTCTGGTCACCCTCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119246 TCACTGACACCGGCTTCAAGCTGCTGCTGCTGGGTCTGGTCACCCTCAAC

   3600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3367 TTCGTGGGGGCCTTCATGCTGGAG         AGCGTGCTAGACCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 119296 TTCGTGGGGGCCTTCATGCTGGAGGTG...CAGAGCGTGCTAGACCAGTG

   3650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3408 CCTCCCCGCCTGCCTGCGCCGCCTCCGGCCCAAGCGGGCCTCCAAGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119441 CCTCCCCGCCTGCCTGCGCCGCCTCCGGCCCAAGCGGGCCTCCAAGAAGC

   3700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3458 GCTTCAAGCAGCTGGAACGAGAGCTGGCCGAGCAGCCCTGGCCGCCGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119491 GCTTCAAGCAGCTGGAACGAGAGCTGGCCGAGCAGCCCTGGCCGCCGCTG

   3750     .    :    .
   3508 CCCGCCGGCCCCCTGAGG
        ||||||||||||||||||
 119541 CCCGCCGGCCCCCTGAGG