Result of SIM4 for
pF1KB9491
seq1 = pF1KB9491.tfa, 3420 bp
seq2 = pF1KB9491/gi568815592r_118860106.tfa (gi568815592r:118860106_119178299), 318194 bp
>pF1KB9491 3420
>gi568815592r:118860106_119178299 (Chr6)
(complement)
1-159 (100001-100159) 100% ->
160-1014 (153487-154341) 100% ->
1015-1150 (155220-155355) 100% ->
1151-1332 (158141-158322) 100% ->
1333-1530 (161356-161553) 100% ->
1531-1653 (166869-166991) 100% ->
1654-1815 (171692-171853) 100% ->
1816-1937 (174678-174799) 100% ->
1938-2088 (175251-175401) 100% ->
2089-2301 (197950-198162) 100% ->
2302-2455 (198782-198935) 100% ->
2456-2583 (202256-202383) 100% ->
2584-2768 (203092-203276) 100% ->
2769-2915 (203726-203872) 100% ->
2916-3033 (211348-211465) 100% ->
3034-3138 (213529-213633) 100% ->
3139-3341 (216337-216539) 100% ->
3342-3420 (218116-218194) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGGCGACCCCGGGCATGAGCTGGCAGCAGCACTATTACGGCGGCTCGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGGCGACCCCGGGCATGAGCTGGCAGCAGCACTATTACGGCGGCTCGGC
50 . : . : . : . : . :
51 GGCCAAATTCGCGCCCTCGCCGGCCACCGCACAGCTGGCTGGGCACAGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 GGCCAAATTCGCGCCCTCGCCGGCCACCGCACAGCTGGCTGGGCACAGCA
100 . : . : . : . : . :
101 TGGACTACAGCCAGGAGATGCACCTGAAAATGAGCAAGAAAATCGCCCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100101 TGGACTACAGCCAGGAGATGCACCTGAAAATGAGCAAGAAAATCGCCCAG
150 . : . : . : . : . :
151 CTCACCAAG GTAATATATGCTTTAAACACTAAAAATGATGA
|||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
100151 CTCACCAAGGTA...CAGGTAATATATGCTTTAAACACTAAAAATGATGA
200 . : . : . : . : . :
192 GCATGAATCTGCAATTCAAGCCCTCAAAGATGCTCATGAAGAAGAAATTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
153519 GCATGAATCTGCAATTCAAGCCCTCAAAGATGCTCATGAAGAAGAAATTC
250 . : . : . : . : . :
242 AACAAATTCTTGCTGAAACAAGAGAAAAAATATTGCAGTATAAAAGCAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
153569 AACAAATTCTTGCTGAAACAAGAGAAAAAATATTGCAGTATAAAAGCAAA
300 . : . : . : . : . :
292 GTAACAGAGGAGCTAGACCTTAGAAGAAAGATTCAAGTTTTAGAATCATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
153619 GTAACAGAGGAGCTAGACCTTAGAAGAAAGATTCAAGTTTTAGAATCATC
350 . : . : . : . : . :
342 ATTAGAAGATCACATAAAAATGAAGCAGCAGGCTTTGACAGAATTTGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
153669 ATTAGAAGATCACATAAAAATGAAGCAGCAGGCTTTGACAGAATTTGAAG
400 . : . : . : . : . :
392 CTTATAAGCACAGAGTTGAGGACATGCAACTTTGTGCAGAAGCCCAGCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
153719 CTTATAAGCACAGAGTTGAGGACATGCAACTTTGTGCAGAAGCCCAGCAT
450 . : . : . : . : . :
442 GTCCAACGCATAGTGACCATGTCTAGAGAAGTCGAAGAGATTAGAAGGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
153769 GTCCAACGCATAGTGACCATGTCTAGAGAAGTCGAAGAGATTAGAAGGAA
500 . : . : . : . : . :
492 ATTTGAAGAAAAATTACGGAGCTTTGGACAACTTCAAGTACAGTTTGAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
153819 ATTTGAAGAAAAATTACGGAGCTTTGGACAACTTCAAGTACAGTTTGAAA
550 . : . : . : . : . :
542 AAGACAAACGATTGGCATTGGAAGACTTGCAAGCTGCTCACAGACGGGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
153869 AAGACAAACGATTGGCATTGGAAGACTTGCAAGCTGCTCACAGACGGGAG
600 . : . : . : . : . :
592 ATACAAGAGCTATTGAAGTCACAGCAGGATCACAGTGCCTCAGTAAATAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
153919 ATACAAGAGCTATTGAAGTCACAGCAGGATCACAGTGCCTCAGTAAATAA
650 . : . : . : . : . :
642 AGGCCAGGAAAAGGCAGAGGAACTACACAGAATGGAGGTGGAGTCCCTAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
153969 AGGCCAGGAAAAGGCAGAGGAACTACACAGAATGGAGGTGGAGTCCCTAA
700 . : . : . : . : . :
692 ACAAAATGCTTGAGGAGCTAAGACTTGAACGGAAGAAACTAATTGAGGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
154019 ACAAAATGCTTGAGGAGCTAAGACTTGAACGGAAGAAACTAATTGAGGAT
750 . : . : . : . : . :
742 TATGAAGGCAAGTTGAATAAAGCTCAGTCCTTTTATGAACGTGAGCTTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
154069 TATGAAGGCAAGTTGAATAAAGCTCAGTCCTTTTATGAACGTGAGCTTGA
800 . : . : . : . : . :
792 TACTTTGAAAAGGTCACAGCTTTTTACAGCAGAAAGCCTACAGGCCAGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
154119 TACTTTGAAAAGGTCACAGCTTTTTACAGCAGAAAGCCTACAGGCCAGCA
850 . : . : . : . : . :
842 AAGAAAAGGAAGCTGATCTTAGAAAAGAATTTCAGGGACAAGAAGCAATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
154169 AAGAAAAGGAAGCTGATCTTAGAAAAGAATTTCAGGGACAAGAAGCAATT
900 . : . : . : . : . :
892 TTACGAAAAACTATAGGAAAATTAAAGACAGAGTTACAGATGGTACAGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
154219 TTACGAAAAACTATAGGAAAATTAAAGACAGAGTTACAGATGGTACAGGA
950 . : . : . : . : . :
942 TGAAGCTGGAAGTCTTCTTGACAAATGCCAAAAGCTTCAGACGGCACTTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
154269 TGAAGCTGGAAGTCTTCTTGACAAATGCCAAAAGCTTCAGACGGCACTTG
1000 . : . : . : . : . :
992 CCATAGCAGAGAACAATGTTCAG GTTCTTCAAAAACAGCTT
|||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
154319 CCATAGCAGAGAACAATGTTCAGGTA...TAGGTTCTTCAAAAACAGCTT
1050 . : . : . : . : . :
1033 GATGATGCCAAGGAGGGAGAAATGGCCCTATTAAGCAAGCACAAAGAAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
155238 GATGATGCCAAGGAGGGAGAAATGGCCCTATTAAGCAAGCACAAAGAAGT
1100 . : . : . : . : . :
1083 GGAAAGTGAGCTAGCAGCTGCCAGAGAACGTTTACAACAGCAAGCTTCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
155288 GGAAAGTGAGCTAGCAGCTGCCAGAGAACGTTTACAACAGCAAGCTTCAG
1150 . : . : . : . : . :
1133 ATCTTGTCCTCAAAGCTA GTCATATTGGAATGCTTCAAGCA
||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
155338 ATCTTGTCCTCAAAGCTAGTA...TAGGTCATATTGGAATGCTTCAAGCA
1200 . : . : . : . : . :
1174 ACTCAAATGACCCAGGAAGTTACAATTAAAGATTTAGAATCAGAAAAATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
158164 ACTCAAATGACCCAGGAAGTTACAATTAAAGATTTAGAATCAGAAAAATC
1250 . : . : . : . : . :
1224 GAGAGTCAATGAGAGATTATCTCAACTTGAAGAGGAAAGAGCTTTTTTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
158214 GAGAGTCAATGAGAGATTATCTCAACTTGAAGAGGAAAGAGCTTTTTTGC
1300 . : . : . : . : . :
1274 GAAGCAAAACCCAAAGTCTGGATGAAGAGCAGAAGCAACAGATTCTAGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
158264 GAAGCAAAACCCAAAGTCTGGATGAAGAGCAGAAGCAACAGATTCTAGAA
1350 . : . : . : . : . :
1324 CTGGAGAAG AAAGTAAATGAAGCAAAGAGAACTCAGCAAGA
|||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
158314 CTGGAGAAGGTA...TAGAAAGTAAATGAAGCAAAGAGAACTCAGCAAGA
1400 . : . : . : . : . :
1365 ATATTATGAAAGGGAACTTAAAAACCTGCAAAGTAGATTGGAAGAGGAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
161388 ATATTATGAAAGGGAACTTAAAAACCTGCAAAGTAGATTGGAAGAGGAGG
1450 . : . : . : . : . :
1415 TGACTCAATTAAACGAGGCCCATTCTAAGACTTTGGAAGAATTAGCTTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
161438 TGACTCAATTAAACGAGGCCCATTCTAAGACTTTGGAAGAATTAGCTTGG
1500 . : . : . : . : . :
1465 AAGCACCATATGGCAATTGAAGCTGTCCACAGTAATGCAATTAGGGATAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
161488 AAGCACCATATGGCAATTGAAGCTGTCCACAGTAATGCAATTAGGGATAA
1550 . : . : . : . : . :
1515 GAAAAAACTGCAAATG GATTTGGAAGAACAACATAACAAAG
||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
161538 GAAAAAACTGCAAATGGTG...AAGGATTTGGAAGAACAACATAACAAAG
1600 . : . : . : . : . :
1556 ATAAACTAAACCTGGAAGAGGATAAAAATCAGCTTCAACAAGAGCTAGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
166894 ATAAACTAAACCTGGAAGAGGATAAAAATCAGCTTCAACAAGAGCTAGAA
1650 . : . : . : . : . :
1606 AACCTAAAGGAAGTACTGGAAGACAAGTTGAATACAGCCAATCAAGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
166944 AACCTAAAGGAAGTACTGGAAGACAAGTTGAATACAGCCAATCAAGAGGC
1700 . : . : . : . : . :
1654 ATTGGCCACCTCCAAGATATGGTAAGGAAAAGTGAACAAGGTC
>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
166994 A...CAGATTGGCCACCTCCAAGATATGGTAAGGAAAAGTGAACAAGGTC
1750 . : . : . : . : . :
1697 TTGGCTCTGCAGAAGGACTTATTGCTAGTCTTCAGGACTCCCAGGAAAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
171735 TTGGCTCTGCAGAAGGACTTATTGCTAGTCTTCAGGACTCCCAGGAAAGG
1800 . : . : . : . : . :
1747 CTTCAGAATGAGCTTGACTTGACTAAAGACAGCCTAAAGGAGACCAAGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
171785 CTTCAGAATGAGCTTGACTTGACTAAAGACAGCCTAAAGGAGACCAAGGA
1850 . : . : . : . : . :
1797 TGCTCTATTAAATGTGGAG GGTGAGCTAGAACAAGAAAGGC
|||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
171835 TGCTCTATTAAATGTGGAGGTA...CAGGGTGAGCTAGAACAAGAAAGGC
1900 . : . : . : . : . :
1838 AACAGCATGAAGAAACAATTGCTGCCATGAAAGAAGAAGAGAAGCTCAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
174700 AACAGCATGAAGAAACAATTGCTGCCATGAAAGAAGAAGAGAAGCTCAAA
1950 . : . : . : . : . :
1888 GTGGACAAAATGGCCCATGACTTAGAAATTAAGTGGACTGAAAATCTTAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
174750 GTGGACAAAATGGCCCATGACTTAGAAATTAAGTGGACTGAAAATCTTAG
2000 . : . : . : . : . :
1938 ACAAGAGTGTTCTAAACTTCGTGAAGAGTTAAGGCTTCAAC
>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
174800 GTA...TAGACAAGAGTGTTCTAAACTTCGTGAAGAGTTAAGGCTTCAAC
2050 . : . : . : . : . :
1979 ATGAAGAGGATAAGAAGTCAGCAATGTCTCAACTTTTGCAGTTGAAAGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
175292 ATGAAGAGGATAAGAAGTCAGCAATGTCTCAACTTTTGCAGTTGAAAGAT
2100 . : . : . : . : . :
2029 CGAGAGAAAAATGCAGCAAGAGATTCATGGCAGAAGAAAGTAGAAGATCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
175342 CGAGAGAAAAATGCAGCAAGAGATTCATGGCAGAAGAAAGTAGAAGATCT
2150 . : . : . : . : . :
2079 CTTAAACCAG ATTTCCTTGCTGAAACAGAATCTGGAGATAC
||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
175392 CTTAAACCAGGTA...TAGATTTCCTTGCTGAAACAGAATCTGGAGATAC
2200 . : . : . : . : . :
2120 AGCTTTCCCAGTCTCAGACTTCTTTGCAACAACTGCAAGCCCAGTTTACG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
197981 AGCTTTCCCAGTCTCAGACTTCTTTGCAACAACTGCAAGCCCAGTTTACG
2250 . : . : . : . : . :
2170 CAAGAACGACAGCGGCTTACGCAAGAGCTTGAAGAATTAGAGGAGCAACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
198031 CAAGAACGACAGCGGCTTACGCAAGAGCTTGAAGAATTAGAGGAGCAACA
2300 . : . : . : . : . :
2220 TCAGCAAAGACACAAATCATTAAAAGAAGCACATGTCCTTGCATTTCAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
198081 TCAGCAAAGACACAAATCATTAAAAGAAGCACATGTCCTTGCATTTCAAA
2350 . : . : . : . : . :
2270 CTATGGAAGAGGAAAAGGAAAAGGAGCAAAGA GCTCTTGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
198131 CTATGGAAGAGGAAAAGGAAAAGGAGCAAAGAGTA...TAGGCTCTTGAA
2400 . : . : . : . : . :
2311 AATCATTTACAACAGAAGCATTCTGCAGAGCTTCAATCACTAAAAGATGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
198791 AATCATTTACAACAGAAGCATTCTGCAGAGCTTCAATCACTAAAAGATGC
2450 . : . : . : . : . :
2361 ACACAGAGAGTCAATGGAGGGCTTCCGGATAGAAATGGAACAGGAACTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
198841 ACACAGAGAGTCAATGGAGGGCTTCCGGATAGAAATGGAACAGGAACTTC
2500 . : . : . : . : . :
2411 AGACTCTTCGGTTTGAATTAGAAGATGAAGGAAAGGCTATGCTTG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
198891 AGACTCTTCGGTTTGAATTAGAAGATGAAGGAAAGGCTATGCTTGGTA..
2550 . : . : . : . : . :
2456 CTTCCTTGCGCTCAGAACTCAACCATCAACATGCAGCTGCAATTGA
.>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
198941 .CAGCTTCCTTGCGCTCAGAACTCAACCATCAACATGCAGCTGCAATTGA
2600 . : . : . : . : . :
2502 TTTGTTACGGCATAATCATCATCAAGAATTGGCAGCTGCTAAAATGGAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
202302 TTTGTTACGGCATAATCATCATCAAGAATTGGCAGCTGCTAAAATGGAAT
2650 . : . : . : . : . :
2552 TAGAGAGAAGCATAGACATCAGCAGAAGACAG AGTAAGGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
202352 TAGAGAGAAGCATAGACATCAGCAGAAGACAGGTA...CAGAGTAAGGAG
2700 . : . : . : . : . :
2593 CACATATGTAGAATTACAGATCTACAAGAGGAATTAAGACACAGAGAGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
203101 CACATATGTAGAATTACAGATCTACAAGAGGAATTAAGACACAGAGAGCA
2750 . : . : . : . : . :
2643 TCACATCTCTGAATTGGATAAGGAGGTTCAGCACCTTCATGAGAATATAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
203151 TCACATCTCTGAATTGGATAAGGAGGTTCAGCACCTTCATGAGAATATAA
2800 . : . : . : . : . :
2693 GTGCCCTAACCAAAGAACTGGAATTTAAGGGGAAAGAAATTCTCAGAATA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
203201 GTGCCCTAACCAAAGAACTGGAATTTAAGGGGAAAGAAATTCTCAGAATA
2850 . : . : . : . : . :
2743 CGAAGTGAATCTAACCAACAGATAAG GTTGCATGAACAAGA
||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
203251 CGAAGTGAATCTAACCAACAGATAAGGTA...CAGGTTGCATGAACAAGA
2900 . : . : . : . : . :
2784 TTTAAACAAGAGACTTGAAAAAGAGTTGGATGTCATGACAGCAGACCACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
203741 TTTAAACAAGAGACTTGAAAAAGAGTTGGATGTCATGACAGCAGACCACC
2950 . : . : . : . : . :
2834 TCAGAGAGAAAAATATCATGCGGGCAGATTTTAATAAGACTAACGAGCTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
203791 TCAGAGAGAAAAATATCATGCGGGCAGATTTTAATAAGACTAACGAGCTA
3000 . : . : . : . : . :
2884 CTCAAGGAAATAAATGCCGCTTTACAAGTGTC ATTAGAAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
203841 CTCAAGGAAATAAATGCCGCTTTACAAGTGTCGTA...CAGATTAGAAGA
3050 . : . : . : . : . :
2925 AATGGAAGAAAAATATCTAATGAGAGAATCAAAACCAGAAGATATACAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
211357 AATGGAAGAAAAATATCTAATGAGAGAATCAAAACCAGAAGATATACAGA
3100 . : . : . : . : . :
2975 TGATTACAGAATTAAAAGCCATGCTTACAGAAAGAGACCAGATCATAAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
211407 TGATTACAGAATTAAAAGCCATGCTTACAGAAAGAGACCAGATCATAAAG
3150 . : . : . : . : . :
3025 AAACTAATT GAGGATAATAAGTTTTATCAGCTGGAATTAGT
|||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
211457 AAACTAATTGTA...TAGGAGGATAATAAGTTTTATCAGCTGGAATTAGT
3200 . : . : . : . : . :
3066 CAATCGAGAAACTAACTTCAACAAAGTGTTTAACTCAAGTCCTACTGTTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
213561 CAATCGAGAAACTAACTTCAACAAAGTGTTTAACTCAAGTCCTACTGTTG
3250 . : . : . : . : . :
3116 GTGTTATTAATCCATTGGCTAAG CAAAAGAAGAAGAATGAT
|||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
213611 GTGTTATTAATCCATTGGCTAAGGTA...CAGCAAAAGAAGAAGAATGAT
3300 . : . : . : . : . :
3157 AAATCACCAACAAACAGGTTTGTGAGTGTTCCCAATCTAAGTGCTCTGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
216355 AAATCACCAACAAACAGGTTTGTGAGTGTTCCCAATCTAAGTGCTCTGGA
3350 . : . : . : . : . :
3207 ATCTGGTGGAGTGGGCAATGGACATCCTAACCGCCTGGATCCCATTCCTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
216405 ATCTGGTGGAGTGGGCAATGGACATCCTAACCGCCTGGATCCCATTCCTA
3400 . : . : . : . : . :
3257 ATTCTCCAGTCCACGATATTGAGTTCAACAGCAGCAAACCACTTCCACAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
216455 ATTCTCCAGTCCACGATATTGAGTTCAACAGCAGCAAACCACTTCCACAG
3450 . : . : . : . : . :
3307 CCAGTGCCACCTAAAGGGCCCAAGACATTTTTGAG TCCTGC
|||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
216505 CCAGTGCCACCTAAAGGGCCCAAGACATTTTTGAGGTG...CAGTCCTGC
3500 . : . : . : . : . :
3348 TCAGAGTGAAGCTTCTCCAGTGGCTTCTCCAGATCCCCAGCGCCAGGAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
218122 TCAGAGTGAAGCTTCTCCAGTGGCTTCTCCAGATCCCCAGCGCCAGGAGT
3550 . : . :
3398 GGTTTGCCCGGTACTTCACATTC
|||||||||||||||||||||||
218172 GGTTTGCCCGGTACTTCACATTC