seq1 = pF1KB9482.tfa, 1551 bp
seq2 = pF1KB9482/gi568815579r_6280284.tfa (gi568815579r:6280284_6492903), 212620 bp

>pF1KB9482 1551
>gi568815579r:6280284_6492903 (Chr19)

(complement)

13-59  (100001-100047)   100% ->
60-132  (100930-101002)   100% ->
133-326  (103267-103460)   100% ->
327-497  (105345-105515)   100% ->
498-682  (109409-109593)   100% ->
683-836  (111054-111207)   100% ->
837-898  (111289-111350)   100% ->
899-1018  (111426-111545)   100% ->
1019-1092  (111709-111782)   100% ->
1093-1231  (111862-112000)   100% ->
1232-1349  (112214-112331)   100% ->
1350-1551  (112419-112620)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     13 GGCCCTAGCAGCCAGAATGTCACTGAATACGTCGTTCGAGTTCCTAA   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 100001 GGCCCTAGCAGCCAGAATGTCACTGAATACGTCGTTCGAGTTCCTAAGTA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     60       GAATACAACCAAAAAATATAACATCATGGCTTTTAATGCAGCCG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ...CAGGAATACAACCAAAAAATATAACATCATGGCTTTTAATGCAGCCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    104 ACAAAGTCAACTTTGCTACGTGGAATCAG         GCTCGGCTGGAG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100974 ACAAAGTCAACTTTGCTACGTGGAATCAGGTA...TAGGCTCGGCTGGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    145 CGGGACTTGAGCAACAAGAAAATCTACCAAGAGGAGGAGATGCCCGAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103279 CGGGACTTGAGCAACAAGAAAATCTACCAAGAGGAGGAGATGCCCGAATC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    195 GGGCGCGGGCAGTGAGTTCAACCGCAAGCTTCGGGAGGAGGCTCGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103329 GGGCGCGGGCAGTGAGTTCAACCGCAAGCTTCGGGAGGAGGCTCGGAGGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    245 AGAAGTACGGCATCGTCCTCAAGGAGTTCCGGCCCGAGGACCAGCCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103379 AGAAGTACGGCATCGTCCTCAAGGAGTTCCGGCCCGAGGACCAGCCCTGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    295 CTGCTCCGGGTCAACGGCAAATCAGGCAGGAA         GTTCAAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 103429 CTGCTCCGGGTCAACGGCAAATCAGGCAGGAAGTA...CAGGTTCAAGGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    336 CATCAAGAAGGGAGGCGTAACAGAGAACACGTCCTACTACATCTTCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105354 CATCAAGAAGGGAGGCGTAACAGAGAACACGTCCTACTACATCTTCACCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    386 AGTGCCCCGACGGGGCCTTCGAGGCCTTCCCCGTGCACAACTGGTACAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105404 AGTGCCCCGACGGGGCCTTCGAGGCCTTCCCCGTGCACAACTGGTACAAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    436 TTCACACCGCTGGCCCGGCATCGCACGCTCACTGCCGAGGAGGCCGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105454 TTCACACCGCTGGCCCGGCATCGCACGCTCACTGCCGAGGAGGCCGAGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    486 GGAGTGGGAGAG         GAGGAACAAGGTGCTGAACCACTTCAGCA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 105504 GGAGTGGGAGAGGTG...CAGGAGGAACAAGGTGCTGAACCACTTCAGCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    527 TCATGCAGCAGCGGCGGCTCAAGGATCAGGACCAGGACGAGGATGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109438 TCATGCAGCAGCGGCGGCTCAAGGATCAGGACCAGGACGAGGATGAGGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    577 GAGAAGGAGAAACGTGGCCGCAGGAAGGCGAGCGAGCTGCGCATCCACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109488 GAGAAGGAGAAACGTGGCCGCAGGAAGGCGAGCGAGCTGCGCATCCACGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    627 CCTGGAGGACGACCTGGAGATGTCGTCCGATGCCAGTGATGCCAGTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109538 CCTGGAGGACGACCTGGAGATGTCGTCCGATGCCAGTGATGCCAGTGGTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    677 AGGAGG         GGGGCAGAGTCCCCAAGGCCAAGAAGAAGGCGCCG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109588 AGGAGGGTG...CAGGGGGCAGAGTCCCCAAGGCCAAGAAGAAGGCGCCG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    718 CTGGCCAAGGGCGGCAGGAAAAAGAAGAAGAAGAAGGGTTCAGACGACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111089 CTGGCCAAGGGCGGCAGGAAAAAGAAGAAGAAGAAGGGTTCAGACGACGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    768 GGCCTTCGAGGACAGCGATGATGGGGACTTCGAGGGCCAAGAGGTGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111139 GGCCTTCGAGGACAGCGATGATGGGGACTTCGAGGGCCAAGAGGTGGACT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    818 ACATGTCAGACGGCTCCAG         TAGCTCCCAAGAAGAGCCTGAG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 111189 ACATGTCAGACGGCTCCAGGTG...CAGTAGCTCCCAAGAAGAGCCTGAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    859 AGCAAGGCCAAGGCGCCGCAGCAGGAGGAGGGGCCCAAGG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 111311 AGCAAGGCCAAGGCGCCGCAGCAGGAGGAGGGGCCCAAGGGTA...CAGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    900 TGTCGATGAGCAGAGCGACAGTAGTGAGGAGAGTGAGGAGGAGAAGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111427 TGTCGATGAGCAGAGCGACAGTAGTGAGGAGAGTGAGGAGGAGAAGCCGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    950 CTGAGGAGGACAAGGAGGAGGAGGAGGAGAAGAAGGCACCCACCCCGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111477 CTGAGGAGGACAAGGAGGAGGAGGAGGAGAAGAAGGCACCCACCCCGCAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1000 GAGAAGAAGCGCAGGAAAG         ACAGCAGCGAGGAGTCGGACAG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 111527 GAGAAGAAGCGCAGGAAAGGTG...CAGACAGCAGCGAGGAGTCGGACAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1041 CTCAGAGGAGAGCGACATTGACAGCGAGGCCTCCTCAGCCCTCTTCATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111731 CTCAGAGGAGAGCGACATTGACAGCGAGGCCTCCTCAGCCCTCTTCATGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1091 CG         AAGAAGAAGACGCCACCCAAGAGAGAGCGGAAGCCGTCG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111781 CGGTA...CAGAAGAAGAAGACGCCACCCAAGAGAGAGCGGAAGCCGTCG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1132 GGAGGGAGCTCAAGGGGCAACAGCCGCCCAGGCACGCCCAGCGCAGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111901 GGAGGGAGCTCAAGGGGCAACAGCCGCCCAGGCACGCCCAGCGCAGAGGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1182 TGGCAGCACCTCCTCCACCCTGCGGGCGGCTGCCAGCAAACTCGAGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111951 TGGCAGCACCTCCTCCACCCTGCGGGCGGCTGCCAGCAAACTCGAGCAAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1232          GGAAGCGGGTGAGCGAGATGCCTGCAGCCAAGCGGTTGCGG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112001 GTG...CAGGGAAGCGGGTGAGCGAGATGCCTGCAGCCAAGCGGTTGCGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1273 CTGGACACGGGACCCCAGAGCCTGTCTGGGAAGTCGACACCCCAGCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112255 CTGGACACGGGACCCCAGAGCCTGTCTGGGAAGTCGACACCCCAGCCACC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1323 ATCAGGCAAGACAACACCCAACAGCGG         CGACGTGCAGGTGA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 112305 ATCAGGCAAGACAACACCCAACAGCGGGTA...CAGCGACGTGCAGGTGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1364 CTGAGGATGCCGTGCGCCGCTACCTGACACGGAAGCCCATGACCACTAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112433 CTGAGGATGCCGTGCGCCGCTACCTGACACGGAAGCCCATGACCACTAAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1414 GACCTGCTGAAAAAGTTCCAGACCAAGAAGACAGGGCTGAGCAGCGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112483 GACCTGCTGAAAAAGTTCCAGACCAAGAAGACAGGGCTGAGCAGCGAGCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1464 GACAGTGAACGTGTTGGCCCAGATCCTCAAGCGACTCAACCCCGAGCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112533 GACAGTGAACGTGTTGGCCCAGATCCTCAAGCGACTCAACCCCGAGCGCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .
   1514 AGATGATCAACGACAAAATGCACTTCTCCCTCAAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112583 AGATGATCAACGACAAAATGCACTTCTCCCTCAAGGAG