seq1 = pF1KB9477.tfa, 999 bp
seq2 = pF1KB9477/gi568815579r_14378419.tfa (gi568815579r:14378419_14582976), 204558 bp

>pF1KB9477 999
>gi568815579r:14378419_14582976 (Chr19)

(complement)

1-288  (100001-100288)   100% ->
289-474  (102199-102384)   100% ->
475-655  (102492-102672)   100% ->
656-768  (103453-103565)   100% ->
769-850  (104212-104293)   100% ->
851-999  (104410-104558)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCGCTGGGACTGGGGCGGCGGAAAAAGGCGCCCCCTCTAGTGGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCGCTGGGACTGGGGCGGCGGAAAAAGGCGCCCCCTCTAGTGGAAAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGAGGAGGCTGAGCCAGGCCGTGGAGGGCTGGGCGTGGGGGAGCCAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGAGGAGGCTGAGCCAGGCCGTGGAGGGCTGGGCGTGGGGGAGCCAGGGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTCTGGGCGGAGGTGGGTCGGGGGGCCCCCAAATGGGCTTGCCCCCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTCTGGGCGGAGGTGGGTCGGGGGGCCCCCAAATGGGCTTGCCCCCCCCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCCCCAGCCCTGCGGCCCCGCCTCGTGTTCCACACCCAGCTGGCCCATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCCCCAGCCCTGCGGCCCCGCCTCGTGTTCCACACCCAGCTGGCCCATGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAGTCCCACTGGCCGCATCGAGGGCTTCACCAACGTCAAGGAGCTGTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAGTCCCACTGGCCGCATCGAGGGCTTCACCAACGTCAAGGAGCTGTATG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCAAGATCGCCGAGGCCTTCCGCCTGCCAACTGCCGAG         GTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 100251 GCAAGATCGCCGAGGCCTTCCGCCTGCCAACTGCCGAGGTA...CAGGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 ATGTTCTGCACCCTGAACACCCACAAAGTGGACATGGACAAGCTCCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102202 ATGTTCTGCACCCTGAACACCCACAAAGTGGACATGGACAAGCTCCTGGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GGGCCAGATCGGGCTGGAGGACTTCATCTTCGCCCACGTGAAGGGGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102252 GGGCCAGATCGGGCTGGAGGACTTCATCTTCGCCCACGTGAAGGGGCAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GCAAGGAGGTGGAGGTGTTCAAGTCGGAGGATGCACTCGGGCTCACCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102302 GCAAGGAGGTGGAGGTGTTCAAGTCGGAGGATGCACTCGGGCTCACCATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 ACGGACAACGGGGCTGGCTACGCCTTCATCAAG         CGCATCAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 102352 ACGGACAACGGGGCTGGCTACGCCTTCATCAAGGTG...CAGCGCATCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GGAGGGCAGCGTGATCGACCACATCCACCTCATCAGCGTGGGCGACATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102500 GGAGGGCAGCGTGATCGACCACATCCACCTCATCAGCGTGGGCGACATGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TCGAGGCCATTAACGGGCAGAGCCTGCTGGGCTGCCGGCACTACGAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102550 TCGAGGCCATTAACGGGCAGAGCCTGCTGGGCTGCCGGCACTACGAGGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GCCCGGCTGCTCAAGGAGCTGCCCCGAGGCCGTACCTTCACGCTGAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102600 GCCCGGCTGCTCAAGGAGCTGCCCCGAGGCCGTACCTTCACGCTGAAGCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 CACGGAGCCTCGCAAGGCCTTCG         ACATGATCAGCCAGCGTT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 102650 CACGGAGCCTCGCAAGGCCTTCGGTG...CAGACATGATCAGCCAGCGTT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 CAGCGGGTGGCCGCCCTGGCTCTGGCCCACAACTGGGCACTGGCCGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103471 CAGCGGGTGGCCGCCCTGGCTCTGGCCCACAACTGGGCACTGGCCGAGGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 ACCCTGCGGCTCCGATCCCGGGGCCCCGCCACGGTGGAGGATCTG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 103521 ACCCTGCGGCTCCGATCCCGGGGCCCCGCCACGGTGGAGGATCTGGTG..

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    769     CCCTCTGCCTTTGAAGAGAAGGCCATTGAGAAGGTGGATGACCTGC
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103571 .CAGCCCTCTGCCTTTGAAGAGAAGGCCATTGAGAAGGTGGATGACCTGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 TGGAGAGTTACATGGGTATCAGGGACACGGAGCTGG         CGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 104258 TGGAGAGTTACATGGGTATCAGGGACACGGAGCTGGGTG...TAGCGGCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 ACCATGGTGGAGCTGGGAAAGGACAAAAGGAACCCGGATGAGCTGGCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104415 ACCATGGTGGAGCTGGGAAAGGACAAAAGGAACCCGGATGAGCTGGCCGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 GGCCCTGGACGAACGGCTGGGTGACTTTGCCTTCCCTGACGAGTTCGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104465 GGCCCTGGACGAACGGCTGGGTGACTTTGCCTTCCCTGACGAGTTCGTCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :
    956 TTGACGTCTGGGGCGCCATTGGGGACGCCAAGGTCGGCCGCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104515 TTGACGTCTGGGGCGCCATTGGGGACGCCAAGGTCGGCCGCTAC