seq1 = pF1KB9466.tfa, 2331 bp
seq2 = pF1KB9466/gi568815593r_143181892.tfa (gi568815593r:143181892_143500839), 318948 bp

>pF1KB9466 2331
>gi568815593r:143181892_143500839 (Chr5)

(complement)

1-1184  (100001-101184)   100% ->
1185-1351  (186672-186838)   100% ->
1352-1468  (190627-190743)   100% ->
1469-1747  (200077-200355)   100% ->
1748-1892  (202028-202172)   100% ->
1893-2023  (205250-205380)   100% ->
2024-2181  (218115-218272)   100% ->
2182-2331  (218799-218948)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACTCCAAAGAATCATTAACTCCTGGTAGAGAAGAAAACCCCAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGACTCCAAAGAATCATTAACTCCTGGTAGAGAAGAAAACCCCAGCAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGTGCTTGCTCAGGAGAGGGGAGATGTGATGGACTTCTATAAAACCCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGTGCTTGCTCAGGAGAGGGGAGATGTGATGGACTTCTATAAAACCCTAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GAGGAGGAGCTACTGTGAAGGTTTCTGCGTCTTCACCCTCACTGGCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GAGGAGGAGCTACTGTGAAGGTTTCTGCGTCTTCACCCTCACTGGCTGTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCTTCTCAATCAGACTCCAAGCAGCGAAGACTTTTGGTTGATTTTCCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCTTCTCAATCAGACTCCAAGCAGCGAAGACTTTTGGTTGATTTTCCAAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AGGCTCAGTAAGCAATGCGCAGCAGCCAGATCTGTCCAAAGCAGTTTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AGGCTCAGTAAGCAATGCGCAGCAGCCAGATCTGTCCAAAGCAGTTTCAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCTCAATGGGACTGTATATGGGAGAGACAGAAACAAAAGTGATGGGAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCTCAATGGGACTGTATATGGGAGAGACAGAAACAAAAGTGATGGGAAAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GACCTGGGATTCCCACAGCAGGGCCAAATCAGCCTTTCCTCGGGGGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GACCTGGGATTCCCACAGCAGGGCCAAATCAGCCTTTCCTCGGGGGAAAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AGACTTAAAGCTTTTGGAAGAAAGCATTGCAAACCTCAATAGGTCGACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AGACTTAAAGCTTTTGGAAGAAAGCATTGCAAACCTCAATAGGTCGACCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GTGTTCCAGAGAACCCCAAGAGTTCAGCATCCACTGCTGTGTCTGCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GTGTTCCAGAGAACCCCAAGAGTTCAGCATCCACTGCTGTGTCTGCTGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CCCACAGAGAAGGAGTTTCCAAAAACTCACTCTGATGTATCTTCAGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CCCACAGAGAAGGAGTTTCCAAAAACTCACTCTGATGTATCTTCAGAACA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GCAACATTTGAAGGGCCAGACTGGCACCAACGGTGGCAATGTGAAATTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GCAACATTTGAAGGGCCAGACTGGCACCAACGGTGGCAATGTGAAATTGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ATACCACAGACCAAAGCACCTTTGACATTTTGCAGGATTTGGAGTTTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ATACCACAGACCAAAGCACCTTTGACATTTTGCAGGATTTGGAGTTTTCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TCTGGGTCCCCAGGTAAAGAGACGAATGAGAGTCCTTGGAGATCAGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TCTGGGTCCCCAGGTAAAGAGACGAATGAGAGTCCTTGGAGATCAGACCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GTTGATAGATGAAAACTGTTTGCTTTCTCCTCTGGCGGGAGAAGACGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GTTGATAGATGAAAACTGTTTGCTTTCTCCTCTGGCGGGAGAAGACGATT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CATTCCTTTTGGAAGGAAACTCGAATGAGGACTGCAAGCCTCTCATTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CATTCCTTTTGGAAGGAAACTCGAATGAGGACTGCAAGCCTCTCATTTTA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CCGGACACTAAACCCAAAATTAAGGATAATGGAGATCTGGTTTTGTCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CCGGACACTAAACCCAAAATTAAGGATAATGGAGATCTGGTTTTGTCAAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CCCCAGTAATGTAACACTGCCCCAAGTGAAAACAGAAAAAGAAGATTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CCCCAGTAATGTAACACTGCCCCAAGTGAAAACAGAAAAAGAAGATTTCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TCGAACTCTGCACCCCTGGGGTAATTAAGCAAGAGAAACTGGGCACAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TCGAACTCTGCACCCCTGGGGTAATTAAGCAAGAGAAACTGGGCACAGTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 TACTGTCAGGCAAGCTTTCCTGGAGCAAATATAATTGGTAATAAAATGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TACTGTCAGGCAAGCTTTCCTGGAGCAAATATAATTGGTAATAAAATGTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 TGCCATTTCTGTTCATGGTGTGAGTACCTCTGGAGGACAGATGTACCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 TGCCATTTCTGTTCATGGTGTGAGTACCTCTGGAGGACAGATGTACCACT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 ATGACATGAATACAGCATCCCTTTCTCAACAGCAGGATCAGAAGCCTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 ATGACATGAATACAGCATCCCTTTCTCAACAGCAGGATCAGAAGCCTATT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 TTTAATGTCATTCCACCAATTCCCGTTGGTTCCGAAAATTGGAATAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 TTTAATGTCATTCCACCAATTCCCGTTGGTTCCGAAAATTGGAATAGGTG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 CCAAGGATCTGGAGATGACAACTTGACTTCTCTGGGGACTCTGAACTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 CCAAGGATCTGGAGATGACAACTTGACTTCTCTGGGGACTCTGAACTTCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 CTGGTCGAACAGTTTTTTCTAATGGCTATTCAAG         CCCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 101151 CTGGTCGAACAGTTTTTTCTAATGGCTATTCAAGGTA...TAGCCCCAGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 ATGAGACCAGATGTAAGCTCTCCTCCATCCAGCTCCTCAACAGCAACAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186679 ATGAGACCAGATGTAAGCTCTCCTCCATCCAGCTCCTCAACAGCAACAAC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1242 AGGACCACCTCCCAAACTCTGCCTGGTGTGCTCTGATGAAGCTTCAGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186729 AGGACCACCTCCCAAACTCTGCCTGGTGTGCTCTGATGAAGCTTCAGGAT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1292 GTCATTATGGAGTCTTAACTTGTGGAAGCTGTAAAGTTTTCTTCAAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186779 GTCATTATGGAGTCTTAACTTGTGGAAGCTGTAAAGTTTTCTTCAAAAGA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1342 GCAGTGGAAG         GACAGCACAATTACCTATGTGCTGGAAGGAA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 186829 GCAGTGGAAGGTA...TAGGACAGCACAATTACCTATGTGCTGGAAGGAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1383 TGATTGCATCATCGATAAAATTCGAAGAAAAAACTGCCCAGCATGCCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 190658 TGATTGCATCATCGATAAAATTCGAAGAAAAAACTGCCCAGCATGCCGCT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1433 ATCGAAAATGTCTTCAGGCTGGAATGAACCTGGAAG         CTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 190708 ATCGAAAATGTCTTCAGGCTGGAATGAACCTGGAAGGTA...CAGCTCGA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1474 AAAACAAAGAAAAAAATAAAAGGAATTCAGCAGGCCACTACAGGAGTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 200082 AAAACAAAGAAAAAAATAAAAGGAATTCAGCAGGCCACTACAGGAGTCTC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1524 ACAAGAAACCTCTGAAAATCCTGGTAACAAAACAATAGTTCCTGCAACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 200132 ACAAGAAACCTCTGAAAATCCTGGTAACAAAACAATAGTTCCTGCAACGT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1574 TACCACAACTCACCCCTACCCTGGTGTCACTGTTGGAGGTTATTGAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 200182 TACCACAACTCACCCCTACCCTGGTGTCACTGTTGGAGGTTATTGAACCT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1624 GAAGTGTTATATGCAGGATATGATAGCTCTGTTCCAGACTCAACTTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 200232 GAAGTGTTATATGCAGGATATGATAGCTCTGTTCCAGACTCAACTTGGAG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1674 GATCATGACTACGCTCAACATGTTAGGAGGGCGGCAAGTGATTGCAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 200282 GATCATGACTACGCTCAACATGTTAGGAGGGCGGCAAGTGATTGCAGCAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1724 TGAAATGGGCAAAGGCAATACCAG         GTTTCAGGAACTTACAC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 200332 TGAAATGGGCAAAGGCAATACCAGGTA...CAGGTTTCAGGAACTTACAC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1765 CTGGATGACCAAATGACCCTACTGCAGTACTCCTGGATGTTTCTTATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202045 CTGGATGACCAAATGACCCTACTGCAGTACTCCTGGATGTTTCTTATGGC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1815 ATTTGCTCTGGGGTGGAGATCATATAGACAATCAAGTGCAAACCTGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202095 ATTTGCTCTGGGGTGGAGATCATATAGACAATCAAGTGCAAACCTGCTGT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1865 GTTTTGCTCCTGATCTGATTATTAATGA         GCAGAGAATGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 202145 GTTTTGCTCCTGATCTGATTATTAATGAGTA...CAGGCAGAGAATGACT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1906 CTACCCTGCATGTACGACCAATGTAAACACATGCTGTATGTTTCCTCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 205263 CTACCCTGCATGTACGACCAATGTAAACACATGCTGTATGTTTCCTCTGA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1956 GTTACACAGGCTTCAGGTATCTTATGAAGAGTATCTCTGTATGAAAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 205313 GTTACACAGGCTTCAGGTATCTTATGAAGAGTATCTCTGTATGAAAACCT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2006 TACTGCTTCTCTCTTCAG         TTCCTAAGGACGGTCTGAAGAGC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 205363 TACTGCTTCTCTCTTCAGGTT...TAGTTCCTAAGGACGGTCTGAAGAGC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2047 CAAGAGCTATTTGATGAAATTAGAATGACCTACATCAAAGAGCTAGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 218138 CAAGAGCTATTTGATGAAATTAGAATGACCTACATCAAAGAGCTAGGAAA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2097 AGCCATTGTCAAGAGGGAAGGAAACTCCAGCCAGAACTGGCAGCGGTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 218188 AGCCATTGTCAAGAGGGAAGGAAACTCCAGCCAGAACTGGCAGCGGTTTT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2147 ATCAACTGACAAAACTCTTGGATTCTATGCATGAA         GTGGTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 218238 ATCAACTGACAAAACTCTTGGATTCTATGCATGAAGTA...CAGGTGGTT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2188 GAAAATCTCCTTAACTATTGCTTCCAAACATTTTTGGATAAGACCATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 218805 GAAAATCTCCTTAACTATTGCTTCCAAACATTTTTGGATAAGACCATGAG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2238 TATTGAATTCCCCGAGATGTTAGCTGAAATCATCACCAATCAGATACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 218855 TATTGAATTCCCCGAGATGTTAGCTGAAATCATCACCAATCAGATACCAA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :
   2288 AATATTCAAATGGAAATATCAAAAAACTTCTGTTTCATCAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 218905 AATATTCAAATGGAAATATCAAAAAACTTCTGTTTCATCAAAAG