seq1 = pF1KB9458.tfa, 2511 bp
seq2 = pF1KB9458/gi568815581r_3466818.tfa (gi568815581r:3466818_3692274), 225457 bp

>pF1KB9458 2511
>gi568815581r:3466818_3692274 (Chr17)

(complement)

1-208  (100001-100208)   100% ->
209-598  (100922-101311)   100% ->
599-739  (101883-102023)   100% ->
740-1038  (102170-102468)   99% ->
1039-1218  (103908-104087)   100% ->
1219-1377  (106349-106507)   100% ->
1378-1470  (108845-108937)   100% ->
1471-1541  (111748-111818)   100% ->
1542-1707  (114512-114677)   99% ->
1708-1774  (115083-115149)   100% ->
1775-2097  (118320-118642)   99% ->
2098-2225  (120026-120153)   99% ->
2226-2341  (120636-120751)   100% ->
2342-2511  (125288-125457)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGACCCTAACTCCAGGCCACCTCCAGCCAAGCCCCAGCTCTCCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGACCCTAACTCCAGGCCACCTCCAGCCAAGCCCCAGCTCTCCACG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCCAAGAGCCGCACCCGGCTCTTTGGGAAGGGTGACTCGGAGGAGGCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCCAAGAGCCGCACCCGGCTCTTTGGGAAGGGTGACTCGGAGGAGGCTTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCCGGTGGATTGCCCTCACGAGGAAGGTGAGCTGGACTCCTGCCCGACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCCGGTGGATTGCCCTCACGAGGAAGGTGAGCTGGACTCCTGCCCGACCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCACAGTCAGCCCTGTTATCACCATCCAGAGGCCAGGAGACGGCCCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCACAGTCAGCCCTGTTATCACCATCCAGAGGCCAGGAGACGGCCCCACC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGTGCCAG         GCTGCTGTCCCAGGACTCTGTCGCCGCCAGCAC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGTGCCAGGTA...CAGGCTGCTGTCCCAGGACTCTGTCGCCGCCAGCAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CGAGAAGACCCTCAGGCTCTATGATCGCAGGAGTATCTTTGAAGCCGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100955 CGAGAAGACCCTCAGGCTCTATGATCGCAGGAGTATCTTTGAAGCCGTTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CTCAGAATAACTGCCAGGATCTGGAGAGCCTGCTGCTCTTCCTGCAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101005 CTCAGAATAACTGCCAGGATCTGGAGAGCCTGCTGCTCTTCCTGCAGAAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 AGCAAGAAGCACCTCACAGACAACGAGTTCAAAGGTGGCCCCAGCGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101055 AGCAAGAAGCACCTCACAGACAACGAGTTCAAAGGTGGCCCCAGCGCTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GCTCGGGGAGGGCCCCAGCCCTGGCCTGCCCTGACCCTCCCTTATGTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101105 GCTCGGGGAGGGCCCCAGCCCTGGCCTGCCCTGACCCTCCCTTATGTCTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TCAGACCCTGAGACAGGGAAGACCTGTCTGCTGAAAGCCATGCTCAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101155 TCAGACCCTGAGACAGGGAAGACCTGTCTGCTGAAAGCCATGCTCAACCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GCACGACGGACAGAACACCACCATCCCCCTGCTCCTGGAGATCGCGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101205 GCACGACGGACAGAACACCACCATCCCCCTGCTCCTGGAGATCGCGCGGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 AAACGGACAGCCTGAAGGAGCTTGTCAACGCCAGCTACACGGACAGCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101255 AAACGGACAGCCTGAAGGAGCTTGTCAACGCCAGCTACACGGACAGCTAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 TACAAGG         GCCAGACAGCACTGCACATCGCCATCGAGAGACG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101305 TACAAGGGTG...TAGGCCAGACAGCACTGCACATCGCCATCGAGAGACG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 CAACATGGCCCTGGTGACCCTCCTGGTGGAGAACGGAGCAGACGTCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101917 CAACATGGCCCTGGTGACCCTCCTGGTGGAGAACGGAGCAGACGTCCAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 CTGCGGCCCATGGGGACTTCTTTAAGAAAACCAAAGGGCGGCCTGGATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101967 CTGCGGCCCATGGGGACTTCTTTAAGAAAACCAAAGGGCGGCCTGGATTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 TACTTCG         GTGAACTGCCCCTGTCCCTGGCCGCGTGCACCAA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102017 TACTTCGGTA...CAGGTGAACTGCCCCTGTCCCTGGCCGCGTGCACCAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 CCAGCTGGGCATCGTGAAGTTCCTGCTGCAGAACTCCTGGCAGACGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102204 CCAGCTGGGCATCGTGAAGTTCCTGCTGCAGAACTCCTGGCAGACGGCCG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 ACATCAGCGCCAGGGACTCGGTGGGCAACACGGTGCTGCACGCCCTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102254 ACATCAGCGCCAGGGACTCGGTGGGCAACACGGTGCTGCACGCCCTGGTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 GAGGTGGCCGACAACACGGCCGACAACACGAAGTTTGTGACGAGCATGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102304 GAGGTGGCCGACAACACGGCCGACAACACGAAGTTTGTGACGAGCATGTA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 CAATGAGATTCTGATCCTGGGGGCCAAACTGCACCCGACGCTGAAGCTGG
        ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102354 CAATGAGATTCTGATGCTGGGGGCCAAACTGCACCCGACGCTGAAGCTGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 AGGAGCTCACCAACAAGAAGGGAATGACGCCGCTGGCTCTGGCAGCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102404 AGGAGCTCACCAACAAGAAGGGAATGACGCCGCTGGCTCTGGCAGCTGGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 ACCGGGAAGATCGGG         GTCTTGGCCTATATTCTCCAGCGGGA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 102454 ACCGGGAAGATCGGGGTA...CAGGTCTTGGCCTATATTCTCCAGCGGGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 GATCCAGGAGCCCGAGTGCAGGCACCTGTCCAGGAAGTTCACCGAGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103934 GATCCAGGAGCCCGAGTGCAGGCACCTGTCCAGGAAGTTCACCGAGTGGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 CCTACGGGCCCGTGCACTCCTCGCTGTACGACCTGTCCTGCATCGACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103984 CCTACGGGCCCGTGCACTCCTCGCTGTACGACCTGTCCTGCATCGACACC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1165 TGCGAGAAGAACTCGGTGCTGGAGGTGATCGCCTACAGCAGCAGCGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104034 TGCGAGAAGAACTCGGTGCTGGAGGTGATCGCCTACAGCAGCAGCGAGAC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1215 CCCT         AATCGCCACGACATGCTCTTGGTGGAGCCGCTGAACC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104084 CCCTGTG...TAGAATCGCCACGACATGCTCTTGGTGGAGCCGCTGAACC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1256 GACTCCTGCAGGACAAGTGGGACAGATTCGTCAAGCGCATCTTCTACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106386 GACTCCTGCAGGACAAGTGGGACAGATTCGTCAAGCGCATCTTCTACTTC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1306 AACTTCCTGGTCTACTGCCTGTACATGATCATCTTCACCATGGCTGCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106436 AACTTCCTGGTCTACTGCCTGTACATGATCATCTTCACCATGGCTGCCTA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1356 CTACAGGCCCGTGGATGGCTTG         CCTCCCTTTAAGATGGAAA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 106486 CTACAGGCCCGTGGATGGCTTGGTG...CAGCCTCCCTTTAAGATGGAAA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1397 AAACTGGAGACTATTTCCGAGTTACTGGAGAGATCCTGTCTGTGTTAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108864 AAACTGGAGACTATTTCCGAGTTACTGGAGAGATCCTGTCTGTGTTAGGA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1447 GGAGTCTACTTCTTTTTCCGAGGG         ATTCAGTATTTCCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 108914 GGAGTCTACTTCTTTTTCCGAGGGGTA...CAGATTCAGTATTTCCTGCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1488 GAGGCGGCCGTCGATGAAGACCCTGTTTGTGGACAGCTACAGTGAGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111765 GAGGCGGCCGTCGATGAAGACCCTGTTTGTGGACAGCTACAGTGAGATGC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1538 TTTT         CTTTCTGCAGTCACTGTTCATGCTGGCCACCGTGGTG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111815 TTTTGTA...CAGCTTTCTGCAGTCACTGTTCATGCTGGCCACCGTGGTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1579 CTGTACTTCAGCCACCTCAAGGAGTATGTGGCTTCCATGGTATTCTCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114549 CTGTACTTCAGCCACCTCAAGGAGTATGTGGCTTCCATGGTATTCTCCCT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1629 GGCCTTGGGCTGGACCAACATGCTCTACTACACCCGCGGTTTCCAGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114599 GGCCTTGGGCTGGACCAACATGCTCTACTACACCCGCGGTTTCCAGCAGA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1679 TGGGCATCTACGCCGTCATGATAGAGAAG         ATGATCCTGAGA
        |||||||||| ||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 114649 TGGGCATCTATGCCGTCATGATAGAGAAGGTG...CAGATGATCCTGAGA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1720 GACCTGTGCCGTTTCATGTTTGTCTACATCGTCTTCTTGTTCGGGTTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115095 GACCTGTGCCGTTTCATGTTTGTCTACATCGTCTTCTTGTTCGGGTTTTC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1770 CACAG         CGGTGGTGACGCTGATTGAAGACGGGAAGAATGACT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115145 CACAGGTA...TAGCGGTGGTGACGCTGATTGAAGACGGGAAGAATGACT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1811 CCCTGCCGTCTGAGTCCACGTCGCACAGGTGGCGGGGGCCTGCCTGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118356 CCCTGCCGTCTGAGTCCACGTCGCACAGGTGGCGGGGGCCTGCCTGCAGG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1861 CCCCCCGATAGCTCCTACAACAGCCTGTACTCCACCTGCCTGGAGCTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118406 CCCCCCGATAGCTCCTACAACAGCCTGTACTCCACCTGCCTGGAGCTGTT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1911 CAAGTTCACCATCGGCATGGGCGACCTGGAGTTCACTGAGAACTATGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118456 CAAGTTCACCATCGGCATGGGCGACCTGGAGTTCACTGAGAACTATGACT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1961 TCAAGGCTGTCTTCATCATCCTGCTGCTGGCCTATGTAATTCTCACCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118506 TCAAGGCTGTCTTCATCATCCTGCTGCTGGCCTATGTAATTCTCACCTAC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2011 ATCCTCCTGCTCAACATGCTCATTGCCCTCATGGGTGAGACTGTCAACAA
        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
 118556 ATCCTCCTGCTCAACATGCTCATCGCCCTCATGGGTGAGACTGTCAACAA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2061 GATCGCACAGGAGAGCAAGAACATCTGGAAGCTGCAG         AGAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 118606 GATCGCACAGGAGAGCAAGAACATCTGGAAGCTGCAGGTG...CAGAGAG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2102 CCATCACCATCCTGGACACGGAGAAGAGCTTCCTTAAGTGCATGAGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
 120030 CCATCACCATCCTGGACACGGAGAAGAGCTTCCTTAAGTGCATGAGGAAG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2152 GCCTTCCGCTCAGGCAAGCTGCTGCAGGTGGGGTACACACCTGATGGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120080 GCCTTCCGCTCAGGCAAGCTGCTGCAGGTGGGGTACACACCTGATGGCAA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2202 GGACGACTACCGGTGGTGCTTCAG         GGTGGACGAGGTGAACT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 120130 GGACGACTACCGGTGGTGCTTCAGGTA...CAGGGTGGACGAGGTGAACT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2243 GGACCACCTGGAACACCAACGTGGGCATCATCAACGAAGACCCGGGCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120653 GGACCACCTGGAACACCAACGTGGGCATCATCAACGAAGACCCGGGCAAC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2293 TGTGAGGGCGTCAAGCGCACCCTGAGCTTCTCCCTGCGGTCAAGCAGAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 120703 TGTGAGGGCGTCAAGCGCACCCTGAGCTTCTCCCTGCGGTCAAGCAGAGG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2342         TTTCAGGCAGACACTGGAAGAACTTTGCCCTGGTCCCCCTTT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120753 TG...CAGTTTCAGGCAGACACTGGAAGAACTTTGCCCTGGTCCCCCTTT

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2384 TAAGAGAGGCAAGTGCTCGAGATAGGCAGTCTGCTCAGCCCGAGGAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125330 TAAGAGAGGCAAGTGCTCGAGATAGGCAGTCTGCTCAGCCCGAGGAAGTT

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2434 TATCTGCGACAGTTTTCAGGGTCTCTGAAGCCAGAGGACGCTGAGGTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125380 TATCTGCGACAGTTTTCAGGGTCTCTGAAGCCAGAGGACGCTGAGGTCTT

   2600     .    :    .    :    .
   2484 CAAGAGTCCTGCCGCTTCCGGGGAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||
 125430 CAAGAGTCCTGCCGCTTCCGGGGAGAAG