seq1 = pF1KB9445.tfa, 2016 bp
seq2 = pF1KB9445/gi568815575f_120153416.tfa (gi568815575f:120153416_120355431), 202016 bp

>pF1KB9445 2016
>gi568815575f:120153416_120355431 (ChrX)

1-2016  (100001-102016)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGAGTAGAAAACTGATTTCTGCTACAGACATTCAGTACTCTGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGAGTAGAAAACTGATTTCTGCTACAGACATTCAGTACTCTGGCAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCTGCTGAACTCCTTGAATGAGCAACGTGGCCATGGACTCTTCTGTGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCTGCTGAACTCCTTGAATGAGCAACGTGGCCATGGACTCTTCTGTGATG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTACCGTTATTGTGGAAGACCGAAAATTCCGGGCTCACAAGAATATTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TTACCGTTATTGTGGAAGACCGAAAATTCCGGGCTCACAAGAATATTCTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCAGCTTCTAGTACCTACTTCCATCAGCTCTTCTCTGTTGCTGGGCAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCAGCTTCTAGTACCTACTTCCATCAGCTCTTCTCTGTTGCTGGGCAAGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGTTGAACTGAGCTTTATAAGAGCAGAGATCTTTGCAGAAATTCTCAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGTTGAACTGAGCTTTATAAGAGCAGAGATCTTTGCAGAAATTCTCAATT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ATATCTATAGTTCTAAAATTGTTCGTGTTAGATCAGATTTGCTTGATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ATATCTATAGTTCTAAAATTGTTCGTGTTAGATCAGATTTGCTTGATGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTAATTAAATCAGGGCAGTTATTAGGAGTGAAATTTATAGCAGAGCTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTAATTAAATCAGGGCAGTTATTAGGAGTGAAATTTATAGCAGAGCTTGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGTCCCATTGTCACAGGTTAAAAGCATCTCAGGTACAGCGCAGGATGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TGTCCCATTGTCACAGGTTAAAAGCATCTCAGGTACAGCGCAGGATGGTA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ATACTGAGCCTTTACCTCCTGATTCTGGTGACAAGAACCTTGTAATACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ATACTGAGCCTTTACCTCCTGATTCTGGTGACAAGAACCTTGTAATACAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AAATCAAAAGATGAAGCCCAAGATAATGGGGCTACTATAATGCCTATTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AAATCAAAAGATGAAGCCCAAGATAATGGGGCTACTATAATGCCTATTAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 AACAGAGTCTTTTTCATTATCTGCCGAAGATTATGAAATGAAAAAGATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 AACAGAGTCTTTTTCATTATCTGCCGAAGATTATGAAATGAAAAAGATCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TTGTTACCGATTCTGATGATGATGATGATGATGTCATTTTTTGCTCCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TTGTTACCGATTCTGATGATGATGATGATGATGTCATTTTTTGCTCCGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ATTCTGCCCACAAAGGAGACTTTGCCGAGTAATAACACAGTGGCACAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ATTCTGCCCACAAAGGAGACTTTGCCGAGTAATAACACAGTGGCACAGGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CCAATCTAACCCAGGCCCTGTTGCTATTTCAGATGTTGCACCTAGTGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CCAATCTAACCCAGGCCCTGTTGCTATTTCAGATGTTGCACCTAGTGCTA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GCAATAACTCGCCCCCTTTAACAAATATCACACCTACTCAGAAACTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GCAATAACTCGCCCCCTTTAACAAATATCACACCTACTCAGAAACTTCCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 ACTCCTGTGAATCAGGCAACTTTGAGCCAAACACAAGGAAGTGAAAAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 ACTCCTGTGAATCAGGCAACTTTGAGCCAAACACAAGGAAGTGAAAAATT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GTTGGTATCTTCAGCTCCAACACATCTGACTCCCAATATTATTTTGTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GTTGGTATCTTCAGCTCCAACACATCTGACTCCCAATATTATTTTGTTAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 ATCAGACACCACTTTCTACACCACCAAATGTCAGTTCTTCACTTCCAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 ATCAGACACCACTTTCTACACCACCAAATGTCAGTTCTTCACTTCCAAAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CATATGCCCTCTTCAATCAATTTACTTGTGCAGAATCAGCAGACACCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CATATGCCCTCTTCAATCAATTTACTTGTGCAGAATCAGCAGACACCAAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CAGTGCTATTTTAACAGGAAACAAGGCCAATGAAGAGGAGGAGGAGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CAGTGCTATTTTAACAGGAAACAAGGCCAATGAAGAGGAGGAGGAGGAAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 TAATAGATGATGATGATGACACTATTAGCTCCAGTCCTGACTCGGCCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TAATAGATGATGATGATGACACTATTAGCTCCAGTCCTGACTCGGCCGTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 AGTAATACATCTTTGGTCCCACAGGCTGATACCTCCCAAAATACCAGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 AGTAATACATCTTTGGTCCCACAGGCTGATACCTCCCAAAATACCAGTTT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 TGATGGATCATTAATACAGAAGATGCAGATTCCTACACTTCTTCAAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 TGATGGATCATTAATACAGAAGATGCAGATTCCTACACTTCTTCAAGAAC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 CACTTTCCAATTCCTTAAAAATTTCAGATATAATTACTAGAAATACTAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 CACTTTCCAATTCCTTAAAAATTTCAGATATAATTACTAGAAATACTAAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 GATCCAGGCGTAGGATCAAAACATCTAATGGAGGGTCAGAAGATCATTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 GATCCAGGCGTAGGATCAAAACATCTAATGGAGGGTCAGAAGATCATTAC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 TTTAGATACAGCTACTGAAATTGAAGGCTTATCGACTGGTTGCAAGGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 TTTAGATACAGCTACTGAAATTGAAGGCTTATCGACTGGTTGCAAGGTTT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 ATGCAAATATCGGTGAAGATACTTATGATATAGTGATCCCTGTCAAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 ATGCAAATATCGGTGAAGATACTTATGATATAGTGATCCCTGTCAAAGAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 GACCCTGATGAAGGGGAGGCCAGACTTGAGAATGAAATACCAAAAACGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 GACCCTGATGAAGGGGAGGCCAGACTTGAGAATGAAATACCAAAAACGTC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 TGGCAGCGAGATGGCAAACAAACGTATGAAAGTAAAACATGATGATCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 TGGCAGCGAGATGGCAAACAAACGTATGAAAGTAAAACATGATGATCACT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 ATGAGTTAATAGTAGATGGAAGGGTCTATTATATCTGTATTGTATGCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 ATGAGTTAATAGTAGATGGAAGGGTCTATTATATCTGTATTGTATGCAAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 AGGTCATATGTCTGTCTGACAAGCTTGCGGAGACATTTTAACATTCATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 AGGTCATATGTCTGTCTGACAAGCTTGCGGAGACATTTTAACATTCATTC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 TTGGGAGAAGAAGTATCCGTGCCGTTACTGTGAGAAGGTATTTCCTCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 TTGGGAGAAGAAGTATCCGTGCCGTTACTGTGAGAAGGTATTTCCTCTTG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 CAGAATATCGCACAAAGCATGAAATTCATCACACAGGGGAGCGAAGGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101601 CAGAATATCGCACAAAGCATGAAATTCATCACACAGGGGAGCGAAGGTAT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 CAGTGTTTGGCCTGTGGCAAATCTTTCATCAACTATCAGTTTATGTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101651 CAGTGTTTGGCCTGTGGCAAATCTTTCATCAACTATCAGTTTATGTCTTC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1701 ACATATAAAGTCAGTTCATAGTCAAGATCCTTCTGGGGACTCAAAGCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101701 ACATATAAAGTCAGTTCATAGTCAAGATCCTTCTGGGGACTCAAAGCTTT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1751 ATCGTTTACATCCATGCAGGTCTTTACAAATCAGACAATATGCATATCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101751 ATCGTTTACATCCATGCAGGTCTTTACAAATCAGACAATATGCATATCTT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1801 TCCGATAGATCAAGCACTATTCCTGCAATGAAGGATGATGGTATTGGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101801 TCCGATAGATCAAGCACTATTCCTGCAATGAAGGATGATGGTATTGGGTA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1851 TAAGGTTGACACTGGAAAAGAACCTCCAGTAGGGACCACTACATCTACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101851 TAAGGTTGACACTGGAAAAGAACCTCCAGTAGGGACCACTACATCTACTC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1901 AGAACAAGCCAATGACCTGGGAAGATATTTTTATTCAGCAGGAAAATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101901 AGAACAAGCCAATGACCTGGGAAGATATTTTTATTCAGCAGGAAAATGAT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1951 TCAATTTTTAAACAAAATGTAACAGATGGCAGTACTGAGTTTGAATTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101951 TCAATTTTTAAACAAAATGTAACAGATGGCAGTACTGAGTTTGAATTTAT

   2000     .    :    .
   2001 AATACCAGAGTCTTAC
        ||||||||||||||||
 102001 AATACCAGAGTCTTAC